背景:癌症患者比普通人群更容易受到严重急性呼吸综合症2(SARS-COV-2)感染的影响,其中肺上皮细胞或肠细胞是主要靶标。然而,尚未完全阐明机场消化剂癌中SARS-COV-2入门基因的表达。方法:在这项研究中,全面评估了SARS-COV-2受体和辅因子的表达,包括血管紧张素I-转换酶2(ACE2),BASIGIN(BSG)和跨膜丝氨酸丝氨酸Pro Tease 2(TMPRSS2)。我们通过基因表达分析互动分析2(GEPIA2)比较了机化癌和匹配正常组织之间的BSG和TMPRSS2表达式。此外,使用基因型 - 组织表达(GTEX)数据集探索了不同解剖位置的健康结肠组织中的表达。此外,通过GEPIA2检测到不同肿瘤阶段和预后值之间的表达。此外,通过肿瘤免疫估计资源(计时器)探索了基因表达与免疫浸润之间的相关性。最后,使用基因表达综合(GEO)数据集GSE41258研究了原发性结直肠癌(CRC),肺转移和肝转移的表达。结果:类似于ACE2,TMPRSS2和BSG,也在消化道中高度表达。有趣的是,相邻正常结肠组织或肺组织中的BSG/TMPRSS2表达高于相应的健康组织中的BSG/TMPRSS2,而它们在不同的肿瘤阶段的变化不变,并且在消化剂癌症中不与预后相息。此外,ACE2在CRC的肺转移中比正常肺组织中的肺转移水平更高。结论:SARS-COV-2进入基因在CRC中高度表达,我们首次报道了CRC的肺转移中ACE2的表达高于正常肺中的ACE2,这表明这些患者可能更容易受到肺外或肺SARS-COV-COV-2感染的影响。由于我们的研究是生物信息学分析,因此迫切需要进一步的实验证据和临床数据。关键字:ACE2,BSG,TMPRSS2,COVID-19,Aerodivide Cancers
这项研究得到了日本科学技术振兴机构 (JST) 战略基础研究促进计划 CREST“用于长 DNA 合成和自主人工细胞创建的人工细胞反应器系统”研究领域 (编号 JPMJCR19S4)、GteX“大规模并行蛋白质打印机系统的开发”研究领域 (编号 JPMJGX23B1)、ASPIRE“日英合作开发人工光合细胞系统”(编号 JPMJAP24B5) 和科学研究补助金“Kikagaku S”(编号 JP19H05624) 的支持。 术语表(注1) 真核生物:具有细胞核并被核膜包围,且含有线粒体等细胞器的生物的统称。它们包括动物、植物和真菌,具有比原核生物更复杂的细胞结构。 (注2)内在无序蛋白质是在生理条件下不能形成三维结构的蛋白质,与酶等折叠成特定的三维结构才能发挥功能的蛋白质不同。分子间多样化的相互作用网络推动液-液相分离,形成称为凝聚层的液滴。 (注3)液-液相分离:均质液体混合物自发分离成两个具有不同成分的液相的现象。单一聚合物(如天然存在的变性蛋白质)可发生相分离,形成致密相和稀相,或者两种不同组成的致密相(如葡聚糖和聚乙二醇)。 (注4)肽标签:一种用于连接特定蛋白质的短氨基酸序列。通过将DNA序列遗传整合到蛋白质中,可以很容易地将其添加到蛋白质中。本研究中使用的肽标签具有拉链式结构,使得它们能够相互互锁并进行特定结合。另一方面,由于它几乎不与其他分子或蛋白质结合,因此可以利用这一特性选择性地将特定蛋白质结合在一起。在该系统中,一个肽标签附着在IDP上,另一个肽标签附着在要掺入IDP相的蛋白质上。 (注5)分子信标:用于检测特定DNA或RNA序列的核酸探针,具有包含荧光染料和猝灭剂的环状结构。在没有目标序列的情况下,荧光就不会出现,但一旦与序列结合,分子的形状就会发生变化,发出荧光并变得可检测。这可以实时确认样本中特定基因或 RNA 的存在。