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在不同组合景观中对机器学习辅助定向进化的评估
2 加州理工学院化学与化学工程部，加利福尼亚州帕萨迪纳 91125，美国 3 加州理工学院工程与应用科学部，加利福尼亚州帕萨迪纳 91125，美国 4 现地址：默克公司，南旧金山，加利福尼亚州 94080 5 现地址：苏黎世联邦理工学院生物系统科学与工程系，Schanzenstrasse 44，4056 Basel 6 主要联系人* 通讯作者：Frances H. Arnold，frances@cheme.caltech.edu Yisong Yue，yyue@caltech.edu 摘要 各种机器学习辅助定向进化 (MLDE) 策略已被证明能比典型的湿实验室定向进化方法更有效地识别高适应度蛋白质变体。然而，对影响 MLDE 在不同蛋白质中表现的因素的了解有限，阻碍了湿实验室活动的最佳策略选择。为了解决这个问题，我们系统地分析了多种 MLDE 策略，包括使用六种不同的零样本预测因子的主动学习和集中训练，涵盖 16 种不同的蛋白质适应度景观。通过用六个属性量化景观导航能力，我们发现 MLDE 在定向进化更具挑战性的景观上提供了更大的优势，尤其是当集中训练与主动学习相结合时。尽管不同景观的优势程度各不相同，但利用不同的进化、结构和稳定性知识来源的零样本预测因子的集中训练在结合相互作用和酶活性方面始终优于随机采样。我们的研究结果为选择蛋白质工程的 MLDE 策略提供了实用指南。关键词组合诱变、定向进化、上位性、适应度预测、机器学习、蛋白质工程、零样本预测因子
在各种 HMI 应用中实现高精度电容式触摸传感器
预计到 2029 年，全球 HMI 市场将以 7.90% 的复合年增长率增长。近年来，随着 HMI 技术的发展，改善 UX（用户体验）和 UI（用户界面）以增加产品价值变得越来越重要。在这样的市场条件下，对电容式触摸传感器的需求日益增长，这种传感器可以根据外壳的设计理念部署在木材或透明丙烯酸等各种材料上作为操作面板，或作为基于 LED 的用户指南以提供易用性。与传统的物理按钮不同，电容式触摸传感器没有弹簧或其他活动部件，因此不易因磨损而发生故障，并可以延长产品寿命。除了产品寿命长之外，操作面板完全平坦且没有缝隙，易于采取措施防尘和防水滴，并增强了清洁和其他维护工作的便利性。该技术以往主要用于要求高功能性和设计性的高端家电，但近年来正在渗透到对清洁度要求较高的低端家电、工业设备、医疗保健设备等。
在各种 HMI 应用中实现高精度电容式触摸传感器
预计到 2029 年，全球 HMI 市场将以 7.90% 的复合年增长率增长。近年来，随着 HMI 技术的发展，改善 UX（用户体验）和 UI（用户界面）以增加产品价值变得越来越重要。在这种市场条件下，对电容式触摸传感器的需求日益增长，这种传感器可以根据外壳的设计理念部署在木材或透明丙烯酸等各种材料上作为操作面板，或作为基于 LED 的用户指南以提供易用性。与传统的物理按钮不同，电容式触摸传感器没有弹簧或其他活动部件，因此不易因磨损而发生故障，并可以延长产品寿命。除了产品寿命长之外，操作面板完全平坦且没有缝隙，易于采取措施防尘和防水滴，并增强了清洁和其他维护工作的便利性。该技术以往主要用于要求高功能性和设计性的高端家电，但近年来正在渗透到对清洁度要求较高的低端家电、工业设备、医疗保健设备等。
使用 CentileBrain 对整个生命周期的大脑形态进行规范建模：算法基准测试和模型优化
Djavad Mowafaghian 脑健康中心，不列颠哥伦比亚省温哥华市，加拿大（R Ge PhD、Y Yu BSc、YX Qi BSc、Yn Fan BSc、S Chen BSc、C Gao BSc、Prof S Frangou MD）；美国纽约州纽约市西奈山伊坎医学院精神病学系（Prof S Frangou、SS Haas PhD、F New MA）；荷兰双胞胎登记处，荷兰阿姆斯特丹自由大学生物心理学系（Prof DI Boomsma PhD）；新南威尔士大学健康脑衰老中心，澳大利亚新南威尔士州悉尼市（Prof H Brodaty DSc）；荷兰阿姆斯特丹自由大学神经基因组学和认知研究中心复杂性状遗传学系（RM Brouwer PhD）；美国马萨诸塞州剑桥市哈佛大学脑科学中心（Prof R Buckner PhD）；英国威尔士卡迪夫大学神经精神遗传学和基因组学中心（X Caseras 