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World File Search SystemEubacterium
剥削1型毒素 - 抗毒素系统作为乙酰基菌群中基因组编辑的诱导型反选择标记
摘要：先前已使用基于CRISPR的诱变方法获得了厌氧甲基菌质细菌中的靶向突变。在这项研究中，将来自Callanderi的RELB家庭毒素放置在甲型苯乙烯敏感启动子的控制之下，形成可诱导的反选择系统。该诱导系统与非复制性整合诱变载体相结合，以在limosum b2的Eubacterium B2中创建精确的基因缺失。这项研究中针对的基因是编码组氨酸生物合成基因HISI，甲醇甲醇转移酶和类cor我蛋白MTAA和MTAC的基因，以及编码MTTB-氨基甲基转移酶的MTCB，先前显示出MTTB-FAMILY甲基转移酶。HISI内的有针对性的缺失带来了预期的组氨酸成可营养，MTAA和MTAC的缺失都废除了甲醇的自养生长。MTCB的缺失被证明是消除了Limosum在L-肉碱上的生长。 在隔离转化菌落的初始选择步骤之后，仅需要一个单个诱导步骤才能获得所需靶标的突变菌落。 可诱导的反选择标记和非复制综合质粒的组合可以快速地编辑大肠杆菌。MTCB的缺失被证明是消除了Limosum在L-肉碱上的生长。在隔离转化菌落的初始选择步骤之后，仅需要一个单个诱导步骤才能获得所需靶标的突变菌落。可诱导的反选择标记和非复制综合质粒的组合可以快速地编辑大肠杆菌。
完善肠道菌群与常见血液学恶性肿瘤之间的关系：双向Mendelian随机研究的见解
Results: Through forward and reverse MR analyses, we found the risk of lymphoid leukemia was signi fi cantly associated with the abundance of phylum Cyanobacteria, order Methanobacteriales, class Methanobacteria, family Peptococcaceae, family Methanobacteriaceae, and genera Lachnospiraceae UCG010, Methanobrevibacter, Eubacterium brachy组和丁二维伯里奥（Butyrivibrio）。The risk of myeloid leukemia was signi fi cantly associated with the abundance of phylum Actinobacteria, phylum Firmicutes, order Bi fi dobacteriales, order Clostridiales, class Actinobacteria, class Gammaproteobacteria, class Clostridia, family Bi fi dobacteriaceae, and genera Fusicatenibacter, Eubacterium Hallii Group，Blautia，Collinsella，Ruminococcus Gauvreauii组和双杆菌。Hodgkin淋巴瘤的风险与丰富的梭子座Vadinb60组，peptocococus属和Ruminococcaccaceae UCG010属显着相关。恶性等离子体细胞肿瘤的风险与丰富的Romboutsia属和卵细菌的丰度显着相关。弥漫性大B细胞淋巴瘤的风险与丰富的Erysipelatoclostridium和Eubacterium coprostanolostanoligenes组显着相关。成熟T/NK单元的风险
暴露于环境有毒物质与肠道微生物组营养不良，胰岛素抵抗和肥胖有关
环境有毒物质（ETS）与不利的健康结果有关。在这里，我们假设向ETS的博览会调查与肥胖和胰岛素抵抗有关，部分通过失调的肠道菌群和次级胆汁酸血清水平的变化（BAS）有关。血清BAS，每氟烷基物质（PFA）和另外27个ET通过264个DANES（121名男性和143名女性，56.6±7.3岁的女性，BMI 29.7±6.0 kg/m 2）的质谱测量，使用靶标和均匀的筛查方法组合。根据从粪便样品中提取的DNA的全基因组shot枪测序（WGS）鉴定出细菌种类。开发了肠道微生物群落的个性化基因组规模代谢模型（GEM），以阐明BA途径的调节。随后，我们将人类研究的发现与PPARα人性化的小鼠暴露于全氟辛酸（PFOA）的代谢意义。十二个ET的血清水平与肥胖和胰岛素抵抗有关。高化学暴露与几种细菌物种的丰度增加有关（spp。）属（Anaerotruncus，alistipes，bacteroides，Bifidobacterium，梭状芽胞杆菌，Dorea，Eubacterium，Eubacterium，Escherichia，Prevotella，Prevotella，Ruminocococcus，Roseburia，subdoligranulum和Veillonella），尤其是男性。相反，较高暴露组的女性显示出
