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World File Search SystemBurkholderia
Burkholderia的差异遗传策略
摘要Burkholderia越南语LMG10929和Paraburkholderia Kururiensis M130是细菌大米生长促进模型。除了这种常见的生态莱基外，伯克霍尔德属的物种也被发现为机会性人类病原体，而帕拉伯克霍顿物种大多是环境和植物构成的。在这项研究中，我们比较了越南芽孢杆菌和库里氏芽孢杆菌使用的遗传策略，以定居其共同宿主的两个亚种Oryza sativa subsp。japonica（cv。nipponbare）和O. sativa subsp。indica（cv。ir64）。我们使用了转座子插入突变库文库（TN-SEQ）的高吞吐量筛选来推断哪些遗传元件在接种后7天后在根表面定植期间具有最高的效果。总的来说，我们在越南芽孢杆菌中检测到的基因比库里林斯假发疟原虫的基因多两倍，其中包括促进植物防御能力的基因，这表明越南芽孢杆菌的不良反应比越南b。越南人比对kuriensisp。kuriensis的不利反应。对于这两种菌株，与japon-ica相比，在定植Indica水稻时，细菌耐性取决于较高的基因。宿主对细菌适应压力的这些分歧可能部分与品种氮同化的差异有关。我们检测到了两种细菌菌株中的根定植的功能，例如entner-doudoroff（ed）糖酵解。在特定方面的频率较低，较多的菌株中，我们检测到限制了根定植的功能，例如越南芽孢杆菌中的生物膜产生和库鲁里氏菌中的法定感应。通过TN-SEQ程序鉴定的基因参与是有助于根定植的，即ED途径，C-DI-GMP循环和钴胺素合成，通过定向的诱变和野生型（WT）菌株的竞争来验证。
使用Burkholderia物种的黑胡椒（Piper nigrum）中的植物蛋白酶辣椒的生物控制
背景和目标：Phytophthora capsici是一种毁灭性的病原体，在全球黑胡椒（Piper nigrum）中造成显着的产量损失。鉴于对化学杀菌剂的环保替代品的需求日益增加，这项研究着重于评估从曼色和印度尼西亚Sukamulya的黑胡椒根源中分离出的根瘤菌的拮抗特性。 目的是建立可持续的管理方法来解决植物圆锥形的问题。 方法：使用双重培养测定法筛选了总共520种根瘤菌分离株，以评估其对植物膜的拮抗活性。 随后分析了表现出明显的抑制作用的分离株，径向生长的降低超过70％，以了解其作用机理，其中包括酶的产生和挥发性有机化合物的排放。 冷冻场发射扫描电子显微镜用于研究对植物辣椒菌丝菌丝体的形态影响。 进行了进行生物安全测定，以评估溶血活性和过敏反应诱导。 使用16个小的亚基核糖体脱氧核糖核酸测序进行分子鉴定。 进行了温室环境中的试验，以确定黑胡椒植物中鉴定出的分离株在缓解脚部腐烂疾病中的生物防治有效性。 的发现：在520个分离株中，有37个显示拮抗活性，十个分离株抑制了超过70％的植物囊膜径向径向生长。鉴于对化学杀菌剂的环保替代品的需求日益增加，这项研究着重于评估从曼色和印度尼西亚Sukamulya的黑胡椒根源中分离出的根瘤菌的拮抗特性。目的是建立可持续的管理方法来解决植物圆锥形的问题。方法：使用双重培养测定法筛选了总共520种根瘤菌分离株，以评估其对植物膜的拮抗活性。随后分析了表现出明显的抑制作用的分离株，径向生长的降低超过70％，以了解其作用机理，其中包括酶的产生和挥发性有机化合物的排放。冷冻场发射扫描电子显微镜用于研究对植物辣椒菌丝菌丝体的形态影响。进行生物安全测定，以评估溶血活性和过敏反应诱导。分子鉴定。试验，以确定黑胡椒植物中鉴定出的分离株在缓解脚部腐烂疾病中的生物防治有效性。的发现：在520个分离株中，有37个显示拮抗活性，十个分离株抑制了超过70％的植物囊膜径向径向生长。孤立的Burkholderia物种表现出最高的抑制作用，为87.59％，通过酶产生和挥发性有机化合物排放介导。冷冻场发射显示出卵巢菌菌丝体的形态异常，例如裂解和衰退。八个有效的分离株表现出非溶血性能，并未引起烟叶中的超敏感反应，从而证实了它们用于生物防治目的的适用性。生理表征揭示了这些分离株的几丁质酶，葡萄糖酶和蛋白酶的产生。分子鉴定分类的Burkholderia物种已知的生物防治剂。温室试验表明，伯克霍尔德（Burkholderia）物种大大降低了脚部腐烂疾病的发生率，强调了其控制植物膜的潜力。结论：发现的结论表明，伯克霍尔德物种可以作为一种有效且环保的生物控制剂，可显着降低植物膜状的感染。本研究鼓励采用可持续的农业技术，并突出了生物控制在综合疾病管理系统中的作用，目的是最大程度地减少环境伤害并降低对化学投入的依赖。
