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外染色体DNA（ECDNA）是癌症局灶性致癌基因扩增的中心机制，发生在大约15％的早期癌症和30％的晚期癌症中。ECDNA通过动态调节基因拷贝数并重新启动基因调节网络，驱动肿瘤形成，进化和耐药性。阐明ECDNA扩增的基因组结构对于理解肿瘤病理学和开发更有效的疗法至关重要。 配对的末端短阅读（Illumina）测序和映射已被用来使用断点图表示eCDNA扩增，其中将ECDNA的推断架构编码为图中的循环。 断点图的遍历已用于成功预测癌症样品中的ECDNA。 然而，在识别断点，复杂的重排和内部重复的鉴定以及ECDNA结构的细胞到细胞异质性的反卷积方面，短阅读技术在识别中固有限制。 长读技术，例如来自牛津纳米孔技术，具有改进推理的潜力，因为读取较长在映射结构变体方面更好，并且更有可能跨越重新排列或重复的区域。 在这里，我们提出了珊瑚（通过长读数的扩增完全重建），用于使用长阅读数据重建ecdna架构。 珊瑚重建可能使用二次编程的循环档案，同时优化重建的简约，解释了拷贝数和长阅读映射的一致性。 可用性：https：//github.com/ampliconsuite/coral阐明ECDNA扩增的基因组结构对于理解肿瘤病理学和开发更有效的疗法至关重要。配对的末端短阅读（Illumina）测序和映射已被用来使用断点图表示eCDNA扩增，其中将ECDNA的推断架构编码为图中的循环。断点图的遍历已用于成功预测癌症样品中的ECDNA。然而，在识别断点，复杂的重排和内部重复的鉴定以及ECDNA结构的细胞到细胞异质性的反卷积方面，短阅读技术在识别中固有限制。长读技术，例如来自牛津纳米孔技术，具有改进推理的潜力，因为读取较长在映射结构变体方面更好，并且更有可能跨越重新排列或重复的区域。在这里，我们提出了珊瑚（通过长读数的扩增完全重建），用于使用长阅读数据重建ecdna架构。珊瑚重建可能使用二次编程的循环档案，同时优化重建的简约，解释了拷贝数和长阅读映射的一致性。可用性：https：//github.com/ampliconsuite/coral与以前的基于简读的工具相比，珊瑚在广泛的模拟和9个数据集中的重建基本上改善了重建。随着长阅读的用法变得广泛，我们预计珊瑚将成为培养肿瘤中局灶性扩增的景观和演变的宝贵工具。
NIRB筛查申请＃125713 Coral Harbor Solar and Sovel Storage Project
英语：珊瑚港社区是Nunavut领土上第一个公用事业规模可再生能源和电池存储系统之一的拟议地点。合并的太阳能产生和存储项目将与社区的微电网集成在一起，该项目是由Qulliq Energy Corporation（QEC）运行的区域电气公用网络的一部分。建议该项目包括0.96 MW的太阳能PV安装，并配备1 MWH电池。一起，该系统将有能力提供社区现有的现有能源需求的31％，估计每年占360,000升柴油燃料消耗，或该项目的30年寿命超过1000万升。这相当于总碳排放节省约28,000吨二氧化碳。该项目始于珊瑚港社区能源计划（The CEP）的制定，该计划是通过土著柴油倡议资助的。CEP是与社区利益相关者合作创建的，并与2022年6月在Coral Harbour主持的社区开放日结束。通过CEP的工作，该项目团队将其降低碳缩小的重点范围缩小为开发太阳能PV Energy项目，该项目将有助于实现社区的可再生能源目标：一个清洁能源系统，能够在Nunavut在Nunavut的即将到来的独立的独立电力生产商中开发和操作的清洁能源系统。项目团队还聘请了承包商来进行即将进行的岩土评估工作。计划在2022 - 2024年进行进一步的开发工作。迄今为止，建立社区能源计划后的初步可行性工作包括将项目范围缩小到适当的尺寸和能源生产的类型，与关键的利益相关者互动，选择项目地点，开发太阳能项目设计，开发初步的能源能源输出，对项目预算进行建模，创建项目预算以及对项目项目的地形调查。这项工作将包括在现场执行岩土技术评估，详细的设计和工程，确保土地租赁，环境和监管许可，承包商和供应商采购以及与QEC的互连研究。