运动员的微生物组：其特征和多样性
摘要。运动员的微生物组在研究人员中最感兴趣，因为结肠的微生物组成在养分的吸收，维生素的合成和宿主体内的免疫反应中起着关键作用。这篇综述的目的是研究高性能运动员中的肠道微生物群与低活动性生活方式的人之间的关系，以及这些变化对与运动员的身体表现和运动表现相关的微生物代谢产生的影响。总共分析了42篇研究论文，其中包括11项专业研究，研究了不同类型的强烈体育活动对肠道微生物组成的影响，以及19项研究的重点是个人细菌和身体性能的相关性。肠道微生物组成已被发现与运动表现有关，并且可能会提高性能和恢复。体育活动已被证明会增加α多样性和微生物代谢产物，例如短链脂肪酸。运动之间的α多样性没有显着差异。运动员的微生物组的特征是较高量的短链脂肪酸，这可以是运动过程中的能量底物。短链脂肪酸的产生与直肠菌群spp有关。，粪便核酸杆菌。运动员的微生物组也证明了Prevotella spp。的存在，在运动员中，这可能与表现相关。已经表明，运动员中的Veillonella antypica的存在与耐力正相关。尽管发现这一发现是矛盾的，但专门从事各种运动的运动员的运动成就和健康与诸如Akkermansia Municiphila，Faecalibacterium prausnitzii，Eubacterium cantale，Eubacterium thacterium contale，Roseburia hominis，faecalibacterium prausnitzii有关。此外，已经表明，肠道的微生物组成和酶之间存在联系，这被认为是与运动员健康相关的代谢产生的关键
肠道微生物组在心血管健康中的关键作用
最近的一项从2024年4月的一项研究确定振动杆菌和Eubacterium是协同的胆固醇代谢剂。这些细菌在转化胆固醇时形成的中间产物最终被其他细菌降解，并从体内冲洗掉，减少肠道胆固醇并调节宿主的生化途径，从而降低粪便和血浆胆固醇水平。结果可能有助于促进新型潜在干预措施，例如针对心血管疾病（CVD）治疗中的微生物组。3观察到一种新的关联，高血清C-反应性蛋白（CRP）水平与副胶囊菌毛和未分类的公司相关，并与血浆胆固醇密切相关。对于富公司，发现该门称为MSP_120的明确定义的宏基因组pangenome（MSP）与较高的胆固醇水平相关，表明其在胆固醇代谢中的作用，因此
菌群组成对结直肠癌患者免疫疗法结果的影响：系统评价
总共确定了5,132篇论文，2017 - 2022年之间进行了三项研究和一项摘要，符合纳入标准，并在描述性合成表中进行了总结。这四项研究符合以下发现，四个主要门，富公司，杆菌，放线杆菌和verrucomicrobobiota与CRC患者对ICIS治疗的临床反应有关。Ruminococaceae主要与CRC患者相关，而对治疗的反应，而微球菌家族在非反应者中更为常见。细菌分类群（例如粪便菌群和prevotellaceae）与对ICIS的更好反应有关，并且可能是预测的生物标志物。粪便菌群与Akkermansia Muciniphila和Eubacterium guctale richment的特征，以及Rothia Mucilaginosa Deptetion可以独立预测CRC患者对ICI的更好反应。
ErCas12a CRISPR-MAD7 用于人类细胞、小鼠和大鼠的模型生成
摘要 MAD7 是从直肠真杆菌中分离出来的一种工程化的 2 类 VA 型 CRISPR-Cas (Cas12a/Cpf1) 系统。与 Cas9 类似，它是一种 RNA 引导的核酸酶，在大肠杆菌和酵母细胞中具有基因编辑活性。本文报告称，MAD7 能够分别在人类 HCT116 和 U2OS 癌细胞系中产生内源基因的插入/缺失和荧光基因标记。此外，MAD7 非常擅长在小鼠和大鼠胚胎中产生插入/缺失、小 DNA 插入（23 个碱基）和 1 至 14 kb 大小的较大整合，从而产生活产转基因动物。由于不同的原间隔区相邻基序要求、小引导 RNA 和高效的靶向基因破坏和插入，MAD7 可以扩展 CRISPR 工具箱，用于跨不同系统和模型生物进行基因组工程。
肠道菌群与慢性肾衰竭之间的因果关系：两样本的孟德尔随机研究