噬菌体疗法治疗囊性纤维化伯克霍尔德菌复合肺部感染：前景与挑战
1 西澳大利亚大学健康与医学科学学院生物医学科学学院感染与免疫学部，西澳大利亚州内德兰兹，澳大利亚，2 西澳大利亚大学儿童研究所澳大利亚沃尔-扬呼吸研究中心，西澳大利亚州内德兰兹，澳大利亚，3 科廷大学人口健康学院，西澳大利亚州本特利，4 西澳大利亚大学马歇尔中心生物医学科学学院感染与免疫学部，西澳大利亚州珀斯，澳大利亚，5 珀斯儿童医院呼吸与睡眠医学系，西澳大利亚州内德兰兹，澳大利亚，6 西澳大利亚大学医学与药理学学院细胞治疗与再生医学中心和哈里·珀金斯医学研究所，西澳大利亚州内德兰兹
属属ruminococcus and Order_burkholderiales通过调节微生物群轴
方法：我们使用开放式基因组关联研究（GWAS）数据（GWAS）对肠道微生物和骨质疏松症的数据进行了分析。使用两样本MR分析进行分析，并通过逆差异加权（IVW），EGGER，EGGER，加权中位数和加权模式方法检查因果关系。双侧卵形切除术被用于复制小鼠骨质疏松模型，该模型通过微计算机断层扫描（CT），病理测试和骨转化指数评估。此外，在粪便样品上进行了16S rDNA测序，而在结肠样品中检查了IL-6，IL-1β和TNF-α炎症因子的SIGA和索引。通过免疫荧光和组织病理学，评估了紧密连接蛋白的表达水平，例如Claudin-1，ZO-1和occludin，并对差异细菌和相关环境因素进行了相关性分析。
诱发的Burkholderia预言从血管培养中检测到的预言：Burkholderia pseudomallei感染的生物标志物
噬菌体（噬菌体），感染细菌的病毒，不仅在环境中而且在人体中也有很多。使用噬菌体来诊断黑梅利病（由Burkholderia pseudomallei引起的一种热带传染病）正在成为一种有希望的新方法，但是我们对可引起Burkholderia预测的条件的理解仍然有限。在这里，我们首先证明了Burkholderia噬菌体与黑胶病患者血统的分离。将B. pseudomallei阳性血培养瓶过滤以去除细菌，然后通过斑点和双琼脂叠加斑块分离并纯化噬菌体。测试了四十个血液样本（血培养的黑胶病），并在30％的样品中发现了噬菌体。透射电子显微镜和分离的噬菌体的基因组分析VB_HM387和VB_ HM795表明，这两个噬菌体都是肌病毒。这两个噬菌体在5-7的pH值下稳定，温度为25-37°C，表明它们在人类血液中生存的能力。VB_HM387和VB_HM795的基因组大小分别为36.3和44.0 kb。系统发育分析表明，VB_HM387具有同源物，但VB_HM795是一种新型的肌瘤病毒，表明梅尔克霍尔德（Burkholderia phages）在Melioidisoise患者中的异质性。可以从黑麦病病患者的血液中分离出Burkholderia噬菌体的关键发现，突显了基于噬菌体的测定的潜在应用，通过检测血液中的噬菌体作为病原体衍生的感染生物标志物。
通过冻结转化重新组合burkholderia pyrrocinia中高度GC富含GC的基因
fi g u r e 1使用质粒PHKT2，Burkholderia pyrrocinia jk-Sh007的转化。（a）热震动转换。通过热震动方法将质粒PHKT2转移到B.吡咯骨JK-SH007中。（b）冻融变换。通过冻融转化方法将质粒PHKT2转移到吡咯骨JK-SH007中。（c）在包含甲氧苄啶（TMP）的板上测试转换。左，B。tyrrociniajk-sh007;对，含有质粒PHKT2的吡咯烷JK-SH007。（d）在含有氨苄青霉素的板上转换的测试。左，B。tyrrociniajk-sh007;对，含有质粒PHKT2的吡咯烷JK-SH007。（e）浓度对转化的影响。（f）OD 600的统一细胞对转化的影响。所有实验均在三个生物学重复中进行。数据作为三个重复±SD
伯克霍尔德菌选择性琼脂
伯克霍尔德菌琼脂以 PC 培养基为基础，该培养基最初由 Gilligan 发明。研究发现，这种培养基比麦康凯琼脂更适合伯克霍尔德菌的生长。培养基中的酪蛋白糖和酵母提取物提供碳、氮、长链氨基酸、维生素 B 源和其他必需营养素。结晶紫和抗菌剂用作选择剂。结晶紫和万古霉素可抑制革兰氏阳性球菌，包括肠球菌和葡萄球菌。多粘菌素 B 和庆大霉素等抗生素可抑制革兰氏阴性细菌。伯克霍尔德菌代谢丙酮酸形成碱性终产物。蔗糖和乳糖是可发酵碳水化合物。酚红指示剂在碱性 pH 下从粉橙色变为粉红色。如果出现带有黄色晕圈的绿褐色菌落或被粉红色区域包围的白色菌落，则可能存在伯克霍尔德菌。