博士）；法国波尔多大学神经功能图像小组—神经变性疾病研究所，CNRS UMR 5293（F Crivello 博士）；荷兰鹿特丹伊拉斯姆斯大学伊拉斯姆斯社会与行为科学学院（EA Crone 教授博士）；德国柏林夏洛特医学院精神病学和心理治疗系心智与大脑研究分部（S Erk 医学博士、H Walter 教授博士）；荷兰奈梅亨马克斯普朗克心理语言学研究所语言与遗传学系（SE Fisher 教授博士）；荷兰奈梅亨拉德堡德大学医学中心 Donders 大脑、认知和行为研究所人类遗传学、精神病学和认知神经科学系（B Franke 教授，博士）；美国马萨诸塞州波士顿波士顿儿童医院精神病学和行为科学系（DC Glahn 教授，博士）；德国明斯特大学精神病学和心理治疗系（U Dannlowski 医学博士、D Grotegerd 博士）；德国海德堡大学普通精神病学系实验精神病理学和神经影像学科（O Gruber 医学博士）；亥姆霍兹实验心理学系
评估默西塞德郡塞夫顿市早期教育环境中基于地点的暴力预防方法
默西塞德郡是英国政府拨款建立暴力减少部门的几个地区之一。为了推动默西塞德郡暴力减少伙伴关系 (MVRP) 开展工作的持续发展，利物浦约翰摩尔斯大学 (通过 Zara Quigg 教授) 被委托评估 MVRP 的工作和由 MVRP 资助的选定干预措施，并开展特定研究项目以填补当地知识的空白。其中一个项目是对塞夫顿基于地点的方法进行评估，作为继续努力证明 MVRP 活动的一部分。塞夫顿基于地点的方法的开发和实施旨在为塞夫顿目标病房的早年环境提供“支持菜单”，特别关注在 Covid-19 封锁期间出生婴儿的家庭。其他报告可通过作者或 MVRP 网站获取：
策划和验证普遍适用的引物，以有效地基于ITS2的DNA条形码
对植物物种的快速准确鉴定越来越多地寻求采用分子技术。ITS2区域在DNA条形码中高度评价，因为它的短长度和易于测序，使其成为物种识别的理想候选者。在这项研究中，通过对广泛植物分类群的底漆序列进行细致的分析和比较，我们策划了一系列具有证明普遍性的底漆，能够有效地扩大不同植物物种的ITS2区域。为了验证识别引物的普遍性，我们均采用了硅和体外方法。在计算机分析中涉及生物信息学工具，以评估公共数据库中可用的大量植物DNA序列的底漆结合位点。随后，使用从各种植物标本中提取的DNA样品进行了体外实验，以验证引物的扩增成功。通过这个全面的验证过程，我们确保了选定的引物用于DNA键编码目的的可靠性和适用性。我们发现的重要性在于使用ITS2区域建立了标准化的DNA栏编码方法，这有助于准确而有效的植物物种识别。通过为研究人员提供一组普遍适用的底漆，我们旨在简化底漆选择过程，从而减少实验设计所涉及的时间和精力。该标准化协议促进了DNA条形码研究中的一致性和可重复性，最终促进了我们对植物生物多样性的理解并有助于保护工作。
二价 RSVpreF 疫苗在老年人第二个 RSV 流行季节的疗效
*附加说明：具有 ≥ 3 种症状的 RSV-LRTI：一名参与者的病例同时具有 RSV A+ 和 RSV B+ 拭子样本。这些病例同时包含在亚组 A 和亚组 B 行中。但是，每位参与者都计入 RSV-LRTI 一次。当地实验室的三次阳性 RSV 聚合酶链反应 (PCR) 测试没有亚组信息，因此包含在 RSV-LRTI 计数中，因为没有症状出现后 7 天内可用于中央实验室检测的拭子。具有 ≥ 2 种症状的 RSV-LRTI：三名参与者的病例同时具有 RSV A+ 和 RSV B+ 拭子样本。这些病例同时包含在亚组 A 和亚组 B 行中。但是，每位参与者都计入 RSV-LRTI 一次。当地实验室进行的三次阳性呼吸道合胞病毒 PCR 检测没有亚组信息，但被计入呼吸道合胞病毒 LRTI 的计数，因为在症状出现后 7 天内没有可供中央实验室检测的拭子
2024 年跨尺度成像展示
1. 技术平台内提供的最新成像技术和方法产品（新博士生了解可提供哪些支持的绝佳机会！）， 2. 案例研究重点介绍跨尺度成像主题内技术平台以综合方式开展的跨学科工作 3. 听听我们的特邀演讲嘉宾 – Vicki Gold 博士的演讲，她是埃克塞特大学生命系统研究所的副教授，专门研究涵盖真核和原核生物学的大型分子机器的低温电子显微镜。通过整合单粒子低温电子显微镜、低温断层扫描和分子建模，Vicki 为我们理解细菌 IV 型菌毛驱动的细菌运动做出了重大贡献，这将是她演讲的重点。 4. 供应商可以为技术平台内设备用户提供哪些支持（以及他们最新的技术产品！）