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AVENIO 肿瘤组织 CGP 试剂盒
1. Frampton GM 等人。Nat Biotechnol 2013；31：1023–1031；2. Suh JH 等人。Oncologist 2016；21：684–691；3. FoundationOne®CDx 技术规范，2020 年。网址：www.rochefoundationmedicine.com/f1cdxtech（2021 年 10 月访问）；4. FoundationOne®Liquid 技术规范，2020 年。网址：https://www.foundationmedicine.com/genomic-testing/foundation-one-liquid（2021 年 10 月访问）；5. FoundationOne®Heme 技术规范，2020 年。网址：www.foundationmedicine.com/genomic-testing/foundation-one-heme（2021 年 10 月访问）；6. He J 等人。血2016； 127：3004–3014； 7. 克拉克 TA 等人。分子诊断杂志，2018； 20：686–702； 8. Chalmers ZR 等人。基因组医学2017; 9：34； 9. Schrock AB 等。临床癌症研究，2016； 22：3281–3285； 10.罗斯·JS 等人。妇科肿瘤2013； 130：554–559； 11. 霍尔·MJ 等人。临床肿瘤学杂志，2016； 34：1523–1523； 12. IQVIA 全球肿瘤学趋势 2021。网址为 https://www.iqvia.com/en/insights/the-iqvia-institute/reports/global-oncology-trends-2021（2021 年 8 月访问）。13. NCCN 肿瘤学临床实践指南（NCCN 指南®）急性淋巴细胞白血病 V.1.2020 14. NCCN 肿瘤学临床实践指南（NCCN 指南®）急性髓细胞白血病 V.3.2020 15. NCCN 肿瘤学临床实践指南（NCCN 指南®）膀胱癌 V.3.2020 16. Mosele F Ann Oncol 2020；31(11) 1491-1505； 17. Foundation Medicine® 关于我们：https://www.foundationmedicine.com/info/detail/our-story © 2021 F. Hoffmann-La Roche Ltd. AVENIO 是罗氏公司的注册商标。FOUNDATIONONE 是 Foundation Medicine, Inc. 的注册商标。所有其他产品名称和商标均为其各自所有者的财产。
CGP 雨水污染防治计划模板
一般场地信息：说明 ................................................................................................................ 13 一般场地信息：工作表 .............................................................................................................. 16 主要平整活动时间表或顺序：说明 ...................................................................................... 18 主要平整活动时间表或顺序：工作表 ...................................................................................... 20 土地面积和土壤类型：说明 ...................................................................................................... 22 土地面积和土壤类型：工作表 ...................................................................................................... 24 一般施工位置和详细场地地图：说明 ...................................................................................... 26 支持活动的场地描述：说明 ...................................................................................................... 30 支持活动的场地描述：日志表 ...................................................................................................... 32 授权文件和认证：说明 ...................................................................................................... 34
CGP 雨水污染防治计划模板
一般场地信息：说明 ................................................................................................................ 13 一般场地信息：工作表 .............................................................................................................. 16 主要平整活动时间表或顺序：说明 ...................................................................................... 18 主要平整活动时间表或顺序：工作表 ...................................................................................... 20 土地面积和土壤类型：说明 ...................................................................................................... 22 土地面积和土壤类型：工作表 ...................................................................................................... 24 一般施工位置和详细场地地图：说明 ...................................................................................... 26 支持活动的场地描述：说明 ...................................................................................................... 30 支持活动的场地描述：日志表 ...................................................................................................... 32 授权文件和认证：说明 ...................................................................................................... 34
综合基因组分析 (CGP) 在现实中的可行性...
