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选择Anabaena sp。 PCC 7938作为火星生物ISRU的蓝细菌模型
预计将在即将到来的12月举行的摘要船员任务。短期住宿后，希望永久存在能够实现大量的科学发现。这将需要为工作人员提供生命支持的消耗品，数量太大而无法从地球进口。这些消耗品的一部分可以在现场生产生物处理，但是不必进口原料。正在考虑的解决方案在于使用重18zotrophic，岩石 - 酸性蓝细菌作为主要生产者：喂养现场自然可用的材料，它们将提供其他生物所需的营养。这个概念最近已经取得了动力，但是由于缺乏贡献团队的一致性，尤其是共享模型有机体，进步会减慢进步。希望解决这个问题，我们介绍了为选择当前模型所做的工作。我们从怀旧家族的预选菌株开始。对Anabaena sp的基因组进行了测序。PCC 7938（唯一尚未可用的人）我们比较了菌株的基因组数据，以确定其相关性并提供对其生理学的见解。然后，我们评估并比较了相关特征：Chie ply，它们利用Martian Regolith营养素的能力，它们对高氯的耐药性（Regolith中存在的有毒化合物）以及作为中学生产者的原料（在这里是异养细菌和较高植物）。这导致选择了Anabaena sp。PCC 7938，我们建议作为模型蓝细菌，用于开发基于火星的Natu-Natu-lal资源。
通过 RNA 引导转座对 Anabaena sp. PCC 7120 进行基因组工程改造
摘要：在基因组工程中，传入 DNA 的整合依赖于分裂细胞产生的酶，这一直是提高 DNA 插入频率和准确性的瓶颈。最近，据报道，使用 CRISPR 相关转座酶 (CAST) 的 RNA 引导转座在大肠杆菌中非常有效且具有特异性。在这里，我们开发了 Golden Gate 载体来在丝状蓝藻中测试 CAST，并证明它在鱼腥藻属菌株 PCC 7120 中有效。含有 CAST 和工程转座子的相对较大的质粒通过使用自杀或复制质粒的结合成功转移到鱼腥藻中。编码靶标前导链但不编码反向补体链的单向导 (sg) RNA 与 sgRNA 中包含的原间隔子相关基序 (PAM) 序列有效。在对两个不同靶位点进行分析的六种病例中，有四种的插入位点位于 PAM 之后正好 63 个碱基处。复制质粒上的 CAST 具有毒性，可用于治愈质粒。在分析的所有六种情况下，只有由从左到右元素的序列定义的转座子货物被插入目标位点；因此，RNA 引导的转座是由剪切和粘贴引起的。没有内源转座子通过暴露于 CAST 酶而重新动员。这项工作为通过 RNA 引导的转座在丝状蓝藻中进行基因组编辑奠定了基础，无论是在培养中还是在复杂群落中。关键词：鱼腥藻、CRISPR 相关转座子 (CAST)、基因组工程、RNA 引导的转座、minion 测序、从头基因组组装 ■ 简介