图1。用户输入区分了BioXP系统上DNA扩增的工作流程。对于所有三个选项,可以使用限制酶来消化产物,以获取放大DNA的线性片段。套件的选择取决于所需的自动化程度。Acceptable inputs are sequence-confirmed plasmid templates that will be amplified on the BioXp system (left), DNA fragments and the appropriate cloning vectors which are subsequently cloned and amplified on the BioXp system (middle), and digital sequences to be synthesized, cloned into user-provided vectors, and amplified on the BioXp system.请注意,对于所有克隆应用,吉布森组装是克隆方法,序列必须具有与吉布森组装兼容的悬垂。
图 1. BioXp 上的 Golden Gate 组装。Golden Gate 组装概览。要克隆的插入 DNA 带有侧翼 GG 酶识别位点(BsaI 和/或 BsmBI),可以作为合成基因片段或 PCR 扩增子(1A)和(1B)或预克隆载体格式(1C)获取。用户可以输入任何具有兼容 GG 突出端(以粉色和紫色显示)的所需目标载体(2)。用户在 BioXp 3250 上输入 96 孔板和 GG 克隆条(4)。GG 克隆产品在 BioXp 运行后作为输出交付(5)。