该项目还在等待QEC的独立电力生产商政策的发布，目前正在与Nunavut政府合作制定，这是为了在Nunavut内构建和运营的非私人能源项目所必需的。最后，该项目的建设计划于2024年进行。建筑活动将包括购买资本设备，准备现场的准备，用于交付和安装所有设备的合同执行，包括太阳能电池板，电池，微电网控制器以及支持电气基础设施，以及项目和开发管理服务，调试和清理。永久性结构将建造在2.6公顷（6.5英亩）的场地区域中：太阳能PV阵列，几个逆变器，变形金刚，电气仪，互连设备的点，电池和电池壳，一个微电网控制系统，地下和台面电气收集系统以及所有设备的相关混凝土垫。此外，还可能需要将项目站点连接到QEC Powerhouse的新的或更新的电气配电线。该项目已获得到2024年的早期开发工作的资金，并正在为部分建筑活动寻求额外的资金。
珊瑚分布中预测的气候驱动转移表明西南大西洋礁的热带化
fi g u r e 3电流和2050年的预测，在中间变暖的场景（RCP6.0）下，西南大西洋（SWA）海岸的四个Zooxanthelate scleractinian Corals在包括时间段之间的差异（RCP6.0）下流行。线图代表每个物种在SWA海岸各个纬度程度按纬度程度按时间的平均值。蓝红色比例尺指示电流和2050图的发生概率，而三角洲概率（∆ p）用黑棕色比例尺表示。当前地图中的黑色杂交表示模型中用作输入数据的出现点。p：概率； ∆ P：三角洲概率； ARS：亚马逊河系统（1°N – 1°S）； SFR：圣弗朗西斯科河（10–11°S）。纬度16°S和20°S之间的延长架子涵盖了当前最大的礁石系统，SWA，Abrolhos Bank。
关于利用珊瑚礁修复作为支持和改善珊瑚礁生态系统服务的战略的观点
2019 年，联合国环境大会要求联合国环境规划署 (UNEP) 和国际珊瑚礁倡议 (ICRI) 制定珊瑚修复的最佳实践。由 UNEP 牵头的指导方针由一支由 20 名珊瑚礁管理、科学和政策专家组成的团队制定，旨在汇总该领域的最佳可用知识，并为将修复作为珊瑚礁管理策略提供切实可行的建议。我们在此对这些指导方针进行了综合。具体来说，我们提出了 (1) 在气候变化导致的干扰频率和强度不断增加的情况下，珊瑚礁修复的价值；(2) 一套针对目标和当前方法的改进珊瑚礁修复作为珊瑚礁管理策略的建议。珊瑚礁修复可以成为支持恢复力的有用工具，尤其是在珊瑚招募有限且干扰可以减轻的局部范围内。虽然关于珊瑚礁修复工作取得长期生态相关成功的证据有限，但持续的研发投资可能会提高当前方法的规模和成本效益。我们得出的结论是，珊瑚礁修复不应被视为解决生态衰退的“灵丹妙药”，而应适当应用，并谨慎行事，并与其他广泛的珊瑚礁恢复力管理策略相结合。
结合环境DNA和视觉调查可以为珊瑚礁的保护计划提供信息
环境DNA（EDNA）正在成为生物多样性监测的流行工具，因为它允许从环境样品中检测到生物体。我们比较了EDNA和水下视觉普查调查在为印度尼西亚超级多种壁画区域中珊瑚礁生物多样性保护的优先区域提供的优先区域。我们发现，当计划通过任何一种方法孤立地告知计划时，都会确定不同的领域。两种调查方法表明，物种检测的重叠率很低，并确定了一些不同的分类群，这表明这两种方法都应在生物多样性的互补评估中部署。我们的分析强调了该地区更多合作的紧迫性，以解决不足的分类参考信息，这阻碍了EDNA的应用。
珊瑚 - 阿尔加尔共生的代谢动力学从受精到定居点确定关键的珊瑚能量脆弱性
珊瑚 - 阿尔加尔共生的代谢动力学从受精到定居点确定1关键的珊瑚能量脆弱性2 3作者和作者分支机构4 5 Ariana S. Huffmyer 1,2,6 *，Kevin H. Wong 3，Wong 3，Danielle M. Becker 2，Emma Strand 4，Emma Strand 4，Tali Mass 5，Tali Scii 6 M.