内生菌是生活在植物组织中的微生物。由于他们与宿主的亲密关联,他们可以对植物生理产生强大的影响(Hardoim等,2008; Johnston-Monje和Raizada,2011; Hardoim等,Hardoim等,2012; Hardoim等,2015; Truyens等,2015)。内生菌可以通过提供养分,增加营养摄取,调节和分泌植物素的养分来促进植物生长,并防御植物的病原体(Hu等,2003; Johnston-Monje和Raizada,2011; Mousa et al。,2016; Shehata等,2017,2017年)。植物似乎选择了特定的内生菌,尤其是在幼苗出现期间,这些内生植物可能由种子跨几代人培养,以保护幼苗免受环境压力的影响(Truyens等,2015; Pitzschke,2016; 2016; Shahzad et al。例如,少年玉米植物中内生菌种的显着部分是种子来源的,并从其含种子的父母继承(Johnston-Monje等,2014; Johnston-Monje等,2016)。与植物相关的微生物群可以源自环境和父母,尽管每个人的相对贡献并不总是很清楚(Aleklett和Hart,2013年)。一些微生物内生菌似乎在被子植物,与土壤环境无关,甚至在无菌底物上生长时都广泛保守。这表明至少某些植物相关的微生物是种子衍生的(Johnston-Monje等,2014,Johnston-Monje等,2021)。此外,发现杆菌的特异性细菌被发现是所有研究的所有大麻基因型的内生细菌。此外,有些植物似乎具有“核心”微生物群,这些植物对物种的大多数人来说都是共有的(Sánchez-lóPez等,2018)(Johnston-Monje等,2014; Truyens等,2015; Walitang et al。,2018)。最近第一次证明了大麻中种子传播微生物遗传的这种现象(Dumigan和Deyholos,2022年)。这项研究表明,在加拿大西部的多个位置生长的大麻和药物大麻品种载体生物活性和抗真菌性内生细菌,再到下一代幼苗。然而,这项先前的研究仅限于可培养的微生物,并且是在轴原条件下进行的,因此未测试土壤对内生微生物组的影响。用于加拿大医疗和娱乐市场的药物大麻植物通常在Soilless培养基中生长。这为种植者提供了对可以从土壤转移的病原体的更多控制。然而,它还限制了可能是土壤的潜在有益的微生物,并可能无意中改变了大麻植物的微生物组。一个重要的问题来自这个很大程度上未研究的主题:土壤和种子衍生因素对大麻幼苗内生菌社区组成的相对影响是什么?在当前的研究中,我们假设土壤将对大麻幼苗endosphere的微生物组产生显着影响,而大麻幼苗的胚芽细菌的组成部分将来自种子 - 生物元素细菌,与土壤条件无关。我们使用基于16S的扩增子宏基因组学测试了这一假设,以比较两种土壤类型的作用,无论是否有或没有灭菌,对三种不同的大麻基因型中的endosphere微生物组组成。