1。Arun Sethi,(2003年)。 有机化学实验实验。 新德里:新时代出版商。 2。 Bansal,R。K,(2008)。 有机化学实验室手册(IV版)。 新德里:新时代出版商。 1。 Furniss,B.S.,Hannaford,A.J.,Smith,P.W。G.和Tatchell,A.R。,(2004年)。 Vogel的实用有机化学教科书(V Edition)。 新加坡:皮尔逊教育有限公司Arun Sethi,(2003年)。有机化学实验实验。新德里:新时代出版商。2。Bansal,R。K,(2008)。有机化学实验室手册(IV版)。新德里:新时代出版商。1。Furniss,B.S.,Hannaford,A.J.,Smith,P.W。G.和Tatchell,A.R。,(2004年)。 Vogel的实用有机化学教科书(V Edition)。 新加坡:皮尔逊教育有限公司Furniss,B.S.,Hannaford,A.J.,Smith,P.W。G.和Tatchell,A.R。,(2004年)。Vogel的实用有机化学教科书(V Edition)。新加坡:皮尔逊教育有限公司
竞争利益声明:B.G.N.是北部生物制剂,有限公司,Navire Pharma,Lighthorse Therapeutics和Aethon Therapeutics的联合创始人,他从中获得了咨询费和股票。他的配偶拥有现代公司,Revolution Medicines Inc的权益,在这项工作过程中,Mirati Therapeutics,Regeneron和Amgen拥有权益。他曾在Arvinas,Koijin Therapeutics和Recursion Pharma的科学咨询委员会任职,并获得了前两者的咨询费和股票,并获得了后者的权益。J.W. 是Remunix Inc.的创始人兼顾问,他在过去的12个月中从中获得了咨询费和股票以及赞助的研究基金。 J.W. 还收到了Rootpath Genomics,Bristol Myers Squibb,Regeneron,Hanmi和Lav Fund的咨询费。 所有其他作者都没有宣称没有竞争利益。J.W.是Remunix Inc.的创始人兼顾问,他在过去的12个月中从中获得了咨询费和股票以及赞助的研究基金。J.W. 还收到了Rootpath Genomics,Bristol Myers Squibb,Regeneron,Hanmi和Lav Fund的咨询费。 所有其他作者都没有宣称没有竞争利益。J.W.还收到了Rootpath Genomics,Bristol Myers Squibb,Regeneron,Hanmi和Lav Fund的咨询费。所有其他作者都没有宣称没有竞争利益。
真核生物的染色体由DNA和组蛋白组成,组蛋白的甲基化、乙酰化等化学修饰可诱导染色体聚集和松弛,从而改变基因表达模式。HP1已被证实为H3K9甲基化的结合蛋白,在促进染色体聚集中发挥作用。由于哺乳动物中HP1蛋白有3个旁系同源物,我们利用基因组编辑技术建立了3个HP1均缺失的细胞,并与正常细胞进行比较,发现在HP1缺陷细胞中,H3K9甲基转移酶和去甲基化酶大幅降解,染色体不能恢复成正确的结构(图1)。对部分功能缺失的HP1突变体的分析表明,HP1将H3K9甲基转移酶和去甲基化酶束缚在染色质上,阻止这些酶降解(图2)。
双切口酶质粒被视为“许可产品”,应根据 www.scbt.com/limitedlicense 上规定的有限许可使用。购买本产品即向买方转让不可转让的权利,买方有权将所购买的产品数量以及所有复制品和衍生物仅用于买方在其实验室进行的研究目的(无论买方是学术实体还是营利实体)。买方不得向第三方出售或以其他方式转让 (a) 本产品 (b) 其组件或 (c) 使用本产品或其组件制成的材料,或以其他方式将本产品或其组件或使用本产品或其组件制成的材料用于商业目的。
抗生素耐药性细菌病原体是一个非常具有挑战性的问题。幽门螺杆菌是最广泛,最成功的人类病原体之一,因为它在世界一半的人群中分布,引起慢性和萎缩性胃炎,消化性溃疡,粘膜相关的淋巴样组织 - 淋巴瘤 - 淋巴瘤,甚至是胃腺癌。此外,它表现出对众多抗生素的抗性。幽门螺杆菌关键转录因子之一HP1043在调节必需细胞过程中起着基本作用。与其他细菌转录因子一样,HP1043不显示真核生物同源物。这些特征使HP1043成为发展新型抗菌策略的有前途的候选人。药物重新定位是药物开发中采用的相对较新的策略;测试对新目标的批准药物大大减少了此过程的时间和成本。组合的计算和体外方法进一步减少了要在体内测试的化合物的数量。我们的目标是确定能够防止HP1043结合DNA启动子的一部分。通过评估通过分子对接HP1043二聚体的结合能力在两个构象中,与DNA结合和未结合,从而达到了这一结果。采用包括MMGBSA分子动力学的临时管道,可获得七种药物。通过电泳迁移率转移测定法在体外测试了这些测定,以评估HP1043 - DNA相互作用。在其中,三个有希望的结果显示了HP1043的DNA结合活性的明显降低。总体而言,我们应用了一种计算方法,结合了结果的实验验证,以筛选幽门螺杆菌基本转录因子之一上的大量已知药物。这种方法允许快速减少测试的药物数量,并且药物重新定位方法大大降低了药物设计成本。鉴定的药物不属于同一药物类别,并且通过计算分析构成了不同的腔体,但都显示了DNA上HP1043结合活性的降低。
