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ST8SIA6-AS1，肝癌中的新型LNCRNA星
肝癌是最致命的胃肠道恶性肿瘤之一。新兴证据强调了长期非编码RNA（LNCRNA）在肿瘤发生中的关键作用，ST8SIA6-AS1鉴定为一种新型的致癌性LNCRNA，这有助于肝癌进展。ST8SIA6-AS1在肝癌组织中始终上调，并且与不利的预后密切相关。此外，它在检测HCC时表现出很高的诊断效率。ST8SIA6-AS1参与了各种细胞过程，包括增殖，迁移和入侵，主要是通过其作为竞争性内源RNA（CERNA）的功能，从而促进了肝癌发生和疾病的进步。这篇综述提供了对肝细胞癌（HCC）中ST8SIA6-AS1的分子功能和调节机制的详细检查，并强调了其作为肝癌的有希望的生物标志物的潜力，旨在推动HCC管理创新治疗策略的发展。
miRNA 介导的植物与病原体之间的调控及相互作用
摘要：植物已经进化出多种分子机制，使其能够对多种病原体作出反应。microRNA 是一类短链单链 RNA 分子，可在转录或翻译后水平调节基因表达，在协调植物与病原体相互作用中起着至关重要的作用，这一点已变得十分清楚。具体而言，miRNA 已被证明参与调节植物激素信号、活性氧和 NBS-LRR 基因表达，从而调节宿主与病原体之间的军备竞赛。最近有研究表明，特定的 lncRNA (ceRNA) 可以充当诱饵，与 miRNA 相互作用并调节其活性，这又增加了一层复杂性。本文我们回顾了有关 miRNA 在植物防御中的作用的最新发现，重点介绍了 miRNA 的调控模式及其在培育抗病原体植物（包括农作物和树木）中的可能应用。特别强调讨论miRNA在宿主与病原体军备竞赛中的作用，以及与疾病相关的miRNA与lncRNA之间的相互作用。
c-Met 中的微小 RNA 和长链非编码 RNA - ...
微小RNA（miRNA）和长链非编码RNA（lncRNA）是与肿瘤侵袭性和癌症转移相关的许多信号通路的组成部分。一些lncRNA被归类为竞争性内源性RNA（ceRNA），它们与特定的miRNA结合，以阻止与靶向mRNA的相互作用。研究表明，肝细胞生长因子/间充质上皮转化因子（HGF/c-Met）通路参与细胞生长、血管生成和胚胎发生等生理和病理过程。c-Met的过度表达可导致下游信号的持续激活，从而导致致癌、转移和对靶向治疗的耐药性。在本综述中，我们利用临床和组织染色质免疫沉淀 (ChIP) 分析数据评估了抗癌和致癌非编码 RNA (ncRNA) 对 c-Met 的影响，以及癌症中 lncRNA、miRNA 和 c-Met 之间的相互作用。我们总结了当前对 lncRNA/miR-34a/c-Met 轴在不同肿瘤类型中的机制和影响的认识，并评估了针对 c-Met 的 lncRNA 和/或 miRNA 对药物耐药性的潜在治疗价值。此外，我们讨论了 lncRNA 和 miRNA 在 c-Met 相关致癌作用中的作用以及潜在的治疗策略。
识别预后生物标志物和药物靶点...
摘要：结直肠癌是常见的消化道恶性肿瘤之一，发病率和死亡率较高。越来越多的证据表明，长链非编码RNA（lncRNA）和蛋白编码RNA通过竞争相同的微小RNA反应元件（MRE）相互作用，在多种肿瘤类型的基因表达调控中发挥重要作用。但lncRNA介导的竞争性内源性RNA网络在结肠癌中的调控机制和预后作用尚不清楚。从The Cancer Genome Atlas数据库下载了471例结肠癌和41例癌旁组织样本的mRNA、lncRNA和miRNA的表达谱，构建了结肠癌的lncRNA‑miRNA‑mRNA ceRNA网络，由17个枢纽lncRNA、87个枢纽miRNA和144个枢纽mRNA组成。分析了网络的拓扑特性，并使用随机游走算法识别与结肠癌显着相关的节点。使用 UALCAN 数据库进行的生存分析表明，17 个 lncRNA 中有 2 个被识别为[转移相关肺腺癌转录本 (MALAT1) 和母体表达基因 3 (MEG3)] 和
回顾DARS-AS1：具有癌症预后和治疗潜力的重要致癌LNCRNA调节剂
