用于对狗微生物组进行宏基因组分析的数据库的开发:一种采用 KRAKEN2 和 BOWTIE2 的方法 PAULO SALLAROLA TAKAO;帕梅拉·苏萨·科里亚;胡利奥·弗朗茨·莫拉大卫·阿西奥莱·巴博萨; FABIANO BEZERRA MENEGIDIO 摘要 宏基因组分析在了解微生物群落及其环境影响方面发挥着至关重要的作用,在兽医学中对于宠物疾病的诊断、治疗和预防具有特殊意义。这项研究旨在为 Bowtie2 和 Kraken2 工具创建集成数据库,将狗和人类基因组整合成最新且易于访问的资源。随着技术的进步,微生物组的宏基因组分析已成为兽医日常工作中一种很有前途的工具,特别是考虑到兽医诊所中狗的普及率很高,仅在巴西就有大约 5810 万只狗,是家庭中第二大宠物,仅次于鸟类。然而,必要的生物信息学步骤(例如去除宿主基因组和人类污染物)需要大量时间和计算资源。为了克服这一挑战,我们为每种工具开发了特定的数据库,大大减少了分析时间并确保基因组的持续更新。虽然 Bowtie2 执行精确序列比对,但 Kraken2 使用较小的序列(k-mers)进行更快、更有效的分类学分类。数据库构建后,对犬类宏基因组文库进行了测试,结果显示比对率较高,且能有效去除与狗或人类相关的读段。尽管由于缺乏详细的文献而面临挑战,但创建的数据库被证明是可行且可重复的,为未来兽医宏基因组分析研究做出了重大贡献。关键词:家狼,宏基因组,Kraken2-build,Bowtie2-build,污染物。 1 引言 宏基因组分析是对宏基因组进行分类的过程(MARCHESI;RAVEL,2015),宏基因组是基因组学的衍生词,是研究生物体基因的学科。从字面上翻译,宏基因组学是“超越基因组的”,也就是说,在宏基因组学中我们不仅分析一个基因组,还分析样本中包含的所有基因组(GILBERT;DUPONT,2011)。这些基因组可以来自微生物,甚至可以是环境(样本)中的游离 DNA 片段、微生物结构元素的基因、病毒、噬菌体、毒素和其他所有具有遗传物质的东西(BERG 等人,2020 年;HANDELSMAN 等人,1998 年;MERRIAM-WEBSTER,2023 年;WHIPPS;LEWIS;COOKE,1988 年)。那么我们可以将宏基因组分析描述为对给定条件下的微生物基因组集合及其环境条件的分析
Ritter University Center AV。 Manoel Elias,2001年,Passo Das Pedras,Porto Alegre/rs iesRitter University Center AV。Manoel Elias,2001年,Passo Das Pedras,Porto Alegre/rs ies
摘要肥胖是一种以脂肪组织过量为特征的慢性疾病。除了对生活质量的影响外,其他各种病理的加重和发展的风险也会增加。因此,必须采用多因素方法采用有效的治疗方法。治疗肥胖症的第一次干预涉及非药理学措施。但是,当未达到令人满意的结果时,需要引入药理学疗法,评估该药物的风险效益作为患者的函数。当前可用于治疗该病理的药物数量很少,但是一些有效的替代方法开始批准,并且研究和开发促进该治疗区域创新的新分子至关重要。对非医学卫生专业人员对这些药物的作用的了解,即营养学家对患者的多学科方法的成功至关重要,因此对这些相同药物的修改,其机制和谨慎的谨慎,要考虑到决策树形式。
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本(未经同行评审认证)提供的,他已授予Biorxiv的许可证,以在2025年1月27日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2025.01.24.634677 doi:biorxiv preprint
