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ATAC -SEQ分析-BARC
1。预先对准质量控制2。对齐读与基因组3。分配后过滤4。分配后质量控制5。峰（可访问区域）调用6。评估以FRIP评分（与CHIP-SEQ相同）7。峰值的黑名单过滤（与chip-seq相同）
10x 单细胞多组 ATAC + 基因表达测序的细胞核分离方法
- 裂解稀释缓冲液 - 1X 裂解缓冲液 - 0.1X 裂解缓冲液 - 洗涤缓冲液 - 稀释的细胞核缓冲液 II。注意 - 在制备稀释的细胞核缓冲液之前，先将细胞核缓冲液 (20X) 从 -20 中取出，并使其平衡至室温。 - 来自 Chromium Next GEM 单细胞多组 ATAC + 基因表达用户指南 (CG000338) 的转座混合物需要与稀释的细胞核缓冲液同时制备。裂解稀释缓冲液体积 (μL)
通知ATAC 052-2024-医生DB基因组和生物信息学开放
圣保罗大学的哲学，科学和里贝尔·比勒托信的主任将公开向所有感兴趣的政党公开，根据09/26/2024举行的普通会议的说法，将于60（六十）（60天）开放，在9点（Brasíliatime）开始，从04 AT）开放。注册公开招标的标题和测试，以提供01（一）教授的职位，参考MS-3，全面致力于教学和研究，Claro/Claro/Claro/职位，第1245333号，薪水为15,498.97 $ $ 15,498.97（5月/2024年），与生物学领域有关，在基因组和Biiobical和Biiobioics中的知识方面，均为ARTIMICINCINCINCINCINCINCINCINCINCINCINCINC。第125条，USP的一般团的第1段，相应的计划如下：第125条，USP的一般团的第1段，相应的计划如下：
ATAC：一种独特的抗癌新作用模式
本通讯包含与公司业务有关的某些前瞻性陈述，这些陈述可通过前瞻性术语的使用来识别，例如“估计”、“相信”、“预期”、“可能”、“将”、“应该”、“未来”、“潜在”或类似表述，或通过对公司战略、计划或意图的一般性讨论。此类前瞻性陈述涉及已知和未知的风险、不确定性和其他因素，可能导致我们的实际经营业绩、财务状况、业绩或成就或行业业绩与此类前瞻性陈述表达或暗示的任何未来结果、业绩或成就存在重大差异。
组织名称：罗马市政移动公司 SPA
Atac 拥有 100 多年的历史，是罗马的市政公共交通服务机构，也是意大利领先的城市交通运营商，同时也是欧洲最大的当地公共交通公司之一。从历史中心到郊区，Atac 的网络覆盖了约 1,300 平方公里的区域：15 个车间和车辆停车场运营点、8,400 多个公交车、有轨电车和地铁站、320 个地面终端、2,750 个可在整个交通网络上进行非接触式支付的验证器、89,000 个停车位（路边和停车换乘停车场）、2,100 个带数字支付的 Pay&Go 和 Pay&Go+ 停车计费表 - 所有这些都融入了数千年来建立的历史框架中 - 融合成一个复杂的工业和市民服务系统。 Atac 每年运送超过 9.4 亿名乘客（2019 年疫情前数据），其中包括 300 万居民，以及通勤者、城市用户和游客（每年约 3000 万人次）。Atac 拥有约 1.1 万名员工，运营着由 2,300 多辆车辆组成的车队 - 包括公共汽车、有轨电车、无轨电车、电动车和地铁列车。该公司在所有主要社交媒体上都很活跃，其官方网站 atac.roma.it 平均每天有超过 50,000 次访问。
atac-seq套件53150
该套件包含足够的试剂，可以生产16个独特的下一代测序aTacseq库。该套件中的试剂具有多种存储温度。ATAC -SEQ套件在两个温度下运输，在干冰上有一个盒子，将组件存储在-20°C下，第二个盒子在室温下存储在4°C下的组件。请根据以下存储条件存储组件。正确存储后，所有试剂均可自从收到之日起6个月稳定。
海德堡制药：领先 ADC 候选药物 HDP-101 的新临床数据有望在 2024 年 ASH 年会上公布
