1帕里斯 - 萨克莱大学,UVSQ,UNIV。Paris-Sud, Inserm, Team " Exposome, Heredity, Cancer, and Health " , CESP, Villejuif, France 2 Nantes Université, INSERM, Center for Research in Transplantation and Translational Immunology, Nantes, France 3 Centre for Genetic Epidemiology, Institute for Clinical Epidemiology, and Applied Biometry, University of Tubingen, Tübingen, Germany 4 Department for神经退行性疾病,赫尔蒂临床脑研究所,图宾根大学,德国图宾根大学5德国5个神经退行性疾病中心(DZNE),德国Tubingen,德国6转化神经科学,卢克斯堡系统生物医学中心(LCSB),卢克斯堡,卢克斯郡,卢克斯郡, Genetics, Helmholtz Zentrum München, Neuherberg, Germany 8 Molecular Genetics Section, Laboratory of Neurogenetics, NIA, NIH, Bethesda, Maryland, USA 9 Center For Alzheimer ' s and Related Dementias, NIA, NIH, Bethesda, Maryland, USA 10 Grif fi th Institute for Drug Discovery, Grif fi th University, Nathan,昆士兰,澳大利亚昆士兰11号神经病学系,维也纳医科大学,奥地利维也纳12号神经病学系,奥地利维也纳Klinik Ottakring神经病学系13坦兹神经退行性疾病研究中心,多伦多大学多伦多大学,多伦多大学,加拿大多伦多大学,加拿大加拿大的埃德蒙·J·萨弗里亚(Edondond Shother),帕克森(Morton),帕克森(Morton),多伦多,帕克森(Morton),帕克森(Morton)。加拿大安大略省多伦多的UHN 15神经病学系,多伦多大学多伦多大学,加拿大安大略省,加拿大安大略省16克里姆比尔脑研究所,多伦多,多伦多,安大略省,加拿大,加拿大17分子医学和创新疗法中心,
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目标:包容体肌炎(IBM)是老年人的进行性炎症性肌肉疾病,一些患者产生抗胞质5' - 核苷酸酶1A(NT5C1A,又名CN1A)抗体。人类白细胞抗原(HLA)是发展IBM的最高遗传危险因素。在这项研究中,我们旨在进一步定义HLA等位基因对IBM的贡献和抗CN1A抗体的产生。方法:我们使用Illumina下一代测序进行了113名高加索IBM患者的西澳大利亚人队列和112个种族匹配的对照。使用Genentech/Midas生物信息学包装进行等位基因频率分析和氨基酸对齐。等位基因频率。使用GGSTATSPLOT软件包进行了发作分析时的年龄。所有分析均在RSTUDIO版本1.4.1717中进行。结果:我们的发现验证了HLA-DRB1*03:01:01与IBM的独立关联,并将风险归因于DRβ1蛋白中位置74中的精氨酸残基。相反,DRB4*01:01:01和DQA1*01:02:01具有保护作用;不具备这些等位基因的DRB1*03:01:01的载体增加了IBM在普通高加索人群中发展的14倍。此外,上述基因型的患者平均比没有患者的患者早五年更早出现症状。我们没有发现与抗CN1A抗体产生的HLA关联。结论:高分辨率HLA测序更精确地表征了与IBM相关的等位基因,并定义了与早期疾病发作相关的单倍型。通过对免疫遗传学数据的高级生物统计分析来识别关键氨基酸残基,提供了机械洞察力和未来的方向,以发现IBM AetioPADENESECHESED。
