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人类甲基化和非甲基化DNA集
产品描述人类甲基化和非甲基化的DNA集由两个对照DNA（非甲基化和甲基化）以及一组特定设计的引物，可与EZ DNA甲基化 - 甲基化 - 光点™结合使用，EZ DNA甲基化 - ez DNA甲基化基因甲基化基因甲基化基因，EZ DNA甲基化基因， Zymo研究以评估DNA的亚硫酸含量转化的效率。从包含DNA甲基转移酶DNMT1（ - / - ）和DNMT3B（ - / - ）1的细胞中纯化了人类HCT116 DKO非甲基化DNA。源自HCT116 DKO细胞的DNA具有低水平的DNA甲基化，可用作DNA甲基化分析的对照（图1）。人类HCT116 DKO甲基化的DNA被纯化为HCT116 DKO DNA，并且已在所有胞质位置进行了酶甲基化，该位置包括M.SSSI甲基转移酶2的CG二核苷酸，并可以用作DNA甲基化分析的阳性对照。在亚硫酸盐处理后，甲基化的胞嘧啶仍未转化（在哺乳动物中，胞嘧啶甲基化主要发生在CPG的情况下），而PCR后，非甲基化的胞嘧啶被转化为尿嘧啶并被检测为胸骨。DAPK1控制引物扩增了与死亡相关蛋白激酶1（DAPK1）基因的甲基化，非甲基化和混合甲基化拷贝，并用于在甲硫酸盐转化对照DNA后用于使用。恢复的DNA非常适合许多应用，包括下游分析，例如PCR，限制性核酸内切酶消化，测序等。
大肠杆菌非甲基化基因组 DNA
产品描述 大肠杆菌非甲基化基因组 DNA 包含从 Dam – 和 Dcm – 的 K-12 大肠杆菌菌株中纯化的 DNA。它非常适合用作 DNA 甲基化分析的阴性对照，该分析需要完全没有甲基化的 DNA。该标准还可以在下一代测序文库制备过程中加入实验样品或与实验样品并行运行，以监测亚硫酸盐转化效率和/或工作流程性能。如果用作原位加入对照，大肠杆菌菌株 K-12 亚菌株 MG1655 的参考基因组可用于比对和分析。可通过以下网址访问：https://www.ncbi.nlm.nih.gov/genome/167?genome_assembly_id=161521 推荐用法 大肠杆菌非甲基化基因组 DNA 可用作亚硫酸盐转化和下游分析的对照，例如亚硫酸盐 PCR、甲基化测序应用、原位加标对照、甲基化测定校准等。 协议 大肠杆菌非甲基化基因组 DNA 是高度完整的基因组 DNA。为了获得最佳结果，在定量和使用前确保 DNA 完全同质且完全溶解非常重要。量化和使用前建议执行以下步骤 1：
NHANES 1999-2000和2001-2002 DNA甲基化阵列和表观遗传学生物标志物数据文档NHANES 1999-2000和2001-2002 DNA甲基化阵列和表观遗传学生物标志物数据文档
DNA，并将标本存储在-80°C下。DNAM分析是在杜克大学Yongmei Liu博士的实验室进行的。Bisulfite的转化。500ng的DNA。数据是在Illumina Infinium甲基化甲基甲基甲虫v1.0上产生的（CAT＃WG317-1001，Illumina，Illumina，San Diego，CA，美国）。使用制造商方案将总共4 µL的硫酸硫酸硫酸含量转换为DNA与Illumina Beadchip杂交。样品被变性并放大过夜20-24小时。样品的碎片，沉淀和重悬于过夜孵化之后，然后与史诗般的珠奇普杂交16-24小时。然后洗涤珠奇普，以去除任何未脑的DNA，并用核苷酸标记以将引物扩展到DNA。按照Infinium HD甲基化协议，使用Illumina Iscan系统（Illumina，Illumina，San Diego，CA，USA）对珠奇普进行成像。
McGill应用基因组创新核心（魔术）
CORES ACTIVITY TECHNOLOGY / ACTIVITY Production Genomics Whole Genome Sequencing Illumina NovaSeq Exome / Targeted Capture Sequencing Illumina NovaSeq Whole Genome Bisulfite Sequencing (WGBS) Illumina NovaSeq RNA-Seq / miRNA-Seq Illumina NovaSeq ChIP-Seq, ChIPmentation, ATAC-Seq Illumina NovaSeq Expression Arrays / Genotyping Illumina iScan / Affymetrix Genetitan
武装部队医学院...
