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SARS-CoV-2 基因组中的短序列基序动态表明胞嘧啶脱氨在 CpG 减少中起着作用
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可下可用（未经同行评审认证）是作者/资助者，他已授予 bioRxiv 永久展示预印本的许可。它是此预印本的版权持有者此版本于 2021 年 1 月 5 日发布。；https://doi.org/10.1101/2020.06.19.161687 doi：bioRxiv 预印本
ECpE 课程列表 (最新修订: 8/2020)
一般技能课程：至少选择两门，且必须来自不同的组： 第 1 组：（概率、统计等）EE 523、Stat 483/583、Stat 500、Stat 512、Stat 588 第 2 组：（算法、建模等）CprE 528、CprE 582、ComS 511 第 3 组：（优化、图论等）EE 571、IE 510、IE 519、IE 534 第 4 组：（机器学习）COM S 578、EE 525、EE 526
温度敏感性CRISPR/LBCPF1
棉花（山地山脉）是一种相物倍增的物种，是一种典型的嗜热作物，可以在高达45°C的温度下生存并良好地生存，CRISPR/LBCPF1（LBCAS12A）是一种用于植物基因组的温度敏感系统（Malzahn ext after，atsco），并且对海上的疾病（SO）易于persiante，又是一种含量（Malzahn et af。和棉花（Lee等，2019; Li等，2018; Tang等，2017; Xu等，2019）。但是，尚未在高温耐药作物的棉花中测试LBCPF1的温度敏感性。为了提高LBCPF1效率并确定棉花基因组编辑的最佳温度，我们研究了不同温度对LBCPF1活性和基因组编辑效率的影响。此外，我们创建了没有棉醇的种子的非转基因和无腺棉花植物，代表了棉花育种的宝贵种质资源。
CRISPR-Cpf1 激活内源性 BMP4 基因促进脐带间充质干细胞成骨分化
CRISPR 系统提供了强大的基因组编辑工具，广泛应用于生物和医学研究领域。然而，由于 CRISPR 的脱靶效应而产生的安全问题一直是其应用于再生医学的主要障碍之一。传统的 CRISPR 系统存在通过错误的双链 DNA 断裂 (DSB) 在非目标基因组位点诱发不可预测突变的内在危险。在本研究中，我们展示了一种最近发现的 CRISPR-Cpf1 的安全增强应用，用于靶向基因激活，而不会导致 DNA 双链断裂，从而促进人脐带间充质干细胞 (UC-MSC) 的成骨分化。为此，我们开发了一种与三部分转录激活域 (dAsCpf1-VPR) 融合的催化无活性 AsCpf1，可诱导哺乳动物细胞中靶基因表达的上调。我们观察到 CRISPR-dAsCpf1-VPR 激活剂可通过增加内源性 BMP4 基因的表达水平来增强人类 UC-MSCs 的成骨分化。结果表明 CRISPR-Cpf1 激活剂为骨再生和再生医学提供了多种方法。
CRISPR/Cpf1 系统的兴起，助力植物高效基因组编辑
Cpf1 是 2 类 CRISPR 家族的内切酶，它填补了 TALEN、ZFN 和 CRISPR/Cas9 等基因组工程工具领域之前面临的空白。其他同时发现的核酸酶无法在同一区域进行重新工程，因为首次工程后会丢失靶位点。Cpf1 充当双核酸酶，既可作为内切核糖核酸酶处理 crRNA，又可作为内切脱氧核糖核酸酶切割靶序列并产生双链断裂。此外，Cpf1 允许多重基因组编辑，因为单个 crRNA 阵列转录本可以靶向基因组中的多个基因座。CRISPR/Cpf1 系统可在单子叶植物和双子叶植物中进行基因删除、插入、碱基编辑和基因座标记，且脱靶效应更少。该工具已在烟草、水稻、大豆、小麦等作物中得到有效验证。本综述介绍了Cpf1介导的基因组编辑技术在植物中的开发和应用。
合成 HDL 纳米粒子递送多西他赛和 CpG 用于结肠腺癌的化学免疫治疗