美国华盛顿州华盛顿州华盛顿市9 2美国罗德岛大学生物科学系，美国，美国，美国，金斯敦10 3罗森斯特海洋与大气科学学院，海洋生物学系，海洋生物学系和11个生态学，迈阿密迈阿密大学，佛罗里达州迈阿密大学，美国佛罗里科学，14 Haifa大学，山Carmel，Haifa，Haifa，以色列15 6 LEAD联系Ashuffmyer@gmail.com 16 17 *通讯：Ariana S. Huffmyer，Ashuffmyer@gmail.com 18 19摘要20 21气候变化加速珊瑚礁的下降，并危及22生态系统恢复的招聘必不可少。 成年珊瑚依靠其共生藻类23（共生性藻类）的重要营养交换，但是这种依赖从受精到24种招募的动力和敏感性被认为是被认为的。 我们调查了蒙蒂普拉·马蒂塔（Montipora Capitata）的13个发育阶段的生理，代谢组和25个转录组变化，这是26个夏威夷的珊瑚，该珊瑚在夏威夷26中继承了从父母到鸡蛋的共生体。 我们发现胚胎发育27取决于母体提供的mRNA和脂质，并在游泳幼虫中迅速转移到了共生体衍生的28营养。 共生的密度和光合作用峰一旦游泳至燃料29层幼虫分散。 44Carmel，Haifa，Haifa，以色列15 6 LEAD联系Ashuffmyer@gmail.com 16 17 *通讯：Ariana S. Huffmyer，Ashuffmyer@gmail.com 18 19摘要20 21气候变化加速珊瑚礁的下降，并危及22生态系统恢复的招聘必不可少。成年珊瑚依靠其共生藻类23（共生性藻类）的重要营养交换，但是这种依赖从受精到24种招募的动力和敏感性被认为是被认为的。我们调查了蒙蒂普拉·马蒂塔（Montipora Capitata）的13个发育阶段的生理，代谢组和25个转录组变化，这是26个夏威夷的珊瑚，该珊瑚在夏威夷26中继承了从父母到鸡蛋的共生体。我们发现胚胎发育27取决于母体提供的mRNA和脂质，并在游泳幼虫中迅速转移到了共生体衍生的28营养。共生的密度和光合作用峰一旦游泳至燃料29层幼虫分散。44相反，在30个变形，沉降和钙化期间，呼吸需求显着增加，反映了这种能量密集型形态学31重组。共生植物的增生是由共生铵同化32驱动的，珊瑚宿主中氮代谢几乎没有证据。随着发育的进展，33个宿主会增强氮隔离，调节共生体种群，并确保固定碳的34转移以支持变态，并具有代谢组和转录组35碳水化合物可用性的指标。尽管藻类共生群落群落保持36个稳定，但细菌群落随着个体发育而转移，与Holobiont代谢37重组有关。我们的研究揭示了开发过程中的广泛代谢变化，38越来越依赖共生营养。变形和沉降是针对预测的气候场景的最大39个关键时期，破坏了40个共生的稳定。相对于敏感的41早期生命阶段，这种高度详细的共生营养交换提供了理解和预测营养的基本知识42共生42共生融合，特别是在气候43变化的未来中，珊瑚生存和招募。
珊瑚体细胞和精子的突变意味着终生干细胞更新和细胞谱系选择
在许多动物中，生殖系在胚胎发生早期就已分化，因此只有在生殖细胞中积累的突变才会被后代遗传。这一发育过程的例外可能表明已经进化出其他机制来限制有害突变积累的影响。石珊瑚是可以存活数百年的动物，人们一直认为它们从体细胞组织中产生配子。为了澄清关于珊瑚生殖系-体细胞区别的相互矛盾的证据，我们对亲本珊瑚分支及其精子库进行了高覆盖率的全基因组测序和技术重复。我们确定了每个亲本分支独有的胚胎后单核苷酸变异 (SNV)，然后检查每个 SNV 是否由各自的精子库共享。26% 的胚胎后 SNV 由精子共享，74% 则不是。我们还确定了生殖系 SNV，即存在于精子中但不存在于亲本中的 SNV。这些数据表明，自我更新的干细胞在群落的成年期会分化为生殖细胞和体细胞，而 SNV 率和模式在干细胞、体细胞和生殖细胞谱系中存在显著差异。除了为后生动物生殖细胞的进化提供信息外，这些见解还揭示了珊瑚如何产生应对全球气候变化所必需的适应性多样性。
与底栖礁藻类的四个功能群和造礁珊瑚 Montastraea annularis 相关的微生物多样性
