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World File Search SystemBurkholderia
引言根际细菌对商业重要作物的植物生长和生产力的积极影响通常称为
INTRODUCTION Rhizosphere bacteria that positively influence plant growth and productivity of commercially important crops are commonly referred to as Plant Growth Promoting Rhizobacteria (PGPR) and include bacteria of the genera Azotobacter, Azospirillum , Arthrobacter, Bacillus, Agrobacterium, Rhizobium, Flavobacterium, Burkholderia, Enterobacter,克莱伯斯ella，假单胞菌，xanthomonas和serratia。根渗出液的分泌有助于调节微生物动力学及其与植物的相互作用，进而在促进植物生长中起着重要作用。此外，根际中的这种共生相关性还赋予对由真菌，细菌和病毒病原体引起的各种疾病的保护。这些细菌直接通过使用刺激性生长素和细菌的组合或通过刺激性生长素和细菌的形式组成的刺激性的生长素，gibberellins和componial compan和compoa，并通过刺激性的生产力和细菌来通过刺激性的生长蛋白和胞质的组合来直接影响植物的生长和分泌。 N.I.K.al-Barhawee和F.A.al-Wazzan。2025。从新分子表征的根瘤菌菌株中产生吲哚-3-乙酸的估计。农业科学全球创新杂志13：85-94。[2024年9月2日收到； 2024年10月6日接受；出版于2025年1月1日]
确定健康狗眼睛结膜中的微生物多样性，以完成DNA的完整测序
摘要：连接性在眼部健康和免疫中起着基本作用，并充当了微生物进入的障碍。结膜感染在狗中很常见，并且导致致病性微生物的侵袭和现有微生物的不受控制的生长。大多数现有数据来自基于传统文化方法的研究。这些报告表明革兰氏阳性细菌的占主导地位，主要是葡萄球菌属。本研究分析了由于DNA测序而导致的，没有眼科疾病的狗的眼睛结膜中存在的微生物群落。在彻底的眼科检查后，从30只狗的两只眼睛中收集了结膜。在处理和提取核酸后，样品池通过Illumine平台进行DNA shot弹枪进行分割，并使用子系统技术（MG-RET）服务器对元基因组快速注释进行了分析。在没有发现病毒的情况下，发现了蛋白质细菌和类型Ralstonia和Burkholderia的占主导地位。微生物DNA测序带来了有关该受试者的新数据，揭示了迄今为止作为眼微生物组一部分的非可培养生物的存在。
猪精液中耐多药细菌的生长动态和杀精作用阈值
摘要：本研究的目的首先是检查在为期七年的精液监测计划中，精子质量下降与细菌相关的普遍性，其次是研究四种不同的耐多药细菌的生长动态及其对精液储存期间精子质量的影响。在来自精子中心的 3219 个样本中，0.5% 的样本因细菌污染而导致精子质量下降。在添加了粘质沙雷氏菌和产酸克雷伯氏菌的样本中，在 17 ◦ C 的温度下储存时，细菌生长了六个对数级，导致精子活力、膜完整性、膜流动性和线粒体膜电位丧失，>10 7 CFU/mL（p < 0.05）。在 5 ◦ C 的 Androstar Premium 稀释剂中储存可有效抑制它们的生长。木糖氧化无色杆菌和洋葱伯克霍尔德菌在 17 ◦ C 下生长受限，最高可达两个对数级，且不会损害精子质量。总之，精子可以耐受中等量的耐多药细菌，低温、无抗生素的精液储存可有效限制细菌生长。应重新考虑在精液稀释剂中持续使用抗生素。
保守的DNA甲基转移酶：细菌表观遗传调节基本机制的窗口