11。COMT和BDNF多态性在酒精依赖综合征中的关联。 心理健康和物质使用12。 使用整个基因组亚硫酸盐测序及其验证的SLE患者的SLE患者的差异DNA甲基化模式。COMT和BDNF多态性在酒精依赖综合征中的关联。心理健康和物质使用12。使用整个基因组亚硫酸盐测序及其验证的SLE患者的SLE患者的差异DNA甲基化模式。
动态二人组合avida目标富集
在Agilent Avida的新目标富集方法的核心是一种互锁的三维结构，设计用于与常规混合捕获方法相比，DNA靶标的协同，间接捕获DNA靶标的DNA靶标相比提供了出色的均匀性，特异性和结合速度。至关重要的是，该方法允许在扩增和硫酸盐转化之前进行目标捕获，从而消除了与现有目标富集方法相关的常见问题，例如PCR偏见和费力的工作流程。
指南 - 如何选择收集解决方案
与petrifilm一起工作时，含有甲硫酸盐，柠檬酸盐和硫代硫酸盐。4）可能是由于中和缓冲液中存在芳基磺酸盐复合物。5）EAFUS-美国添加的所有东西（美国FDA）6）含有未知过敏性的芳基磺酸盐络合物。7）letheen肉汤含有卵磷脂。卵磷脂通常源自大豆或鸡蛋。8）含有来自牛奶和卵磷脂的肽，通常源自大豆或鸡蛋。9）包括蔬菜蛋白质（未用动物衍生的Ensymes消化）和
保护生物学家的表观遗传工具箱
图 2 检测表观遗传修饰的主要工具，重点是 DNA 甲基化。各种方法为基因调控、发育、疾病和进化提供了见解。图标从图例的左到右表示：黑色背景上用粉色表示的基因组覆盖率（一个或多个基因组位置、部分基因组或全基因组）；估计成本（从一袋钱：低成本到三袋钱：昂贵）；单碱基分辨率、可能导致 DNA 降解的亚硫酸盐处理和复杂的生物信息学分析的图标表示该技术的具体优点或缺点。
epiGBS 与 WGBS 结果比较
DNA 胞嘧啶甲基化是一种表观遗传机制，参与调节植物对生物和非生物胁迫的反应，其改变能力随胞嘧啶出现的序列环境（CpG、CHG、CHH，其中 H = 腺嘌呤、胸腺嘧啶、胞嘧啶）而变化。模型植物物种中的 DNA 甲基化定量通常通过全基因组亚硫酸盐测序（WGBS）进行，这需要高质量的参考基因组。精简代表性亚硫酸盐测序 (RRBS) 是一种经济有效的潜在替代方案，适用于基因组资源有限且实验设计规模大的生态研究。在本研究中，我们首次全面比较了 RRBS 和 WGBS 的输出，以表征 DNA 甲基化对给定环境因素的反应变化。具体而言，我们使用 epiGBS（最近优化的 RRBS）和 WGBS 来评估 Populus nigra cv. 无性系中昆虫和人工食草后的整体和序列特异性差异甲基化。 'italica'。我们发现，在两种食草处理中的任何一种之后，CHH 中的全局甲基化百分比都会增加，并且只有 epiGBS 检测到这种转变具有统计学意义。至于食草引起的位点特异性差异甲基化（epiGBS 中的胞嘧啶和 WGBS 中的区域），两种技术都表明昆虫和人工食草引起的反应具有特异性，并且 CpG 中的低甲基化和 CHH 中的高甲基化频率更高。当存在于 CpG 和 CHG 中时，甲基化变化主要发现在基因体和基因间区域，而在 CHH 环境中则发现在转座因子和基因间区域。因此，epiGBS 成功地表征了伦巴第杨对食草反应的全局全基因组甲基化变化。我们的研究结果支持 epiGBS 在旨在探索非模型植物物种对多种环境因素反应的表观遗传变化的大型实验设计中特别有用。