dars-as1，是Aspartyl-tRNA合成酶反义RNA 1的缩写，已成为癌症中的关键玩家。该lncRNA的上调是在各种癌症类型中观察到的一种复发现象，主要假定肿瘤作用，对肿瘤细胞生物学的多个方面发挥影响。DARS-AS1的这种异常表达引发了广泛的研究研究，旨在揭示其在癌症中的作用和临床价值。在这篇综述中，我们阐明了癌症患者失调的DARS-AS1表达和不良存活预后之间的显着相关性，从现有文献中汲取了癌症基因组图集（TCGA）的泛滥作用分析。此外，我们还提供了对DARS-AS1在各种癌症中各种功能的各种功能的全面见解。我们的评论涵盖了分子机制，CERNA网络，功能介质和信号传导途径的阐明，及其参与治疗耐药性，再加上DARS-AS1与DARS-AS1相关癌症研究的最新进步。这些最近的更新丰富了我们对DARS-AS1在癌症中扮演的关键作用的全面理解，从而为未来的DARS-AS1靶向策略在肿瘤预后评估和治疗干预措施中的应用铺平了道路。本评论提供了有价值的见解，以促进有效地打击癌症的持续努力。
针对生物标志物和治疗性TAR鉴定的小细胞肺癌中氟胞菌相关基因的原始研究综合分析
背景：铁铁作用是一种依赖铁的编程细胞死亡模式，该模式是由磷脂过氧化的有毒积累引起的。尽管已知它会影响肿瘤的起始和生长，但尚未建立与铁毒相关基因（FRGS）（FRGS）（FRGS）（SCLC）之间的关联。方法：我们使用基因表达综合（GEO）和铁毒数据库（FERRDB）来获取有关SCLC及其相关FRG的信息。随后，使用最小绝对收缩和选择算子（LASSO）和支持向量机递归特征Eilmination（SVM-RFE）算法鉴定出标记基因，并分析单基因函数和途径富集。使用药物 - 基因相互作用数据库（DGIDB），我们确定了针对六个标记基因的40种药物。竞争性的内源性RNA（CERNA）网络揭示了基于标记基因的长期非编码RNA（LNCRNA） - microRNA（miRNA） - 梅纳（miRNA） - 梅纳（miRNA） - 通用RNA（mRNA）。结果：将六个差异表达的FRG（ATG3，MUC1，RRM2，IDH2，PARP1和EZH2）鉴定为具有准确诊断能力的标记基因。根据单基因功能和途径富集分析，这些标记基因可能与免疫调节和细胞周期有关，以及与肿瘤发生相关的许多途径，包括JAK-Stat和PPAR信号途径。此外，Cibersort分析表明，MUC1和PARP1表达可能会影响SCLC中的免疫微环境。现在必须在临床应用之前通过进一步的研究来确认这些结果的准确性。结论：我们使用逻辑回归模型确认了标记基因诊断SCLC的准确性，从而提供了进一步研究与SCLC相关机制的机会。
miR-155和CTBP1-AS2的循环水平是一种有前途的生物标志物，用于早期检测糖尿病性肾病
最受欢迎的传统临床生物标志物评估肾脏功能和糖尿病肾脏疾病（DKD）的鉴定，包括血清肌酐（SCR），肾小球滤过率（EGFR），尿白蛋白肌酐比率（UACR）和白蛋白尿尿症检测[7，8]。即使存在这些传统标记，及时，精确的DN诊断也存在重大障碍。最近的研究表明，大约30％的DN患者没有蛋白尿[9]。此外，在DN患者中，特别是在T2D中，在没有蛋白尿的情况下，GFR的降低。相反，这些患者以严重降低的GFR降低了慢性肾脏疾病（CKD），而没有从微藻尿症过渡到明显的蛋白尿[10]。并非特定于DKD的存在，也可能发生在其他疾病中[11]。由于DN的早期诊断对于防止该疾病的发展至关重要，因此近年来已经努力引入新的DN诊断标记。最近的研究表明，非编码RNA（NCRNA），尤其是microRNA（miRNA）和长期编码RNA（LNCRNA）参与DN的发作和进展[12-14]。LNCRNA和miRNA之间的相互作用，称为miRNA海绵或竞争性内源性RNA（CERNA），可以减少miRNA对mRNA的抑制作用，从而防止靶基因抑制[15]。此外，NCRNA可以作为一种新型敏感和无创的诊断生物标志物来预测DN进展，因为它们在体液，组织和组织和细胞特异性表达曲线上的稳定性很高[16，17]。
基于生物信息学的研究文章分析：非编码RNA介导的COL10A1与pancr的预后不良和免疫细胞浸润
背景。胶原型X型α1（COL10A1）是细胞外基质的结构成分，在多种癌症组织中异常表达。但是，其在胰腺癌进展中的作用尚不清楚。方法。te癌症基因组图集（TCGA），基因表达综合（GEO）和基因表达促进相互作用分析（GEPIA）数据用于探索pancreatic腺癌中正常和肿瘤组织中COL10A1在正常和肿瘤组织中的表达及其预后。TCGA中胰腺癌的临床数据用于探索COL10A1与临床特征之间的关系。使用多个数据库探索了与COL10A1共表达的基因，并分析了功能富度。此外，通过构建竞争性内源性RNA（CERNA）调节轴，探索了胰腺癌中COL10A1调节的LNCRNA/miRNA/COL10A1轴。最后，分析了COL10A1与胰腺癌中的免疫细胞内部和各种免疫检查点分子的相关性。结果。发现胰腺癌组织中Col10a1的表达显着增加。COL10A1的高表达与临床病理学特征和胰腺癌患者的预后较差有关。TE TETUG1/MIR-144-3P/COL10A1轴被鉴定为胰腺癌中Col10a1最可能的上游非编码RNA途径。结论。col10a1是一种早期诊断标记，其高表达与胰腺癌的免疫效果相关。此外，在胰腺腺癌中，COL10A1的表达水平与肿瘤免疫细胞的表达显着相关，免疫细胞的生物标志物和免疫检查点分子的表达。TE TETUG1/MIR-144-3P/COL10A1轴被鉴定为胰腺癌中Col10a1最可能的上游非编码RNA途径。