摘要：结肠癌占所有结直肠癌的三分之二以上，总 5 年生存率为 64%，当癌症发生转移时，这一比例迅速下降到 14%。根据结肠癌诊断时的分期，患者可以接受手术以尝试完全切除肿瘤，或直接使用一种或多种药物进行化疗。与大多数癌症一样，结肠癌并不总是对化疗有反应，因此已经开发了靶向疗法和免疫疗法来辅助化疗。我们报告了一种结肠癌局部联合疗法的开发，其中化疗和免疫治疗实体被递送到肿瘤内以最大限度地提高疗效并最大限度地减少靶向副作用。疏水性化疗剂多西他赛 (DTX) 和胆固醇修饰的 Toll 样受体 9 (TLR9) 激动剂 CpG (cho-CpG) 寡核苷酸共同装载在合成 HDL (sHDL) 纳米盘中。用 DTX-sHDL / CpG 进行肿瘤内治疗的 MC-38 肿瘤小鼠的体内生存分析（中位生存期；MS = 43 天）表明，与用单一药物、游离 DTX（MS = 23 天，p < 0.0001）或 DTX-sHDL（MS = 28 天，p < 0.0001）治疗的小鼠相比，总体生存率显著提高。用 DTX-sHDL / CpG 治疗的七只小鼠中有两只肿瘤完全消退。所有小鼠均未出现任何全身毒性，体重维持和血清酶和蛋白质水平正常。总之，我们已经证明化疗和免疫疗法可以共同加载到 sHDL 中，局部递送到肿瘤，并且与单独化疗相比，可用于显着改善生存结果。
基因组编辑-Alt -R为CAS12A（CPF1）超核酸酶-Net
图1。Alt-R A.S. CAS12A超蛋白在TTTV目标位点选择方面表现出卓越的性能。 DOTS代表了216个指南的等级编辑效率，该指南靶向TTTV（深色阴影）或TTTN（浅色阴影）PAM站点，并且在输送到HEK-293细胞（96个位点）和陪同下（96个位点）和陪同细胞（96个位点）和野生型CAS12A V3（绿色）V3（绿色）或Cas12a Ultra（蓝色）。 如Alt-R CRISPR-CAS12A用户指南中所指示的RNP 人类细胞使用4D-Nucleofector™System（LONZA）的RNP电穿孔。 使用NGS（Rhampseq Amplicon测序）进行电穿孔后48小时编辑效率。Alt-R A.S. CAS12A超蛋白在TTTV目标位点选择方面表现出卓越的性能。DOTS代表了216个指南的等级编辑效率，该指南靶向TTTV（深色阴影）或TTTN（浅色阴影）PAM站点，并且在输送到HEK-293细胞（96个位点）和陪同下（96个位点）和陪同细胞（96个位点）和野生型CAS12A V3（绿色）V3（绿色）或Cas12a Ultra（蓝色）。人类细胞使用4D-Nucleofector™System（LONZA）的RNP电穿孔。使用NGS（Rhampseq Amplicon测序）进行电穿孔后48小时编辑效率。编辑效率。
CpG DNA的免疫活性及应用前景
[20]MccluskIe MJ，Davis H1． ． cpG DNA㈣potent enhancer 0f 8ystemi㈨d洲osal㈣une respo—s ngainst hepatitIs B surfa㈣ntIg洲“h mtrana蛆l admini8tration to mice J I响u—
克隆，表征和表达的大肠杆菌中的CpG DNA甲基酶的基因中的大肠杆菌中的克隆，表征和表达。菌株MQ1（M SSSI）
摘要我们在这里描述了从螺旋体SP中编码DNA甲基化酶的基因大肠杆菌中的克隆，表征和表达。菌株MQ1（M * SSSI）。该酶完全和仅CPG序列（1）。使用其自身的启动子在E.盘管中转录螺旋质基因。整个消息的翻译需要使用蛋白石抑制器，这表明UGA三胞胎代码用于螺旋形的色氨酸代码。对基因的序列分析在1158 bp的长开放式阅读框架中揭示了几个UGA三胞胎。在M SSSI中揭示的推导的氨基酸序列所有共同结构域的特征是细菌胞嘧啶DNA甲基酶的特征。尽管具有共同的序列特异性，但M SSSI的推定序列识别域与小鼠DNA甲基化酶的相似性没有明显的相似性。克隆的甲基化酶在体内和体外均仅CpG序列。与主要是维持甲基酶的哺乳动物酶相比，MSSI显示了从头开始的甲基化酶活性，这是原核生物胞嘧啶DNA甲基化酶的特征。
年度报告 - Cprf.org
我们的轮椅和姿势座椅诊所可满足有身体残疾的成人和儿童的需求，制造适合每个人需求和生活方式的定制椅子。我们的座椅系统旨在提高舒适度、提供更好的身体姿势并最大限度地降低压疮风险，从手动座椅到复杂的电动轮椅一应俱全。物理治疗师和职业治疗师随时为每位客户提供服务，以确保我们打造出最好的座椅系统。我们所有的轮椅座椅系统均由拥有数十年专业经验的技术人员内部制造。技术人员和治疗师共同努力，确保每位客户都能获得最适合他们活动能力、舒适度和独立性的最佳座椅。我们与堪萨斯州塞奇威克县特殊医疗保健儿童卫生和环境服务部、平原联合之路、地区联合之路组织的合作和支持以及慷慨捐赠使诊所能够成为客户的宝贵全州资源。