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学习人类肠道细菌如何竞争并合作代谢营养是开发更多营养食品并促进更健康的肠道微生物群落的重要一步。人类肠道细菌是复杂的饮食多糖的主要消费者。在这里,我们描述了一种遗传体系,用于故意诱导肠道群落中目标生物的丰度减少。gnotobiotic小鼠被喂食人类饮食,并用定义的培养,基因组测序的,人类肠道细菌(包括多种菌囊科种类)定植。在既定社区中的不同菌孢子的“敲低”导致了其他生物体的特定增加,并揭示了它们如何动态地改变其优先级,以利用可用的多糖,同时保留了社区代谢碳水化合物的总体能力。