珊瑚礁底栖生物主要由珊瑚和藻类栖息，它们经常直接竞争空间。大量研究表明，珊瑚伴生细菌与周围海水不同，并且至少部分是物种特异性的（即同一种珊瑚上有同一种细菌）。在这里，我们将这些微生物研究扩展到珊瑚礁中发现的四种主要藻类生态功能群：直立和包覆钙化藻、肉质藻和草皮藻，并将结果与在造礁珊瑚 Montastraea annularis 上发现的群落进行比较。使用 16S rDNA 标签焦磷酸测序发现，不同的藻类属含有特征性的细菌群落，这些群落通常比珊瑚上的细菌群落更加多样化。虽然大多数与珊瑚有关的细菌与已知的异养生物有关，主要消耗富含碳的珊瑚粘液，但与藻类有关的群落含有大量自养生物。大多数与藻类有关的自养细菌是蓝藻，可能对藻类的氮循环很重要。与藻类相关的光合真核生物也种类丰富，包括
在大脑珊瑚地形中记录的火星的最新气候变化。 A. M. Morgan 1，A。M. Morgan 1，K。A. Pearson 2，E。Z. Noe Dobrea 1和A. Alti
简介：推定冰川地形在火星上的分布和形态为亚马逊晚期的气候历史提供了宝贵的视觉。同心火山口填充（CCF），小叶碎屑围裙（LDA）和线条谷填充（LVF），所有这些都被认为是碎屑覆盖的冰川沉积物[1]，[2]，[3]，[3]，[4]，通常被其核心地形覆盖，并以其核心地形命名，其重新层次的人类大脑或水平的人类大脑coral brancal braintal to Aqualtic to Aqualtic coral coral coral coral coral coral coral coral coral coral coral coral coral coral。提出的针对大脑珊瑚地形的形成机制包括粉尘丰富的冰矿床的升华[2]，升华和灰尘填充的循环[5]，或由冻结冻结产生的岩石分类过程，类似于地球上排序的石头圈子[6]。后者将暗示偶发性融化，并具有关于火星近地面可居住性的天文学含义。大脑珊瑚降雨表面可以追溯到晚期亚马逊人[2]，[5]，[7]，尽管以前的研究受到了小型研究领域的阻碍，并且高分辨率的Hirise Hirise图像的可用性受到了阻碍。我们通过采用了一种新颖的深度学习方法来建立这些先前的研究，可以有效地绘制整个火星表面的脑珊瑚地形[8]，在这里，我们使用火山口统计来解释火星最近的地质和气候历史。
电流，海浪波和范围波的贡献对跨珊瑚礁 - lagoon系统的悬浮服务的运输
抽象的珊瑚礁产生了大量碳酸盐沉积物，在整个礁石局部系统中被重新分布。然而，几乎没有理解在整个礁石系统中运输在珊瑚礁外部产生的这种沉积物的特定过程。此外，尚未完全了解的电流，海溶波和省级波浪的独立贡献，这些贡献都不完全了解受礁石的存在的强烈影响。 在这里，我们表明，在礁石系统中，大多数悬浮的沉积物在海床附近运输，有时在振荡性流量过渡期间（即，在海上波浪波频率下的振荡流过渡时（即接近松弛的流动）以及在近海振荡速度阶段的振荡流过渡期间（即接近松弛的流动）在Instellagravity波波频率处悬浮较高。 这些波频率分别有助于悬挂式沉积物的离岸和陆上的运输，但净通量很小。 平均电流是主要的运输机制，并且比Sea-Swell和Instragravity Wave造成了近2个数量级的悬浮液通量。 虽然波可能不是沉积物运输的主要机制，但我们的结果表明它们是海底悬浮液的重要驱动力，并且有助于从礁石到海岸线的沉积物谷物尺寸分配。 随着海浪气候的变化，海平面的上升以及珊瑚礁底栖群落的组成变化，平均电流，海浪波和北极波波的相对重要性可能会发生变化，这将影响在整个礁林系统中重新分布沉积物的方式。的电流，海溶波和省级波浪的独立贡献，这些贡献都不完全了解受礁石的存在的强烈影响。在这里，我们表明，在礁石系统中，大多数悬浮的沉积物在海床附近运输，有时在振荡性流量过渡期间（即，在海上波浪波频率下的振荡流过渡时（即接近松弛的流动）以及在近海振荡速度阶段的振荡流过渡期间（即接近松弛的流动）在Instellagravity波波频率处悬浮较高。这些波频率分别有助于悬挂式沉积物的离岸和陆上的运输，但净通量很小。平均电流是主要的运输机制，并且比Sea-Swell和Instragravity Wave造成了近2个数量级的悬浮液通量。虽然波可能不是沉积物运输的主要机制，但我们的结果表明它们是海底悬浮液的重要驱动力，并且有助于从礁石到海岸线的沉积物谷物尺寸分配。随着海浪气候的变化，海平面的上升以及珊瑚礁底栖群落的组成变化，平均电流，海浪波和北极波波的相对重要性可能会发生变化，这将影响在整个礁林系统中重新分布沉积物的方式。