海德堡制药公司使用多种化合物，并建立了一个 ADC 工具箱，该工具箱通过多种途径克服肿瘤耐药性，并使用各种抗体治疗不同类型的癌症。目标是开发针对性强的 ADC，用于治疗各种恶性血液肿瘤和实体肿瘤。海德堡制药公司是第一家将绿色死亡帽蘑菇中的蘑菇毒伞素化合物用于癌症治疗的公司。这种毒素的生物作用机制代表了一种新的治疗方式，并被用作基于蘑菇毒伞素的 ADC 技术（即所谓的 ATAC 技术）中的化合物。它提供了克服治疗耐药性并消除休眠肿瘤细胞的机会，这可能会在癌症治疗方面取得重大进展——即使对于那些不再对其他治疗有反应的患者也是如此。
科学期刊
表观遗传失调已在包括白血病在内的多种癌症中报道。尽管如此，表观遗传读取器帝帝型域在白血病进展和治疗中的作用仍未得到探索。在这里，我们进行了以Tudor结构域为中心的CRISPR屏幕，并确定了SGF29，SGF29是SAGA/ATAC乙酰基转移酶Com-plexes的组成部分，是H3K9乙酰化，核糖体基因表达和白血病的关键因素。为了促进药物开发，我们将CRISPR平铺扫描与复合对接和分子动力学模拟相结合，并提出了一种普遍适用的策略，称为CRISPR-SCAN辅助药物发现（CRISPR-SADD）。使用这种方法，我们确定了一种铅抑制剂，该铅抑制剂有选择地靶向SGF29的Tudor域并证明了针对白血病的功效。此外，我们建议我们研究中使用的结构遗传学方法可以广泛应用于从头药物发现的不同领域。
ASCL1 和 NEUROD1 依赖基因的启动子是 SCLC 细胞中 lurbinectedin 的特定靶点
小细胞肺癌 (SCLC) 是一种恶性神经内分泌肿瘤，预后较差。本文重点研究神经内分泌 SCLC 亚型 SCLC-A 和 SCLC-N，其转录依赖性由 ASCL 1 和 NEUROD 1 转录因子驱动，这些转录因子靶向 E-box 基序以激活高达 40% 的总基因，根据 ATAC 和 H 3 K 27 Ac 标记，这些基因的启动子保持在稳定开放的染色质环境中。海洋因子 lurbinectedin 利用了这一优势，它优先靶向位于转录起始位点下游的 CpG 岛，从而阻止 RNAPII 延长并促进其降解。这消除了 ASCL 1 和 NEUROD 1 及其依赖基因（如 BCL 2 、 INSM 1 、 MYC 和 AURKA ）的表达，这些基因负责相关的 SCLC 致瘤特性（如抑制细胞凋亡和细胞存活）以及其部分神经内分泌特征。总之，我们展示了这些细胞的转录成瘾如何成为它们的致命弱点，以及 lurbinectedin 如何有效地利用这一点作为一种新的 SCLC 治疗手段。
UCLA基因组学技术中心和生物信息学中心
库构造：批量测序：rnaseq rnaseq用rRNA耗竭☐miRNaseq☐chipseq☐chipseq physeq（wgbs）☐甲基甲基（RRBS）☐人wes☐人wes☐小鼠wes☐小鼠wes☐小鼠☐ tcr tcr☐bcr☐fb☐ATAC☐多组件（3'GEX+ATAC）☐ffpe/固定/固定☐bd Rhapsody☐ HD：☐人类全转录分析（WTA）☐小鼠全转录分析（WTA）10x Xenium：☐新鲜的10x Xenium ffpe 10x 10x xenium（用户需要提供面板。): Please specify: ________________________ GeoMx DSP: ☐ Dry Run ☐ hWTA ☐ mWTA ☐ hCTA ☐ Protein Panel (Specify):____ ☐ Other (please specify): ____ CosMx SMI: ☐ Human Universal Panel (1000 genes) ☐ Human Immuno-Oncology (100 genes) ☐ Mouse Neuro Panel (1000 genes) ☐ Human免疫肿瘤蛋白面板（64个蛋白质）☐其他（请指定）：____ stereoseq：stereoseq（1 cm x 1 cm）如果您需要定制的细胞染色抗体，请指定染色的名称和稀释因子：