1 解剖病理学研究单位，罗马生物医学大学医学与外科系，Via Alvaro del Portillo，21-00128 罗马，意大利 2 解剖病理学手术研究单位，罗马生物医学大学医学与外科系，Via Alvaro del Portillo，200-00128 罗马，意大利 3 普通外科研究单位，罗马生物医学大学医学与外科系，Via Alvaro del Portillo，21-00128 罗马，意大利 4 胸外科手术研究单位，罗马生物医学大学医学与外科系，Via Alvaro del Portillo，200-00128 罗马，意大利 5 肿瘤学研究单位，罗马生物医学大学医学与外科系，Via Alvaro del Portillo，21-00128 罗马，意大利 6 医学肿瘤学手术研究组，Fondazione Policlinico Universitario Campus Bio-Medico，Via Alvaro del Portillo，200-00128 罗马，意大利 * 通讯地址：lorenzo.nibid@unicampus.it (LN); g.perrone@policlinicocampus.it （全科医生）
Avenio肿瘤组织CGP KIT v2小册子
1。Frampton GM等。 nat生物技术。 2013; 31：1023–1031。 2。 Foundation®CDX技术标签，2023。 可在以下网址提供：https：//info.foundationmedicine.com/hubfs/ fmi％20labels/foundationone_cdx_label_technical_info.pdf（2024年7月访问）。 3。 Foundation® -liquid技术规格，2023。 可在：https：//assets.ctfassets.net/w98cd481qyp0/wvem7vticyr0st5c1vbu7/fd055e0476183a6acd4aacd4ae6b583e3aa00/f1lcdx_技术_sspecs_s_072024.pddfdffbu7/fd05e0476183a6aacd4ae6b583ae.p.p.ptd.24.pdfdffbu7/wvem7vticyr0st5c1vbu7/ 4。 Foundation® -Heme技术规格，2021。 可在：https：//assets.ctfassets.net/w98cd481qyp0/42r1cte8vr4137cahrsaen/baf91080cb3d78a52adad.adad.adaada10c6358fa130/foundation foundation _ heme_heme_technical_specect.ptf（Quptiaciations.pdf）（pdf）（ 5。 JE等。 血。 2016; 127：3004–3014。 6。 Clark Ta等。 J MOL诊断。 2018; 20：686–702。 7。 Chalmers Zr等。 基因组医学。 2017; 9：34。 8。 Schrock AB等。 Clin Cancer Res。 2016; 22：3281–3285。 9。 Ross JS等。 Gynecol Oncol。 2013; 130：554–559。Frampton GM等。nat生物技术。2013; 31：1023–1031。 2。 Foundation®CDX技术标签，2023。 可在以下网址提供：https：//info.foundationmedicine.com/hubfs/ fmi％20labels/foundationone_cdx_label_technical_info.pdf（2024年7月访问）。 3。 Foundation® -liquid技术规格，2023。 可在：https：//assets.ctfassets.net/w98cd481qyp0/wvem7vticyr0st5c1vbu7/fd055e0476183a6acd4aacd4ae6b583e3aa00/f1lcdx_技术_sspecs_s_072024.pddfdffbu7/fd05e0476183a6aacd4ae6b583ae.p.p.ptd.24.pdfdffbu7/wvem7vticyr0st5c1vbu7/ 4。 Foundation® -Heme技术规格，2021。 可在：https：//assets.ctfassets.net/w98cd481qyp0/42r1cte8vr4137cahrsaen/baf91080cb3d78a52adad.adad.adaada10c6358fa130/foundation foundation _ heme_heme_technical_specect.ptf（Quptiaciations.pdf）（pdf）（ 5。 