。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供(未经同行评审认证),作者/资助者已授予 bioRxiv 许可,可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2024 年 2 月 3 日发布了此版本。;https://doi.org/10.1101/2024.02.02.578725 doi:bioRxiv 预印本
。cc-by-nd 4.0国际许可证(未经同行评审证明)获得的是作者/资助者,他已授予Biorxiv的许可证,以永久显示预印本。这是该版本的版权持有人,该版本发布于2024年11月8日。 https://doi.org/10.1101/2024.08.06.606879 doi:Biorxiv Preprint
此预印本版的版权持有人于2024年6月14日发布。 https://doi.org/10.1101/2024.06.12.598760 doi:Biorxiv Preprint
Neoformans是真菌性脑膜炎的最常见原因,是一种基础性菌群单倍体发芽的酵母,具有完整的性周期。通过生物学转化和长长的同源臂,通过同源重组进行基因组修饰是可行的,但是该方法是艰巨而不可靠的。最近,多个小组报道了使用CRISPR-CAS9作为生物学的替代方案,但仍然有必要使用长期的HOMOLOG ARM,从而限制了该方法的实用性。由于在先前研究中使用的链球菌CAS9衍生物在Neoformans中没有选择用于表达,因此我们设计,合成并测试了全梭状芽胞杆菌(C. neoformans)的全念珠菌(CNO)Cas9。我们发现,CAS9仅带有常见的Neoformans密码子和共有的C. Neoformans内含子以及TEF1启动子和终结器以及核定位信号(CNO Cas9或“ CNOCAS9”)可靠地可靠地在C. Neoformans菌株中可靠地编辑基因组。此外,使用带有短(50bp)同源臂的供体来完成编辑,这些捐赠者附着于标记DNA上,这些供体与合成的寡核苷酸和PCR扩增一起产生。我们还证明,先前的CNOCAS9稳定整合进一步增强了转移和同源重组效率。重要的是,这种操作不会影响动物的毒力。我们还建立了一个通用标记的模块,该模块具有密码子优化的荧光蛋白(Mneongreen)和一个串联的钙调蛋白结合肽-2X标志标签,允许对蛋白质进行本地化和纯化研究,以对相应的基因进行简短授权的重新构造对相应的基因进行修改。这些工具使Neoformans中的短体系基因组工程能够。
在。 Gatunek DV BSL RG总和D10 D50 S20 s20 ls ls lu 1 aureobasidium pallulans(de bary&löwenthal) 1 3 barnettozyma californica(Lodder)Kurtzman,Robnett&Bas.-Powers 2008 A 1 1 12 7 5 11 1 8 4 8 4 2 0 1 9 4 **念珠菌罐(CP Robin)Berkhout 1923 A 2 2 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 1 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 0 5 ** NAKASEMOMESOMESMOMESMOMYSOMYSOMESMOMYSMOMYSOMYSOMY CLABRASSMOMYSMOMYSMOMYSMOMYSMOMYSMOMYSMOMYSMOMYSMOMASE glabratus(HWAS) 9 0 5 1 6 6 pseudolambica SM。米尔。 1979(无性型:Candida lusitaniae) A 2 2 1 1 0 0 1 1 0 0 1 0 0 0 1 9 Cryptococcus amylolentus(Van der Walt,DB Scott 和 Klift)Golubev 1981 B 1 1 4 1 3 1 0 4 0 4 3 0 1 0 Cryptococcus uniguttulatus(Wolfram 和 Zach)Phaff 和 Fell 1970 B 1 1 1 1 0 1 0 0 1 0 1 0 1 0 11 Cutaneotrichosporon jirovecii(Fragner)Xin Zhan Liu,FY Bai,M. Groenew。 & Boekhout 2015 B 2 2 16 8 8 12 4 4 12 15 1 4 6 1 5
