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显微镜的掩盖自动编码器是细胞生物学的可扩展学习者
为生物搜索中使用的显微镜图像仍然是一个重要的挑战，尤其是对于跨越数百万图像的大规模实验。这项工作探讨了经过越来越较大的模型骨架和显微镜数据集训练时，弱监督的clasifirers和自我监管的蒙版自动编码器（MAE）的缩放属性。我们的结果表明，基于VIT的MAE在一系列任务上的表现优于弱监督的分类器，在召回从公共数据库中策划的已知生物学关系时，相对实现的相对效果高达11.5％。此外，我们开发了一种新的通道敏捷的MAE架构（CA-MAE），该体系结构允许在推理时输入不同数字和通道的图像。我们证明，在不同的实验条件下，在不同的实验条件下，CA-MAE通过推断和评估在显微镜图像数据集（Jump-CP）上有效地概括了，与我们的训练数据（RPI-93M）相比，通道结构不同。我们的发现促使人们继续研究对显微镜数据进行自我监督学习，以创建强大的细胞生物学基础模型，这些模型有可能促进药物发现及其他方面的进步。与此工作发布的相关代码和选择模型可以在以下网址找到：https：//github.com/ recursionpharma/maes_microscopy。
NGSS 生物学教学大纲 当前 2024
● 第 1、2、4 节课由 Guensler 女士共同授课（支持力度加倍） ● 做好精神准备 ● 为 Chromebook 充电，带上您的单元包，带上钢笔/铅笔 ● Canvas 中有一个电子日历，上面有每日作业。每日热身是另一个可以找到夜间作业的地方。 ● 学生大约有 30 分钟的时间在课堂上开始做作业。 ● 未完成的课堂作业将成为家庭作业。 ● 缺失的作业将在成绩册中显示为红色，但您必须完成它才能使红色框消失。晚交一天的作业可获得 5 分中的 2 分或 3 分，晚交一天以上将在单元评估中获得 1 分。单元测试当天是该单元迟交作业的最后一天。 ● 如果您缺席，您有责任查看 Canvas 上的每日热身、日历和模块，以了解课堂上完成了哪些工作。您有与缺席天数相同的天数来补上作业。 ● 课堂最后三十分钟，不要在工作时间之前做课堂作业/家庭作业。● 任何在收集/检查后完成的作业都会被标记为迟交，缺课除外。● 不要在教学时间内做昨天的作业。你会落后 ● 完成工作是为了理解，而不仅仅是为了完成。工作是为了评估。● 如果你犯了错误，错过了作业或截止日期，承认它并找出可以做些什么！● 避免经常缺席；一旦落后就很难赶上。● 对自己改变行为的能力有信心。 ● 注意课堂讲义（所有笔记都发布在 Canvas 上；它们会帮助你完成作业。● 使用 Homelink 关注你的成绩！这是在线的，你（和家人）可以经常查看。如果成绩册中出现任何异常，请礼貌地询问。● 成绩会定期更新，Homelink 和 Canvas 日历中的截止日期是准确的。● 一有麻烦就寻求帮助！！● 上课时只能吃小零食，实验期间不能吃东西。● 手机将处于静音或飞行模式，放在墙上的手机支架上，直到老师在课间结束前指示。上课期间使用的手机将被保留到课间结束（然后发送电子邮件回家）。● 除非老师指示，否则禁止使用 Air Pods/耳机。
M.Sc. （分子生物学与生物技术）（AY 2023-24）M.Sc. （分子生物学与生物技术）（AY 2023-24）