越来越多的研究报告说，细菌DNA甲基化具有重要的功能，超出了其在限制性修饰系统中的作用，包括影响临床相关的表型，例如毒力，宿主定殖，孢子孢子，生物膜形成等。尽管有洞察力，但此类研究在很大程度上具有临时的性质，并且将从系统的策略中受益，从而实现微生物学界对细菌甲基瘤的联合功能表征。在这种意见中，我们建议高度保守的DNA甲基转移酶（MTases）代表了细菌表观基因组学研究的独特机会。这些MTases在细菌中很常见，跨越各种分类法，并且存在于多种人类病原体中。除了具有良好特征的核心DNA MTase，例如来自Vibrio Cholera，Salmonella Enterica，梭状芽胞杆菌艰难梭菌或化脓性链球菌的核心MTase，在许多人类病原体中也发现了多个高度保守的DNA MTase，其中包括属于Burkholderia属的人和阿科氏菌。我们讨论了为什么以及如何优先考虑这些MTase，以使社区范围内的综合方法进行功能基氏症研究。最终，我们讨论了一些高度保守的DNA MTases如何成为开发新型表观遗传抑制剂以用于生物医学应用的有希望的靶标。
SLAS发现
巨噬细胞感染增强剂（MIP）蛋白属于免疫蛋白超家族。这类enzemes催化了含脯氨酸肽键的顺式和反式配置之间的互连。MIP已被证明对于多种致病性微生物的毒力很重要，其中包括革兰氏阴性细菌burkholderia pseudomallei。源自天然产物雷帕霉素的小分子缺乏免疫抑制诱导的部分，抑制了MIP的肽基 - 蛋白基蛋白CIS-反式异构酶（PPI-ASE）活性，并导致病原体负荷降低体外。在这里，建立了荧光偏振分析（FPA），以实现BPMIP抑制剂的筛选和有效发展。荧光探针，该探针源自先前用荧光素标记的旧MIP抑制剂。该探针在BPMIP中显示出适度的功能，并启用了适合筛选具有中等至高通量（Z因子〜0.89）的大型化合物文库的高度鲁棒的FPA，以识别有效的新抑制剂。FPA结果与蛋白酶耦合PPIASE分析的数据一致。对探针结合的温度依赖性的分析表明，BPMIP的配体结合是由焓而不是熵效应驱动的。这对使用低温动力学测定有很大的影响。
高通量微量滴定板筛选测定法，以量化和区分双物种生物膜中的物种
摘要：致病性细菌在感染过程中形成生物膜，而多生物生物膜是最常见的表现。生物膜附着，成熟和/或抗生素敏感性主要通过微量滴定板测定进行评估，其中将细菌染色以通过光吸光度或荧光发射来实现生物量的定量。但是，目前不可能使用这些方法在双物种或多种物种生物膜中区分不同物种。菌落形成单位从选择性琼脂培养基上的均质双物种生物膜计数允许物种分化，但在高通量筛选方面很耗时。因此，迫切需要使用可靠，可行和快速的方法来研究多种物种和双物种群落的行为。这项研究表明，铜绿假单胞菌和Burkholderia cenocepacia菌株表达了特定的荧光或生物发光蛋白，与依赖于测量总生物群的其他方法相比，双重物种生物纤维的有效研究更加有效。结合荧光和生物发光测量值可以独立地分析生物膜内不同微生物物种，表明在双物种生物膜生长期间，每个人的存在程度随着时间的流逝而存在。这项工作中开发的定量策略是可重现的，建议使用可以组成构成表达泛光或生物发光蛋白的菌株进行高通量微量液板方法的生物膜研究。
多功能微生物在玉米作物中的应用
摘要 - 在土壤微生物组的组成中，有许多能够促进植物生长的微生物，它们被称为植物生长促进微生物。这项研究的目的是确定多功能微生物单独或组合使用对玉米植株的地上部、根部和总生物量生产、气体交换、常量营养素含量、产量成分和谷物产量的影响。该实验在温室中以完全随机设计进行，重复四次。26 个处理包括用根际细菌芽孢杆菌属（BRM 32109、BRM 32110 和 BRM 63573）、伯克霍尔德菌（BRM 32111）、假单胞菌属（BRM 32112）、粘质沙雷氏菌 BRM 32113、沙雷氏菌属对玉米种子进行单独或组合微生物化。 （BRM 32114）、巴西固氮螺菌（Ab-V5）和固氮螺菌属（BRM 63574）、从真菌 Trichoderma koningiopsis（BRM 53736）中分离的菌株以及对照处理（未施用微生物）。在第 7 天和第 21 天，分别在土壤和植物中再施用两次相同的处理。单独或组合施用的微生物可显著提高玉米植物生物量 49%、气体交换 30%、常量营养素含量 36% 和谷物产量 33%。分离物 BRM 32114、Ab-V5、BRM 32110 和 BRM 32112 以及组合 BRM 32114 + BRM 53736、BRM 63573 + Ab-V5 和 BRM 32114 + BRM 32110 为玉米带来了更好的效益，这使我们推断出使用有益微生物会显著影响玉米植株的发育。关键词：根瘤菌。真菌。共接种。产量。玉米。
引用：Najomtien，P.，Phoksawat，W.，Khammanthoon，S.，Klasuk，W.，Srisurat，N.，Chattagul，S.，Photisap，C.，Pipattanaboon，C.