目标:过度活跃的膀胱(OAB)是一种与与局部组织炎症相关的过度活动相关的常见泌尿科障碍,导致膀胱超敏反应。本研究的目的是在一种抗糖尿病药物(CP)诱导的OAB的小鼠模型中研究一种具有抗炎作用的抗糖尿病药物的治疗潜力。材料和方法:为了诱导OAB的动物模型,雌性BALB/C小鼠每两天注射CP(80 mg/kg),持续7天。然后,连续7天,用盐水(OAB模型),VIL(10或50 mg/kg/day)或溶脂素(10 mg/kg/day)口服小鼠。在实验的第17天,使用孤立的小鼠肌肉肌肉进行器官舱实验,以评估组织收缩力。在另一组小鼠中,通过埃文斯蓝色渗出评估膀胱炎症。结果和讨论:Carbachol诱导的OAB小鼠的迫切条带的收缩显着增加,这是通过50 mg/kg或溶脂素的VIL治疗反转的。此外,VIL处理(50 mg/kg)减少了相对膀胱重量,Evans蓝色染料渗入在注入CP的小鼠的膀胱中,表明VIL对CP诱导的膀胱炎症的抑制作用。我们的结果表明,VIL通过部分抑制膀胱炎症来改善CP诱导的OAB的小鼠模型中的偏压过度活动。关键字:膀胱炎症,逼尿肌,埃文斯蓝色,过度活跃的膀胱,溶脂素,vildagliptin
开发正电子发射断层扫描示踪剂以检测错误折叠的聚集体SYN将彻底改变早期诊断,疾病监测和评估治疗功效。在这里,我们介绍了[11 C] MODAG-005的体外和体内验证的发育和临床前的验证。体外结合实验证明了与重组纤维纤维以及人脑组织中的syn夹杂物的亚洋摩尔结合亲和力。使用自显影和微动摄影术检测到多系统萎缩(MSA)脑组织中的特异性结合,并通过免疫染色进行了验证。体内,[11 C]模量-005显示出良好的脑穿透性,脑组织的快速清除以及啮齿动物和非人类灵长类动物的代谢产物低的代谢产物形成。此外,在syn fibril注射的大鼠模型和syn(A30p)转基因小鼠模型中,在与病理载荷相关的syn fibril大鼠模型中达到了明显的结合和良好的信噪比。为了验证其在治疗发展中的价值,我们显示了候选药物Anle138b在SYN(A30p)小鼠和MSA的脑组织中的目标参与,以及在syn fibril注射的大鼠中的体内。最后,我们在临床上建立MSA的第一个人类患者中的翻译方法显示,在受Syn病理学影响的区域中,示踪剂的结合具有明显的示踪剂结合,尤其是在纹状体中,该模式与多巴胺转运蛋白转运蛋白转运蛋白单光子发射计算机进行计算计算计算机的神经变性相对应。目前仅通过验尸尸检才有可能进行确定的诊断[1]。在阿尔茨海默氏病(AD)中,突触核酸症,例如帕金森氏病(PD),痴呆症患有路易的身体(DLB)和多个系统萎缩(MSA),是神经退行性疾病,对我们的衰老社会构成了重大威胁。他们共同的神经病理学标志是存在错误折叠的syn的存在,它在大脑中的空间分布依赖于阶段和疾病的类型。病理学的积累开始在第一次(运动)症状发作之前的几年开始,因此将是早期检测和监测疾病进展的极好的生物标志物[2]。正电子发射断层扫描(PET)是一种非侵入性成像技术,可追溯到为体内特定生物学靶标设计的放射性标记的分子[3]。
页[3] - 什么是游戏教育学?页[6] - 为什么要玩?页[8] - 我们的播放教学教学课堂页面[12] - 元技能页面[13] - 通过Heathhall School Page [14]进行学习和教学 - Heathhall School的一天的示例 - 父母/护理人员的参与页[15] - 录制,记录,记录,记录和共享学习页面[16] - 儿童在Heathhall School/pocuts coppard