癌细胞生物学 Libor Macůrek
精选出版物：1. Burocziova M、Burdova K、Martinikova AS、Kasparek P、Kleiblova P、Danielsen SA、Borecka M、Jenikova G、Janečková L、Pavel J、Zemankova P、Schneiderova M、Schwarzova L、Ticha I、Sun XF、Jiraskova K、Liska V、Vodickova L、Vodicka P、Sedlacek R、Kleibl Z、Lothe RA、Korinek V、Macurek L (2019) 截短的 PPM1D 会损害干细胞对基因毒性应激的反应并促进小鼠结肠中 APC 缺陷型肿瘤的生长。细胞死亡问题，10：818。 2. Burdova K、Storchova R、Palek M、Macurek L (2019) WIP1 促进同源重组并调节对 PARP 抑制剂的敏感性。细胞，8：1258。 3. Jaiswal H、Benada J、Müllers E、Akopyan K、Burdova K、Koolmeister T、Helleday T、Medema RH、Macurek L 和 Lindqvist A (2017) 染色质处的 ATM/Wip1 活性控制 Plk1 重新激活以确定 G2 检查点持续时间。 EMBO J, 36:2161-2176。 4. Kleiblova P、Stolarova L、Krizova K、Lhota F、Hojny J、Zemankova P、Havranek O、Vocka M、Cerna M、Lhotova K、Borecka M、Janatova M、Soukupova J、Sevcik J、Zimovjanova M、Kotlas J、Panczak A、Vesela K、Cervenkova J、Schneiderova M、Burocziova M、Burdova K、Stranecky V、Foretova L、Machackova E、Tavandzis S、Kmoch S、Macurek L、Kleibl Z（2019）鉴定有害的种系 CHEK2 突变及其与乳腺癌和卵巢癌的关系。 Int J Cancer,145:1782-1797。
原创文章 Dystrobrevin beta 是肝细胞癌的一个有希望的预后生物标志物和治疗靶点
摘要：目的：抗肌萎缩蛋白β（DTNB）是肌营养不良蛋白相关蛋白复合物（DPC）的组成部分。我们前期的RNA测序（RNA-seq）研究表明，敲低肝细胞癌（HCC）细胞中的致癌长链非编码RNA（ln cRNA）HOXD簇反义RNA 1（HOXD-AS1）可降低DTNB的表达水平。但DTNB与HCC之间的关联仍不明确。方法：采用定量实时PCR（qRT-PCR）验证HCC细胞系中DTNB的上调及HOXD-AS1对其表达的调控作用。通过生物信息学分析探讨DTNB在HCC中的潜在临床意义、生物学功能及其机制。验证DTNB在HCC组织中的高表达，并通过体外功能缺失试验研究其在HCC中的生物学功能。结果：DTNB 在肝癌细胞中高表达，并且在几种肝癌细胞系中受 lncRNA HOXD-AS1 的正向调控。DTNB 的上调与 T 分期、组织学分级、肿瘤状态、邻近肝组织炎症、甲胎蛋白 (AFP) 水平和不良预后显着相关，是与总体生存率相关的独立风险指标，对肝癌的诊断和预后具有重要意义。DTNB 还与免疫细胞浸润、免疫治疗和对抗肝癌药物的敏感性密切相关。鉴定出与 DTNB 在肝癌中共表达的基因，功能富集分析表明 DTNB 可能通过调节细胞周期在肝癌中发挥作用。预测并验证了肝癌中 HOXD-AS1/miR-139-3p/DTNB 的潜在 ceRNA（竞争性内源性 RNA）调控轴。 DTNB 的高表达在我们的 HCC 队列中得到验证，功能丧失试验表明，DTNB 敲低可抑制 HCC 细胞的增殖、迁移和侵袭，并引发细胞周期停滞在 G0/G1 期。结论：DTNB 是 lncRNA HOXD-AS1 的下游靶标，具有作为预后生物标志物和 HCC 治疗靶标的潜在用途。