Burrows-Wheeler 变换 (BWT) 是 FM 索引不可或缺的一部分,FM 索引广泛用于文本压缩、索引、模式搜索和生物信息学问题,如从头组装和读取比对。因此,在时间和内存使用方面高效构建 BWT 是这些应用的关键。我们提出了一种称为改进桶 Burrows-Wheeler 变换 (IBB) 的新型外部算法,用于构建具有高度多样化序列长度的 DNA 数据集的 BWT。IBB 使用右对齐方法来有效处理不同长度的序列,使用基于树的数据结构来管理相对插入位置和等级,并使用精细桶来减少对外部存储器的必要输入和输出量。我们的实验表明,在大多数数据集上,IBB 比现有的最佳 BWT 构建算法快 10% 到 40%,同时保持有竞争力的内存消耗。
DNA测序数据的指数增长需要有效的解决方案,以存储和查询大规模𝑘 -MER集。虽然最近的索引方法使用频谱的弦乐集(SPS),全文索引或哈希,但它们通常会施加结构性约束或需求广泛的参数调整,从而限制了其在不同数据集和数据类型上的可用性。在这里,我们提出了FMSI,这是一种最小的参数,高度空间效率的成员索引和压缩字典,用于任意𝑘 -MER集。fmsi将近似最短的超级弦与蒙面的洞穴 - 轮毂变换(MBWT)结合在一起。与传统方法不同,FMSI在没有预定义的假设上进行操作,而对𝑘 -mer重叠模式则可以利用它们。我们证明,与第二好的竞争对手相比,FMSI比SSHASH,SBWT和CBL等已建立的索引提供了卓越的存储效率,其空间节省最高为2-3倍,具体取决于数据集,𝑘 -MER大小,采样,采样和基因组复杂性,同时支持快速成员和词典成员和义务质量。总体而言,这项工作将基于超弦的索引作为基因组数据的高度通用,灵活且可扩展的方法,并在Pangenomics,宏基因组学和大规模基因组数据库中进行了直接应用。
材料作为商业肥料扩大了德克萨斯州饲料和肥料控制服务所规定的范围。该法案允许该服务限制含有全氟烷基和多氟烷基物质(PFA)的制造,销售,分布或应用,该物质(PFA)测试了一定浓度水平的水平。制造商必须每月发送样本,以进行独立分析,并处理超过浓度限制的批处理或通过焚化。如果同一制造商的两个或多个样本在一年内超过限制,则将发出停车订单,并将暂停制造商的许可证,直到证明合规性。在许可证悬架期间,可能会以制造商的费用进行随机的现场采样。未能在一年中多次提交所需样本,从而导致与前几点相似的行动。制造商必须在分发之前进行每批自测,并保留这些测试的记录,并在其网站上发布结果。该立法的目的是减轻与PFAS物质相关的潜在健康和环境风险。TFB当前在HB 1674上是中性的。TFB政策不反对HB 1674创建的过程,以确保用作肥料使用的市政污泥是安全的。但是,所提供的水平可能或可能不是科学证明是安全的。因此,在收集其他信息时,TFB在账单上是中立的。TFB 2025政策:废物处置第158节,第91页,第128-138行可再生能源SB 819:与可再生能源产生设施有关。Kolkhorst,LOIS(R)摘要:SB 819在德克萨斯州建立了可再生能源项目(风能和太阳能开发)的监管框架。 目前,对州一级的风和太阳能开发几乎没有法规或监督。 该法案要求得克萨斯州公用事业委员会(PUC),并对得克萨斯州公园和野生动物部(TPWD)进行环境影响审查,以确立对可再生能源项目的监督。 可再生能源开发产生超过10兆瓦的功率(约50英亩的太阳能或3-4风力涡轮机)需要许可。Kolkhorst,LOIS(R)摘要:SB 819在德克萨斯州建立了可再生能源项目(风能和太阳能开发)的监管框架。目前,对州一级的风和太阳能开发几乎没有法规或监督。该法案要求得克萨斯州公用事业委员会(PUC),并对得克萨斯州公园和野生动物部(TPWD)进行环境影响审查,以确立对可再生能源项目的监督。可再生能源开发产生超过10兆瓦的功率(约50英亩的太阳能或3-4风力涡轮机)需要许可。