与基于合成的不可降解纤维相比,菠萝叶纤维(PALF)的聚合物复合材料的抽象开发引起了人们的兴趣。然而,亲水性PALF与疏水性的热固体和热塑性聚合物的界面粘合不良。此外,PLAF的这种亲水性质会导致更多的水分吸收率,从而导致整体性质降解。可以通过修改纤维表面来解决此问题。因此,对纤维表面修饰对各种特性的影响以及与聚合物的粘附的影响是改善PALF及其复合材料关键词的关键:菠萝叶纤维纤维土壤覆盖物 - 菠萝叶子机制的组成部分绷带 - 适应性和bordage todive toperage toseal to norder seaste kite intery seaste sisea intery sisea intery sisea interae sisea interae sisea interae sisea interaipe nestea intery sisea interaipe nestea intery sisea interaipe nestea是一个巨大的销售。菠萝叶纤维的提取正在为商业和小型生产商开辟一个市场。正在研究许多其他可能性,例如可能来自菠萝的不同纤维。[1]菠萝是一种未鉴定的果实,是热带地区原生的。可用于市场机会的新兴行业是有价值的饮食纤维。水果的纤维是多种食物的有益补充。可见在其他区域中使用的水果的微晶纤维素。泰国,菲律宾,哥斯达黎加,中国和印度是世界上增长最快的国家,以及巴西[2]。*信函的作者纤维繁荣,除了其在东北和阿萨姆地区的强大基础。可用于生产力量表的菠萝农作物种植的最大区域是阿萨姆邦。印度在这种作物的产量中领先世界,这为纤维生产带来了更多的机会。近90-95%的产品是有机的,该地区产生了全国菠萝的40%以上[3]。创建纤维和纺织品,重点是绿色环境,这是消费和生活水平的增加。从利用叶子和茎的创意项目中获得知识,最近引发了对可持续发展的关注
✉ 通讯和材料索取请发送至 Pamela C. Ronald 或 Guotian Li。pcronald@ucdavis.edu;li4@mail.hzau.edu.cn。作者贡献 GL、GS、PS 和 PCR 设计了实验。GL 和 RJ 筛选并分析了 rbl1 突变体的基因组数据。GS、PS、XK、XH、YL、YW、QG、XC 和 LZ 进行了植物感染试验。GS、XK、XH 和 YW 进行了 DAB、ROS、水杨酸、亚细胞定位、RT-qPCR 和 GUS 组织化学分析。LY 和 ZQ 进行了生物信息学分析。GS、JG、LF、LG、JCM、YB 和 QL 进行了脂质组学分析。YZ 和 YW 进行了 rbl1 的化学补充分析。 GS、QS、QG、Q. Zhou 和 T.-YC 进行了酵母突变体互补分析。JZ 和 KX 生成了 CRISPR 构建体。XK、XH、YL、W. Zhou、W. Zhang、Q. Zeng 和 ZK 筛选了编辑后的品系。GS、YW、RH 和 JX 进行了田间试验和农艺性状分析。GL 和 GS 起草了手稿,GL、GS、PS、LF、LZ、LG、KX、JCM、QL、YB、ZK 和 PCR 修改了手稿。所有作者都阅读并批准了最终手稿。
摘要糖尿病视网膜病变(DR)是糖尿病的一个严重并发症,其特征是视网膜血管的进行性损害,可导致失明。这种疾病是一个严重的公共卫生问题,全球约有三分之一的糖尿病患者受到影响,需要早期诊断和干预以防止严重的眼部并发症。本文旨在回顾 DR 的临床表现并讨论当前的治疗方法,强调影响临床实践中 DR 治疗的诊断方法和新管理策略的创新。文献综述侧重于实验和非实验研究,涉及 DR 的临床方面和治疗。数据是从 PubMed 和 SciELO 等数据库中提取的,经过精心挑选,包括相关文章并排除不相关或无法完整获得的作品。 DR 受多种风险因素影响,包括血糖控制不佳、高血压和生活方式因素。研究表明,严格控制血糖可显著降低眼部并发症的风险。光学相干断层扫描和人工智能系统等技术进步提高了诊断的准确性,有助于更及时地进行干预。治疗方法已发展到包括抗 VEGF 疗法和手术治疗,而治疗方法需要多学科的努力。 DR 需要采用多学科综合治疗方法,结合严格控制风险因素、诊断进展和特定疗法。患者教育和自我护理参与对于治疗成功至关重要。公共卫生政策应侧重于改善诊断和治疗服务的机会,特别是在欠发达地区,以应对全球日益流行的糖尿病及其并发症。医疗保健专业人员之间的持续合作对于改善健康结果和减轻 DR 负担至关重要。关键词:糖尿病视网膜病变;诊所;治疗;糖尿病;眼部并发症。