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2021 年年度报告
在植物功能基因组学领域，褚成才研究组对多种水稻地方品种的NUE相关性状进行了评估，并通过GWAS鉴定了OsTCP19启动子中与分蘖对氮的反应（TRN）相关的变异，表明OsTCP19在适应不同地理区域局部土壤条件下发挥的重要作用（Liu et al., Nature , 2021）。左建如研究组证明了Ghd7和ARE1的优良等位基因组合在低氮条件下提高了NUE和籽粒产量，定义了基于Ghd7–ARE1的氮利用调控机制，为水稻NUE的遗传改良提供了有用的靶点（Wang et al., Mol Plant , 2021）。王永红研究组与合作者描述了造成水稻GNP多样性的新型遗传变异，揭示了调控农学重要基因表达的潜在分子机制，并为通过操纵含有顺式调控元件的IR序列来提高水稻产量提供了一种有希望的策略（Wu et al., Mol Plant , 2021）。姚善国研究组与合作者揭示了LARGE2- APO1/APO2模块介导控制水稻穗大小和粒数的新型遗传和分子机制，表明该模块是改良作物穗大小和粒数的一个有希望的靶点（Huang et al., Plant Cell , 2021）。
开发rice中标题日期的SNP基因分型测定
标题日期（HD）是由多个基因座控制的至关重要的农艺性状，它可以探讨大米（Oryza sativa L.）的一系列地理和季节性适应。因此，有关跨父母HD基因型的信息对于标记辅助育种计划至关重要。在这里，我们使用Fluidigm 96-Plex SNP基因分型平台来开发基因分型测定，以确定41 HD基因座的等位基因（29个先前具有特征性的基因和12个定量性状基因座[QTLS]，包括新检测到的QTL）。基因分型测定总共区分了144个等位基因（根据文献和公开可用的数据库定义）和QTL。377个品种的基因分型平均显示3.5个等位基因，HD1，GHD7，PRR37和DTH8的多样性高于其他基因座的基因分型，而参考（“ Nipponbare”）基因型在41个基因座的30型中的占主导地位。HD预测模型使用来自200个品种的数据显示出良好的相互作用（r> 0.69，p <0.001），当时用22种未包含在预测模型中的品种进行测试。因此，开发的测定法提供了有关HD的基因型信息，并将实现具有成本效益的繁殖。