Gibco™ CTS™ Xenon™ 电穿孔仪器 Cat. No. A50301 建议细胞浓度 20 x 10⁶ 至 100 x 10⁶ 细胞/mL 电穿孔体积 1 mL; 5–25 mL 电穿孔室容量 1 mL 5–25 mL 电穿孔体积的运行时间 7–22 分钟 电穿孔脉冲电压范围 500–2,500 V 电穿孔脉冲宽度范围 1–30 ms 电穿孔脉冲间隔范围 500–1,000 ms 电穿孔脉冲数 1–10 支持 21 CFR 第 11 部分合规性 是,可进行软件升级(请咨询) 开放平台通信 - 统一架构 (OPC-UA) 兼容性 是 云连接实用程序 是 细胞搅拌器转速 60 rpm 预冷技术 Peltier 预冷温度设定范围 10–30°C 尺寸(高 x 宽 x 深),门完全打开时 43.1 x 26.5 x 21.2 英寸(109.5 x 67.4 x 53.9 厘米) 重量 154.3 磅(70 千克) 电气额定值 100–240 V, 1,200 VA 触摸显示屏 8 英寸电容式
500 mL Eagle的MEM(Sigma M4655)5 ml MEM非必需氨基酸(Gibco 11140-050)5 ml L-L-l-谷氨酰胺(Sigma G7513)5 ml p钠钠(Sigma s8636)(Sigma S8636)50 mL fetal bovine sote storme forter inter inter inter inter instermize insterim insterize instermize fellimize fortile comle c.不必将预筛选的苍白链球菌允许FBS用于SF1EP细胞的常规培养。细胞培养程序SF1EP细胞直接从ATCC®获得,源自原代细胞,其有限寿命约为27-30段。因此,重要的是要制作大型SF1EP细胞的冷冻种子库存。这些细胞具有上皮形的形态,当它们到达汇合时,它们的外观呈多边形或鹅卵石外观。这些低通道SF1EP生长缓慢,并在每二周进行1:5。我们具有SF1EP细胞的不朽细胞系,该细胞是从ATCC®细胞自发产生的。这些细胞的生长速度比原始细胞生长要快得多,生长到更高的密度,并在达到高密度时采用纺锤形的细胞形态。最初,这些支持T. pallidum的生长以及原始的SF1EP细胞,并且更容易大量生产。然而,在达到65的通道后,甲虫的生长会减少,应丢弃,并应融化细胞的较低传递培养。我们可以向希望启动体外培养的任何人提供此细胞系。这些是每周1:15的亚文化。使用无菌技术在生物安全柜中执行所有操纵。
材料。Fmoc-β-amino acids, including Fmoc- L -β-homoalanine, Fmoc- L -β-homoisoleucine, Fmoc- L -β-homoleucine, Fmoc- L -β-homophenylalanine, Fmoc-(1S,2S)-2-aminocyclopentane carboxylic acid, Nβ-Fmoc-Nω-Boc- L -β-homolysine, Fmoc-O-tert-butyl- L -β-homoserine, and Fmoc-α-amino acids, including Fmoc-glycine, Fmoc- L -alanine, Fmoc- L -isoleucine, Fmoc- L - leucine, Fmoc- L -phenylalanine, Fmoc-O-tert-butyl- L -serine, FMOC-L-β-双晶,FMOC-L-主要酸β-TERT-丁基酯,FMOC-L-谷氨酸γ-tert-叔丁基酯,Nα-FMOC-Nε-boc-l-赖氨酸是从Chem-impex International,Inc.(Wood Dale,Inc.,IL,USA,USA,USA)购买的。fmoc-l-脱毛氨酸是从热科学化学品购买的。FMOC-L-Norvaline购自Santa Cruz Biotechnology。hatu是从奥克伍德化学品获得的。Tentagel S RAM FMOC购自Advanced Chemtech(肯塔基州路易斯维尔)。Menadione,N,N-二异丙甲胺,Mueller Hinton肉汤和磷酸二氮的磷酸钠,是从Sigma-Aldrich(密苏里州圣路易斯)获得的。3-(n-甲磷脂)丙烷磺酸(MOPS)获自Fisher Scientific(宾夕法尼亚州匹兹堡)。2,3-双(2-甲氧基-4-硝基-5-磺苯基)-2H-四唑-5-羧基(XTT)购自从Invitrogen购买。Gibco Brand RPMI 1640粉末(含有苯酚红和L-谷氨酰胺,没有碳酸氢钠或HEPES)和Dulbecco的磷酸盐缓冲盐水(DPB,无钙或镁)是从Thermo Fisher Scientific(MA)获得的。使用Millipore过滤系统纯化水(18.2MΩ)。细胞滴度GLO 2.0分析套件来自Promega(WI)。