V.实践•良好的实验室实践，缓冲液和试剂的准备。•离心和分光光度计原理。•细菌培养的生长和生长曲线的制备，从细菌中分离基因组DNA。•从细菌中分离质粒DNA。•lambda噬菌体的生长和噬菌体DNA的分离。•植物DNA的隔离和限制（例如大米 /月光 /芒果 / Merigold）。•通过（a）琼脂糖凝胶电泳和（b）分光光度法•使用分离的DNA定量DNA。•pagegel电泳。•质粒和噬菌体DNA，结扎，重组DNA构建的限制消化。•大肠杆菌的转化和转化体的选择•色谱技术a。 TLC b。凝胶过滤色谱法，c。离子交换色谱法，d。亲和色谱•点印迹分析，南部杂交，北部杂交。•Western印迹和Elisa。•辐射安全性和非拉迪奥同位素程序。
BIOS 11174生物学研究经验
在许多情况下，在许多情况下，物种的生存率将受到土地利用，气候和大气化学改变的前所未有的组合的影响。预期这些趋势很困难，但是洞察力可能来自人口对过去的环境扰动的反应。麦克拉克兰实验室（McLachlan Lab）收集了人口变化的记录，并使用数学模型将其与环境和生物过程联系起来，这些模型将居住在大西洋盐沼泽（Schoenoplectus americanus）的基础植物物种（Schoenoplectus Americanus）连接到改变环境变量（盐度，洪水，洪水和大气CO 2）。令人难以置信的是，美国链球菌的种子可以追溯到150年，仍然可行，这些独特植物的克隆在温室实验中已经传播。遗传实验已经确定并证实了这些“复活”植物是目前在盐沼中发现的植物的不同基因型。因此，该实验室对可以追溯到一个世纪以来的环境变化的进化反应有连续的记录。
CBSE类12生物学注释第11章生物技术
1。复制的起源（ORI）：从中开始复制的序列。当DNA链接到该序列时，它可以在宿主细胞中复制，从而控制链接的DNA的拷贝数。2。可选标记：这有助于通过编码对抗生素（例如氨苄西林或四环素）的抗性来识别和选择转化的细胞。这些标记被用来区分非转化剂和转化剂，从而确保只有重组DNA的细胞存活。3。克隆位点：插入异物DNA需要限制酶的单个识别位点。多个限制位点可以生成使克隆过程复杂化的片段。外源DNA的插入通常会破坏一种抗生素抗性基因之一，有助于鉴定成功的重组剂。4。插入灭活：该技术用于识别重组质粒。当插入异物DNA片段时，它会破坏基因的编码顺序，例如蓝白选择过程中的Lac Z基因。重组菌落由于lac z基因的失活而显得白色，而非重组剂显得蓝色。5。植物和动物的载体：在植物中，细菌农杆菌tumefaciens提供T-DNA，转化植物细胞并将其修改为肿瘤细胞。ti
CSE7850/CX4803计算生物学中的机器学习
描述此研究生级课程的重点是机器学习与计算生物学之间的令人兴奋的交集。我们将涵盖现代机器学习技术，包括受监督和无监督的学习，特征选择，概率建模，图形模型，深度学习等。学生将学习这些方法的基本原则，基本的数学和实施细节。通过阅读和批评发表的研究论文，学生将学习机器学习方法在基因组学，单细胞分析，结构生物学和系统生物学中的各种生物学问题上的应用。学生还将通过深入的编程作业使用Pytorch学习使用Pytorch来实施深度学习模型。在最终项目中，学生将通过以生物学问题探索这些概念来应用他们所学的知识，以充满热情。
样本问题纸类XII 044生物学（2024-25）
（i）假设，GPP森林A = GPP森林B = GPP森林C，如果森林A的npp = 1254 J /m 2 /天；森林B，npp = 2157 J /m 2 /天；和森林C，npp = 779 J /m 2 /天，其中哪个森林通过呼吸而具有最大的能量损失？给出理由。（ii）画出以下食物链数量的生态金字塔a。草 - 动物 - 宿主动物上的流量b。树 - 昆虫 - 啄木鸟
生物学101生物学原理i
BIO 101为学生提供了生物学基本原理的介绍。本课程涵盖了生命的基础：细胞，大分子，能量流，遗传学和遗传，进化和生物多样性以及生态学。（先决条件：Biol 101L）