塞内加尔等西非国家的气候变化的特征是温度升高,夏季降雨降低以及洪水和干旱等极端事件。农业,尤其是花生种植,在塞内加尔具有经济意义。但是,气候变化严重威胁了农业稳定,这加剧了粮食不安全,尤其是对于生活在国家贫困线以下的38%的人口(ANSD 2018)。降雨和温度模式的变化显着影响农业和食品生产系统,特别是在塞内加尔东部。这危害了玉米和大米等主食,危害了人们对农业的粮食安全性(Brottem and Brooks 2018; Roudier等人。2011)。此外,作物模型预测,花生产量的降低了5%至25%,这是许多家庭,尤其是极端贫困的家庭的主食(World Bank 2017)。模型还可以预期,由于高温,玉米等农作物中的重要营养物质的潜力下降(Myers等人。2014; Thomson and Mason 2018)。
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从犬粪便中分离出摘要酸性CACC 537,并据报道具有生物性特性。我们旨在通过功能基因组分析来表征该菌株的潜在益生菌特性。使用PACBIO RSII和Illumina平台进行了酸性P.酸性CACC 537的完整基因组测序,并包含一个带有42%G + C含量的圆形Chromo(2.0 MB)。序列是注释,显示1,897个蛋白质编码序列,15个rRNA和56个trNA。确定酸性P.酸性CACC 537基因组携带已知与免疫系统有关的基因,防御机制,限制性修饰(R-M)和CRISPR系统。CACC 537被证明有益于在发酵过程中预防病原体感染,有助于宿主免疫和维持肠道健康。这些结果可在酸性假单胞菌的地位和工业益生菌饲料添加剂的发展下进行全面,从而有助于改善宿主的免疫力和肠道健康。关键字:酸性花生,犬,全基因组测序