方法在补充了10%FCS,1%谷歌补充剂(Gibco),100 U/ml青霉素和100μg/ml链霉菌素的IMDM(Gibco)中培养了衍生成近单倍型HAP1细胞的细胞培养。siRNA转染是根据制造商的指南使用Rnaimax(Invitrogen)进行的。在这项研究中使用了以下siRNA:Sinon-targetable(Dharmacon),Sipolg2(地平线,TargetPlus,SmartPool),SIMRPL23(Horizon,Targetplus,TargetPlus,Smartpool)。将所有药物(Aphidicolin,Hu,Olaparib,Rad51i(B02),DNA-PKI(NU74441)和寡霉素A)溶解在DMSO中,并以指示浓度使用。细胞使用具有137CS源的γ提取器(最佳疗法)进行γ辐射。生长测定HAP1细胞以1500个细胞/孔的密度将HAP1细胞铺在96孔板中,并被视为5天。5天后,使用100%甲醇固定细胞,并在室温下使用Crystal Violet染色2H。随后,将晶体紫溶解在10%乙酸中,并使用Biotek Epoch Epoch分光光度计在595 nm处测量强度。使用非线性拟合,sigmoidal,4pl,x是log(浓度),将这些测量值用于棱镜中的IC50计算。在9mm玻璃盖上生长免疫荧光细胞,并在室温下以4%甲醛和0.2%Triton X-100固定10分钟。使用了以下抗体:人类抗克雷斯特(Cortex Biochem,CS1058),兔抗PH3SER10(Campro,#07-081),小鼠抗ERCC6L(PICH)(ABNOVA,ABNOVA,000548421-B01P)。所有初级抗体在4°C的夜间孵育。使用固定缓冲液I(BD生物科学)固定细胞。细胞。二级抗体(分子探针,Invitrogen)和DAPI在室温下孵育2小时。使用延长金(Invitrogen)安装盖玻片。使用具有60倍1.40 Na油目标的Deltavision Deonvolution显微镜(Applied Precision)获取图像。SoftWorx(应用精度),ImageJ,Adobe Photoshop和Illustrator CS6用于处理获得的图像。单倍体插入诱变筛选基因对用APH或HU处理的HAP1细胞的存活至关重要,如先前所述35,使用单倍体插入诱变筛查鉴定。诱变的HAP1细胞是从Brummelkamp实验室获得的。简短地,获得HAP1细胞的诱变如下:在HEK293T细胞中产生了基因陷阱逆转录病毒。每天两次收获逆转录病毒至少三天,并通过离心(使用SW28转子进行2小时,21,000 rpm,4°C,4°C)进行沉淀。在8μg/ml硫酸素硫酸素的存在下,在T175烧瓶中至少连续两天,在8μg/ml硫酸素的存在下,将大约4000万个HAP1细胞通过浓缩基因陷阱病毒的转导而被诱变。在包含10%DMSO和10%FCS的IMDM培养基中冷冻诱变细胞。解冻后,在存在27.5 nm adphidicolin或100μmHu的情况下,将诱变的HAP1细胞转移了10天。传递后,通过胰蛋白酶-EDTA收集细胞,然后进行沉淀。为了最大程度地减少潜在地含有杂合突变的二倍体细胞的混杂,用DAPI染色固定的细胞,以允许使用Astrios Moflo对G1单倍体DNA含量进行分类。将3000万个排序的细胞在56°C下裂解过夜,以使使用DNA迷你试剂盒(QIAGEN)进行基因组DNA分离。插入位点映射基因陷阱插入位点通过LAM-PCR放大,然后进行捕获,ssDNA接头连接和指数放大,并在测序之前使用含有Illumina适配器的引物,如前所述,如前所述35。映射和插入位点的分析以前描述了78。简短地,在对HISEQ 2000或HISEQ 2500(Illumina)进行测序之后,将插入位点映射到人类基因组(H19),允许一个不匹配,并与RefSeq坐标相交,以将插入位点分配给基因。基因区域在相对链上重叠的基因区域没有考虑进行分析,而对于在相同链基因名称上重叠的基因是串联的。对于每种复制和两种药物治疗(APH或HU)基因的必要性都是通过二项式检验确定的。合成致死性。一个基因通过所有Fisher的测试,其p值截止为0.05,效应大小至少为0.12(减法比率wt sense比率 - 复制应力条件感官比率)。