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World File Search SystemH3K9
活性染色质中的 H3K9 三甲基化限制了 SINE B2 重复序列中功能性 CTCF 位点的使用
六种甲基转移酶分工建立组蛋白 H3 赖氨酸 9 甲基化 (H3K9me) 的基因组图谱，H3K9me 是一种控制组成性异染色质、基因抑制和逆转录元件沉默的表观基因组修饰。其中，SETDB1 被募集到活性染色质域以沉默内源性逆转录病毒的表达。在旨在确定 SETDB1 对巨噬细胞中刺激诱导基因表达的影响的实验中，我们发现 SETDB1 耗竭导致的 H3K9me3 丢失与 CTCF 募集增加有关，这些募集到 SINE B2 重复序列中包含的 >1600 个 DNA 结合基序，这是之前未确定的 SETDB1 介导的抑制靶点。CTCF 是染色质折叠的重要调节剂，可抑制黏连蛋白引起的 DNA 成环，从而在相邻拓扑域之间创建边界。 CTCF 与 SINE B2 重复序列的结合增加，增强了数百个位点的绝缘性，并增加了含有脂多糖诱导基因的拓扑域内的环形成，这与它们对刺激的调节受损有关。这些数据表明 H3K9me3 在抑制 CTCF 的基因组分布和活性方面发挥着作用，并对染色质组织和基因调控产生影响。
HP1 是一种负责……的蛋白质，其新功能
真核生物的染色体由DNA和组蛋白组成，组蛋白的甲基化、乙酰化等化学修饰可诱导染色体聚集和松弛，从而改变基因表达模式。HP1已被证实为H3K9甲基化的结合蛋白，在促进染色体聚集中发挥作用。由于哺乳动物中HP1蛋白有3个旁系同源物，我们利用基因组编辑技术建立了3个HP1均缺失的细胞，并与正常细胞进行比较，发现在HP1缺陷细胞中，H3K9甲基转移酶和去甲基化酶大幅降解，染色体不能恢复成正确的结构（图1）。对部分功能缺失的HP1突变体的分析表明，HP1将H3K9甲基转移酶和去甲基化酶束缚在染色质上，阻止这些酶降解（图2）。
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摘要：横纹肌肉瘤（RMS）是儿童中最常见的软组织肉瘤，其中肌源性前体细胞无法进行分化。有两个主要亚型：肺泡横纹肌肉瘤，其特征是Pax3-福克斯1融合蛋白的表达。和胚胎类型，这是融合阴性的。当前的护理标准在高危疾病中无效。表观遗传脱位是小儿癌的标志。确定染色质修饰剂可维持肿瘤生长并构成RMS中的肌源分化缺陷，他们进行了表观遗传筛查，并确定了介导H3K9 DI-甲基化的EHMT1/EHMT2的放松管制。以及乙酰化标记的读者BRD4。他们对EHMT1/EHMT2的研究在介导分化块和维持肿瘤启动细胞方面显示出差异作用。她将讨论他们最近在RMS中对BRD4同工型特异性功能的研究。
科学期刊
表观遗传失调已在包括白血病在内的多种癌症中报道。尽管如此，表观遗传读取器帝帝型域在白血病进展和治疗中的作用仍未得到探索。在这里，我们进行了以Tudor结构域为中心的CRISPR屏幕，并确定了SGF29，SGF29是SAGA/ATAC乙酰基转移酶Com-plexes的组成部分，是H3K9乙酰化，核糖体基因表达和白血病的关键因素。为了促进药物开发，我们将CRISPR平铺扫描与复合对接和分子动力学模拟相结合，并提出了一种普遍适用的策略，称为CRISPR-SCAN辅助药物发现（CRISPR-SADD）。使用这种方法，我们确定了一种铅抑制剂，该铅抑制剂有选择地靶向SGF29的Tudor域并证明了针对白血病的功效。此外，我们建议我们研究中使用的结构遗传学方法可以广泛应用于从头药物发现的不同领域。
微生物组对主机社区动态的影响
持续的有机污染物（POP），其中包括全球广泛使用的农药和工业化学物质，对人类健康构成了秘密威胁。β -heacachlorocyclohexane（β-HCH）是一种具有惊人稳定性的有机氯农药，仍然在许多国家非法倾倒，并被认为是多种致病机制的原因。这项研究代表了暴露于特异性靶向神经元细胞（N2A），小胶质细胞（BV -2）和C57BL/6小鼠的β -HCH引起的神经毒性作用的开创性探索。如Western印迹和QPCR分析所示，β-HCH的给药触发了NF-κB的调节，NF-κB是影响炎症和促炎性细胞因子表达的关键因素。我们通过Proteo MIC和Western印迹技术证明了β -HCH诱导的H3组蛋白的表观遗传修饰。N2a中H3K9和H3K27的组蛋白乙酰化增加，在用β -HCH施用的C57BL/6小鼠的前额叶皮层中，它在BV -2细胞和海马群中降低。我们还通过新的对象识别测试（NORT）和对象位置识别任务（OPRT）行为测试对识别记忆和空间导航产生了严重的有害影响。认知障碍与BDNF和SNAP-25基因的表达降低有关，后者是参与突触功能和活性的介体。获得的结果扩大了我们对β -HCH暴露产生的有害影响的理解，通过强调其对神经疾病的发病机理的影响。这些发现将支持干预计划，以限制暴露于POPS引起的风险。监管机构应阻止进一步的非法使用，从而造成环境危害并危害人类和动物健康。