JE等。 血。 2016; 127：3004–3014。 6。 Clark Ta等。 J MOL诊断。 2018; 20：686–702。 7。 Chalmers Zr等。 基因组医学。 2017; 9：34。 8。 Schrock AB等。 Clin Cancer Res。 2016; 22：3281–3285。 9。 Ross JS等。 Gynecol Oncol。 2013; 130：554–559。2013; 31：1023–1031。2。Foundation®CDX技术标签，2023。可在以下网址提供：https：//info.foundationmedicine.com/hubfs/ fmi％20labels/foundationone_cdx_label_technical_info.pdf（2024年7月访问）。3。Foundation® -liquid技术规格，2023。可在：https：//assets.ctfassets.net/w98cd481qyp0/wvem7vticyr0st5c1vbu7/fd055e0476183a6acd4aacd4ae6b583e3aa00/f1lcdx_技术_sspecs_s_072024.pddfdffbu7/fd05e0476183a6aacd4ae6b583ae.p.p.ptd.24.pdfdffbu7/wvem7vticyr0st5c1vbu7/4。Foundation® -Heme技术规格，2021。可在：https：//assets.ctfassets.net/w98cd481qyp0/42r1cte8vr4137cahrsaen/baf91080cb3d78a52adad.adad.adaada10c6358fa130/foundation foundation _ heme_heme_technical_specect.ptf（Quptiaciations.pdf）（pdf）（5。JE等。 血。 2016; 127：3004–3014。 6。 Clark Ta等。 J MOL诊断。 2018; 20：686–702。 7。 Chalmers Zr等。 基因组医学。 2017; 9：34。 8。 Schrock AB等。 Clin Cancer Res。 2016; 22：3281–3285。 9。 Ross JS等。 Gynecol Oncol。 2013; 130：554–559。JE等。血。2016; 127：3004–3014。 6。 Clark Ta等。 J MOL诊断。 2018; 20：686–702。 7。 Chalmers Zr等。 基因组医学。 2017; 9：34。 8。 Schrock AB等。 Clin Cancer Res。 2016; 22：3281–3285。 9。 Ross JS等。 Gynecol Oncol。 2013; 130：554–559。2016; 127：3004–3014。6。Clark Ta等。J MOL诊断。 2018; 20：686–702。 7。 Chalmers Zr等。 基因组医学。 2017; 9：34。 8。 Schrock AB等。 Clin Cancer Res。 2016; 22：3281–3285。 9。 Ross JS等。 Gynecol Oncol。 2013; 130：554–559。J MOL诊断。2018; 20：686–702。 7。 Chalmers Zr等。 基因组医学。 2017; 9：34。 8。 Schrock AB等。 Clin Cancer Res。 2016; 22：3281–3285。 9。 Ross JS等。 Gynecol Oncol。 2013; 130：554–559。2018; 20：686–702。7。Chalmers Zr等。基因组医学。2017; 9：34。 8。 Schrock AB等。 Clin Cancer Res。 2016; 22：3281–3285。 9。 Ross JS等。 Gynecol Oncol。 2013; 130：554–559。2017; 9：34。8。Schrock AB等。Clin Cancer Res。 2016; 22：3281–3285。 9。 Ross JS等。 Gynecol Oncol。 2013; 130：554–559。Clin Cancer Res。2016; 22：3281–3285。 9。 Ross JS等。 Gynecol Oncol。 2013; 130：554–559。2016; 22：3281–3285。9。Ross JS等。Gynecol Oncol。2013; 130：554–559。2013; 130：554–559。
BGP CGP t DGP ,EGP FCP =GGP
