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通过分子对接靶向SARS-COV-2主要蛋白酶的重新利用药物的计算筛选
摘要背景：Covid-19（2019年冠状病毒病）是由严重的急性呼吸综合症2型（SARS-COV-2）引起的，这构成了明显的全球健康和经济危机，该危机敦促有效治疗。方法：总共11个分子（Baricitinib，Danoprevir，Dexamethasone，Hydrox- Ychloroquine，Ivermectin，lopinavir，甲基甲基甲虫，Remdesivir，Remdesivir，Ritononavir，Ritonavir，Ritonavir和Saridegib和Saridegib，saridegib，saridegib，saridegib，condina contine conto ander cons of tosect in select ins seption condine condine contine condine sout solect solect通过靶向SARS-COV的主要蛋白酶（MPRO）的抗病毒活性，这是一种半胱氨酸蛋白酶，介导病毒复制过程中多蛋白的成熟裂解。结果：三种药物与N3（活性MPRO抑制剂作为对照）表现出更强的结合功能：Danoprevir（–7.7 kcal/mol），remdesivir（–8.1 kcal/mol）和saridegib（–7.8 kcal/mol）。在Glya的Danoprevir-Mpro复合物中鉴定出两个主要的常规氢键：143和GLNA：189，而残基GLUA：166形成了碳 - 氢键。在Asna：142，血清：144，CYSA：145，HISA：163，GLUA：166和GLNA：189的Remdesivir中鉴定出七个主要的常规氢键。与抗坏血酸（–5.4 kcal/mol）相比，头孢氨思显示出对MPRO（–7.9 kcal/mol）的结合性更好（–5.4 kcal/mol）。在HISA：164，POA； 168，GLNA; 189和THRA：190的头孢氨思-Mpro复合物中形成了四个碳 - 氢键。结论：这项研究的发现表明，这些药物可能通过靶向MPRO蛋白来抑制SAR-COV-2病毒。
全球LRP调节蛋白来自Haloferax Mediterranei
Haloferax Mediterranei是一种在高盐环境中蓬勃发展的极端卤素古老的考古，由于其在极端盐度条件下繁荣发展，因此在生物技术和生化研究中引起了人们的关注。转录因子在调节各种细胞过程中必不可少，已成为理解其适应性的焦点。这项研究深入研究了LRP转录因子的作用，探索了其通过β-半乳糖苷酶测定的体内GLNA，NASABC和LRP基因启动子的调节。值得注意的是，我们的发现提出LRP是氮代谢的开创性转录调节剂。这项研究表明其在激活或抑制同化途径酶（GLNA和NASA）中的潜在作用。LRP与这些启动子之间的相互作用使用电泳迁移率转移测定法和差异扫描荧光法分析，这突出了L-谷氨酰胺在稳定LRP -DNA复合物中必不可少的作用。我们的研究发现，在存在L-谷氨酰胺的情况下，卤素LRP形成八接结构。该研究揭示了使用X射线晶体学作为同型二聚体的三维结构，通过小角度X射线散射在溶液中证实了该状态。这些发现阐明了驱动HFX的复杂分子机制。地中海尼的氮代谢，提供有关其基因表达调节的宝贵见解，并丰富我们对极端生物学的理解。
使用液滴微流体技术进行可扩展且自动化的基于 CRISPR 的菌株工程
摘要 我们提出了一种基于液滴的微流体系统，该系统可在芯片上实现基于 CRISPR 的基因编辑和高通量筛选。微流体装置包含一个 10 × 10 元件阵列，每个元件包含用于两个电场驱动操作的电极组：用于合并液滴以混合试剂的电润湿和用于转化的电穿孔。该装置可以并行执行多达 100 个基因改造反应，为生成遗传途径组合优化和可预测生物工程所需的大量工程菌株提供了一个可扩展的平台。我们通过基于 CRISPR 的两个测试案例的工程改造展示了该系统的能力：（1）破坏大肠杆菌中酶半乳糖激酶（galK）的功能；（2）靶向改造谷氨酰胺合成酶基因（glnA）和蓝色色素合成酶基因（bpsA），以提高大肠杆菌中的靛蓝素产量。
深入了解...
几种乳酸细菌（实验室）是四川麸皮生产中的双刃剑；一方面，它们对于醋的味道很重要，但另一方面，由于其产生气体的特征和耐酸性，它们会导致醋恶化。这些特征加剧了使用诸如乙酰乳杆菌的菌株（如金山氏菌）亚种的菌株来管理醋的安全生产的困难。EALEGONES Z-1。因此，有必要表征其酸耐受性的机制。这项研究的结果显示，当暴露于pH 3.0应力1小时时，Z-1的存活率为77.2％。该菌株在醋溶液中可以生存约15天，总酸总含量为4％或6％，并且通过添加10 mm的精氨酸（ARG）有效地增强了其生长。在酸性应激下，不饱和脂肪酸C18：1（n-11）的相对含量增加，细胞中积累了八个氨基酸。Meanwhile, based on a transcriptome analysis, the genes glnA , carA/B , arcA , murE/F/G , fabD/H/G , DnaK , uvrA , opuA/C , fliy , ecfA2 , dnaA and LuxS , mainly enriched in amino acid transport and metabolism, protein folding, DNA repair, and cell wall/membrane metabolism processes, were hypothesized to是Z-1中与抗酸抗性相关的基因。这项工作为进一步阐明Z-1的酸耐受性机理铺平了道路，并共享适用于醋酿造的观点。