结果：根据逆差异加权方法的结果，七个细菌属与结果可变的慢性肾衰竭有显着关联。，Ruminococcus（Gauvreauii组）（OR = 0.82，95％CI = 0.71-0.94，P = 0.004）可能是防止慢性肾衰竭的保护因素，而Escherichia e escherichia shigella属（OR = 1.22，95％CI = 1.22，95％CI = 1.08-1.08–1.38-1.38 - p = 0.001） 95% CI = 1.02–1.19, p = 0.013), Odoribacter (OR = 1.23, 95% CI = 1.03–1.49, p = 0.026), Enterorhabdus (OR = 1.14, 95% CI = 1.00–1.29, p = 0.047), Eubacterium (eligens group) (OR = 1.18, 95% CI = 1.02–1.37，p = 0.024）和霍华德拉（OR = 1.18，95％CI = 1.09–1.28，p <0.001）可能是慢性肾衰竭的风险因素。然而，在使用错误发现率进行多次比较的校正之后，只有与大乙基虫和霍华德拉的关联保持显着，表明其他属具有暗示性的关联。灵敏度分析没有揭示任何多效性或异质性。
肠道菌群与便秘之间的因果关系
结果：我们的分析表明，特定细菌类群（例如Coprocococus1）（OR = 0.798，95％CI：0.711–0.896，P <0.001），coprococcus3（OR = 0.851，95％CI：0.740-0.97979，20.979，p = 0.009，p = 0.00.979，pocioccus1（OR = 0.798，95％CI：0.798，95％CI：0.798，95％CI：0.798，95％）， 95％CI：0.817–0.996，p = 0.041），flavonifracto r（OR = 0.823，95％CI：0.708–0.957，p <0.001）和lachnospiraceae ucg004，而其他包括Rusinococcaceae Uccaceae UccaCeae Uccaceae ci：1.1127，或者= 1.127：1127：1127 1.008–1.261, p = 0.036), Eubacterium nodatum group (OR = 1.080, 95%CI: 1.018–1.145, p = 0.025), Butyricimonas (OR = 1.118, 95%CI: 1.014–1.233, p = 0.002), and Bacteroidetes (OR = 1.274, 95%CI: 1.014–1.233，p <0.001）增加便秘风险。在反向MR分析中，发现便秘会影响某些人群的丰富性，包括家族XIII，卟啉单核细菌，Proteeobacteria，proteeobacteria，lentisphaeria，Veillonellaceae，Victivallaceae，Victivallaceae，Victivallaceae，catenibacterium catenibacterium，catenibacterium，shelimonas和Victivallales和Victivallales，指示BIDIRECTIONTALSALICTALSALICTALALALESPERTY。灵敏度分析证实了这些发现的鲁棒性，没有异质性或水平多效性的证据。
剖析肠道菌群与肥厚疤痕之间的关联：双向Mendelian随机研究
肥厚疤痕每年都会影响大量个体，从而引起整容关注和功能障碍。先前的研究表明，肠道微生物组成的不平衡，称为微生物营养不良，可以通过肠道微生物群和宿主之间的复杂相互作用来引发各种疾病的进展。然而，肠道菌群与肥厚疤痕之间的因果关系的确切性质尚不确定。在这项研究中，在涉及418个肠道菌群和肥大性疤痕的实例中收集了基因组广泛研究（GWAS）的摘要数据后，我们进行了双向Mendelian随机分组（MR），以研究肠道肌群和过度感性恐怖和偏向于can to canto norkernition can to can to can can to can can can can can can can can can can can的潜在存在的潜在存在。利用MR分析，我们确定了肠道微生物组和肥厚疤痕之间的七个因果关系，涉及一个正和六个负因果方向。，其中的肠道菌，ruminocococcus2，barnesiella，dorea，desulfovibrio piger和ruminococcus torques充当防止肥厚疤痕的保护因素，而Eubacterium rectale则表明是肥厚败血症的潜在作用。此外，对这些结果的敏感性分析表明，没有迹象表明异质性或多效性。我们的MR研究的发现表明，肠道菌群与肥厚性疤痕之间存在潜在的致病联系，为未来的机械研究开辟了新的方法，并探索了纳米型技术治疗皮肤疾病的方法。