（（3）投标方法 A. 在确定中标人时，中标金额为投标文件所载金额加上 10% 的金额（如果金额有不足一日元的尾数，则将尾数四舍五入）。因此，无论投标人是消费税和地方消费税的纳税实体还是免税实体，都应在其投标文件中载明相当于估算金额的 100/110（对于适用减税率的项目，则为估算金额的 100/108）的金额。 B. 在估算价格范围内，投标金额最低的投标人为中标人。如果投标金额仍未满一日元，则中标金额为投标文件所载金额加上 10% 的金额（如果投标金额未满一日元，则将尾数四舍五入）。如果有两名投标人出价相同，则立即以抽签方式确定中标人。投标人因邮购收据或其他原因无法抽签时，将由与邮购收据无关的官员代为抽签并确定中标人。 (4) 无效投标 A. 不具备第 1 款规定的参加竞争所需资格的人提交投标时。 B. 投标人在“排除有组织犯罪集团公约”或“排除有组织犯罪集团公约”中作出虚假陈述或违反公约时。 C. 投标人违反投标条件提交投标时。 D. 投标金额不明确或投标人名称难以辨别时。
全面的基因组分析（CGP）套件的演变，以简化工作流并检测同源重组缺陷
•提取优化：用1或3小时的孵育提取16个FFPE样品。使用随附的QPCR评估提取的DNA的浓度和质量。•连接研究：测试了缩短的程序，并针对原始条件分析了关键的测序指标，以减少图书馆的准备工作。•较高的吞吐量研究：合并，测序并与8个样本进行了汇总，测序。•变体灵敏度：用Avenio CGP KIT V2对317 FFPE DNA样品进行测序。变体检测与参考方法F1CDX进行了比较。样品包括由QPCR评估的多种DNA质量。测序是在每个样品读取> 60m的Illumina NextSeq序列上进行的。使用FoundationOneⓡ分析平台进行数据分析。结果
使用合成对照组比较接受复杂基因组分析的晚期癌症患者的生存结果
摘要背景复杂基因组分析 (CGP) 已经改变了癌症治疗决策，但缺乏有力且可量化的证据来证明如何利用 CGP 改善患者预后。目的本研究使用基于登记的匹配对照人群评估了 CGP 在改善现实世界晚期癌症患者总生存期 (OS) 的队列水平临床效果。患者和方法两组晚期和难治性癌症患者连续入组以考虑早期试验入组。第一组（CGP 组）通过研究获得肿瘤分析；而随后的第二组没有进行分析。使用 Kaplan-Meier 曲线和 Cox 比例风险模型比较了各组之间的总体生存期。分析了潜在的混杂因素，并使用基于倾向评分的稳定权重进行了调整。结果在 CGP 组中，25 名（17.6%）患者根据 CGP 结果接受了治疗，与结果未影响治疗的 CGP 患者相比，该亚组的生存率显著提高（未调整 HR = 0.44，（0.22–0.88），p = 0.02）。然而，当将整个 CGP 队列与无 CGP 队列进行比较时，没有明显的生存获益，CGP 的调整后中位 OS 为 13.5 个月（9.2–17.0），而无 CGP 的调整后中位 OS 为 11.0（9.2–17.4）（调整后的 HR = 0.92，（0.65–1.30），p = 0.63）。结论本研究利用真实世界数据模拟对照组并量化基因组检测的临床效果。接受 CGP 结果主导治疗的患者生存获益的大小不足以推动整个测试人群的总体生存率提高。将 CGP 转化为临床需要制定策略来确保更高比例的受检患者获得临床益处，从而实现 CGP 在晚期癌症人群中的价值主张。
使用合成对照组比较接受复杂基因组分析的晚期癌症患者的生存结果
摘要背景复杂基因组分析 (CGP) 已经改变了癌症治疗决策，但缺乏有力且可量化的证据来证明如何利用 CGP 改善患者预后。目的本研究使用基于登记的匹配对照人群评估了 CGP 在改善现实世界晚期癌症患者总生存期 (OS) 的队列水平临床效果。患者和方法两组晚期和难治性癌症患者连续入组以考虑早期试验入组。第一组（CGP 组）通过研究获得肿瘤分析；而随后的第二组没有进行分析。使用 Kaplan-Meier 曲线和 Cox 比例风险模型比较了各组之间的总体生存期。分析了潜在的混杂因素，并使用基于倾向评分的稳定权重进行了调整。结果在 CGP 组中，25 名（17.6%）患者根据 CGP 结果接受了治疗，与结果未影响治疗的 CGP 患者相比，该亚组的生存率显著提高（未调整 HR = 0.44，（0.22–0.88），p = 0.02）。然而，当将整个 CGP 队列与无 CGP 队列进行比较时，没有明显的生存获益，CGP 的调整后中位 OS 为 13.5 个月（9.2–17.0），而无 CGP 的调整后中位 OS 为 11.0（9.2–17.4）（调整后的 HR = 0.92，（0.65–1.30），p = 0.63）。结论本研究利用真实世界数据模拟对照组并量化基因组检测的临床效果。接受 CGP 结果主导治疗的患者生存获益的大小不足以推动整个测试人群的总体生存率提高。将 CGP 转化为临床需要制定策略来确保更高比例的受检患者获得临床益处，从而实现 CGP 在晚期癌症人群中的价值主张。