经验较低的人可能无法将假单胞菌与其他密切相关的假单胞菌属分化。或Burkholderia spp。此外，培养方法至少需要3-7天才能确定可能为时已晚的细菌，并且共同感染或污染可能是一个很大的障碍，因为B. pseudomallei的生长非常慢。5–7因此，对于患者，尤其是在败血症病例中，早期识别和治疗是必需的。血清学技术已经开发出用于诊断黑凝集病（例如间接血凝（IHA），免疫荧光测定法（IFA）和酶连接的免疫吸收测定法（ELISA）的血清学技术。这些具有敏感性和特异性的方法尚未开发用于早期诊断。8–10已经开发了一种分子技术聚合酶链反应（PCR），但由于其直接检测血液中的假单胞菌的敏感性较低，因此并非常规实践。11横向流动式插电（LFD）是一种检测方法，可以在5-10分钟内通过裸眼来读取作为护理点测试（POCT），不需要特殊的训练。2014年，Raymond L.等。报道了使用B. pseudomallei Capsular多糖（CPS）作为临床患者样品检测的抗原的原型LFD分析的原型。这些技术的特异性高达97.2％（35/36），检测极限与ELISA在0.2 ng/ml时相当。12，当使用临床样品时，它给出了低灵敏度。开发了几种用于检测假子芽孢杆菌的PCR分析，需要3-6小时。对于常规诊断而言，结果并不令人印象深刻。11 div>
文章 嵌合化可实现基因合成和可定制 TALE 效应的慢病毒递送
摘要：基于黄单胞菌转录激活因子样效应 (TALE) 的 DNA 结合结构域 (DBD) 的设计效应是强大的序列特异性工具，因其在编辑基因组、转录组以及最近的表观基因组方面的特异性而享有盛誉。然而，组成 DBD 的 TALE 阵列的重复结构阻碍了它们作为基因合成产物的生成，并阻止了使用慢病毒载体 (LV)（一种广泛用于人类基因治疗的系统）递送基于 TALE 的基因。为了克服这些限制，我们旨在通过引入足够的多样性来嵌合编码 TALE-DBD 的 DNA 序列，以促进它们的基因合成和实现慢病毒递送。为此，我们用来自细菌伯克霍尔德菌的 TALE 样单元替换了 17 个黄单胞菌 TALE 重复序列中的 3 个。这与整个 DBD 中的广泛密码子变异和特定氨基酸替换相结合，以最大限度地提高重复序列内和重复序列间的变异性。我们证明，使用传统的 Golden Gate 克隆策略或基因合成可以轻松生成嵌合 TALE。此外，嵌合化使得使用慢病毒载体递送基于 TALE 的设计核酸酶、转录组和表观基因组编辑器成为可能。当以质粒 DNA 递送时，靶向 CCR5 和 CXCR4 基因座的嵌合 TALE 在人体细胞中显示出类似的活性。然而，基于 TALE 的转录激活因子的慢病毒递送仅在嵌合形式下才成功。同样，递送嵌合的 CXCR4 特异性表观基因组编辑器会导致内源性 CXCR4 表达快速沉默。总之，基于 TALE 的 DBD 的广泛密码子变异和嵌合使得设计 TALE 的生成和慢病毒递送变得简单，因此有利于这些工具的临床应用，以精确编辑基因组、转录组和表观基因组。
134从土壤中隔离和鉴定细菌...
纺织品和制革厂废水污染的抽象土壤污染是环境的一个极大关注，复杂的废水在土壤中积聚了许多染料，通过污染环境和土壤中微生物物种的损失。样品，并确定物理化学分析。pH是基本的，分别来自制革厂和染色部位的8.0和10.1。有机碳非常低，0.76％和0.06％，氮（0.067％和0,095％），磷0.8mg/kg和1.62mg/kg），钙（两种样品中的1.35mol/kg）镁记录了0.30mol/kg和1.65mol/kg，钾，0.85 mol/kg1.65mol/kg，钠，钠3.13mol/kg和30.0 mol/kg，分别在坦纳（Tannery）和染色点中。记录的沙子，淤泥和粘土（78.8％和90.6％）（7.3％和5.3％）（13.9％和4.1％）。确定土壤样品的重金属含量分别从制革厂和染色地点铬的浓度分别为0.0258和0.0043，而镍在-1.0700和-1.0756的位置几乎无法获得。铅记录的浓度非常低，为-0.9164和-7803。鉴定出13种细菌种类，芽孢杆菌的兰氏菌，枯草芽孢杆菌的频率为23.07％，枯草芽孢杆菌的频率为23.07％，枯草芽孢杆菌和肉芽杆菌的杆菌，而杆菌，杆菌菌，蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶，蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶，蛋白蛋白蛋白蛋白酶每个7.69％。 用枯草芽孢杆菌，巨型芽孢杆菌和铜绿假单胞菌从染色的土壤样品中分离出 15种，其发生频率最高，每个发生频率最高，每个发生率为13.33％。鉴定出13种细菌种类，芽孢杆菌的兰氏菌，枯草芽孢杆菌的频率为23.07％，枯草芽孢杆菌的频率为23.07％，枯草芽孢杆菌和肉芽杆菌的杆菌，而杆菌，杆菌菌，蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶，蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白蛋白酶，蛋白蛋白蛋白蛋白酶每个7.69％。15种，其发生频率最高，每个发生频率最高，每个发生率为13.33％。Burkholderia cepacia, P. florescense, Bacillus laterosporus,Bacillus amyloliquifeciens, Bacillus brevis and Proteus vulgaris had 6.66% each, all these were determine with the use of Microgen identification kit, molecular analysis was done on two bacterial isolates and were confirmed to be Alishwanella solinqauinati and Bacillus subtilis.这些表明，孤立的物种可以抵抗大量的有毒化学物质，并可以承受任何恶劣的环境，因此它们可以作为廉价成本来对受影响环境进行生物修复的潜在生物吸引者的能力。