• Eden Anderson – “通过工程酵母测定 Stones River 流域的雌激素污染”(2023 年 9 月至今)。 • Karmina Ghobrial – “探索咖啡银皮提取物在紫外线诱导的氧化应激期间对年龄相关基因 DVE-1/SATB1 的影响”(2023 年 9 月 - 2024 年 4 月)。 • Lacon Parton – “Stones River 流域的抗生素耐药性 eDNA”(2022 年 1 月 - 2023 年 10 月) • Alaa Mohammed -“对病原体新型隐球菌中涉及黑色素生成的基因的循证注释修订。”(2019 年 9 月 - 2021 年 4 月)。 • Chase Burton “提高真菌病原体新型隐球菌荚膜形成基因的基因模型准确性。” (2019 年 9 月 - 2020 年 11 月)。 • Niah Frantzen - “新型隐球菌感染小鼠巨噬细胞的差异表达基因分析。”(2019 年 1 月 - 2020 年 11 月)。 • Russell Walden - “玉米氮效率基因的循证管理。”(2020 年 1 月 - 2020 年 11 月 20 日)。
87483 通过核酸(DNA 或 RNA)检测传染性病原体;中枢神经系统病原体(例如脑膜炎奈瑟菌、肺炎链球菌、李斯特菌、流感嗜血杆菌、大肠杆菌、无乳链球菌、肠道病毒、人类副肠孤病毒、1 型和 2 型单纯疱疹病毒、人类疱疹病毒 6 型、巨细胞病毒、水痘带状疱疹病毒、隐球菌),包括多重逆转录(如果执行)和多重扩增探针技术、多种类型或亚型、12-25 个目标
PING CHEN 葡萄糖-PTS 调节甘油代谢和过氧化氢介导的血链球菌竞争 FABIANA ROGLIERO 新型聚氨酯基聚合物材料在运动护齿制造中的生物相容性 ANH HAO DANG 重新定位 FDA 批准的抗抑郁药 2-PCPA 以治疗牙周炎 ADRIAN REQUEJO 小鼠脑部感染新生隐球菌后星形胶质细胞的强效活化 ANJALI SONI 利用虚拟和增强现实技术彻底改变正畸教育、诊断和治疗计划 EDISON N. TRAN CRISPR-Cas 系统可以调节 PGN_1547:牙龈卟啉单胞菌 ATCC 33277 中的一种新的假设毒力因子 BEN L. OFRI 了解心理弹性对医疗干预期间患者幸福感的影响DANNIEL PHAM 血链球菌葡萄糖-PTS 的遗传特征,检测其竞争力和适应度 THOMAS DUARTE 使用机器学习和非破坏性检测来预测定制护齿套的机械性能 TUSHAR DESARAJU 探索 TLR2 信号对 TLR2-/- 小鼠生态时间序列多菌牙周感染后牙槽骨吸收的影响 ASHITHA YADA TLR2-/- 小鼠生态时间序列多菌牙周感染 (ETSPPI) 后的牙周细菌传播 GRACE ADAMS Cbp+ 变形链球菌与老年人根龋的关联 RAFAEL GARCIA 新型隐球菌葡萄糖醛酸木甘露聚糖通过抑制嘌呤能来损害小胶质细胞趋化性受体
PPU Pasteur – classic ( apply ) #1 PhD Project Title: Microbiota-additives interaction mapping and mechanisms for personalized nutrition in the healthy and diseased populations PhD Supervisor: Benoit Chassaing Laboratory Team name: Microbiome-Host Interactions #2 PhD Project Title: Exploring the dual role of CD98 in human erythropoiesis and Plasmodium vivax infection PhD Supervisor: Sylvie Garcia Laboratory Team name: Biology of Plasmodium Infection and Transmission #3 PhD Project Title: Coordination of nuclear and cytoplasmic RNA quality control mechanisms in Cryptococcus neoformans PhD Supervisor: Cosmin Saveanu Laboratory Team name: RNA Biology of Fungal Pathogens #4 PhD Project Title: Characterization of streamlined envelope stress response mechanisms in non-model DIDERM细菌博士学位主管:Christophe Beloin实验室团队名称:Génétiquedes Biofifms#5博士学位项目标题:基因 - 环境对共同人类疾病的贡献锥虫博士主管:露西·格洛弗实验室团队名称:TMB