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尿miRNA签名作为Hirschsprung病的潜在非侵入性诊断生物标志物
hirschsprung疾病（HSCR）的特征是胃肠道中没有神经节细胞的先天性缺失，从而导致排便，便秘和肠梗阻受损。当前的HSCR诊断是基于直肠吸力活检（RSB），这在新生儿中可能很复杂。有时会延迟诊断会增加临床并发症的风险。因此，有新的非侵入性诊断方法是客观的，更可行的，并且为潜在的手术干预提供了更早的基础。近年来，MicroRNA（miRNA）已成为相关的早期标志物的重点，该标志物可以提供对疾病的病因和进展的更多见解。因此，在寻找非侵入性HSCR生物标志物时，我们分析了HSCR患者尿液样品中的miRNA表达。使用微阵列的5例HSCR患者的结果显示，HSA-MIR-378 H，HSA-MIR-210-5P，HSA-MIR-6876-3P，HSA-MIR-634和HSA-MIR-634和HSA-MIR-6883-3P是最上升的miRNA；而HSA-MIR-4443，HSA-MIR-22-3P，HSA-MIR-4732-5P，HSA-MIR-3187-5P和HSA-MIR-371B-5P最下调的miRNA。在mirnawalk和mirdb数据库中进一步搜索表明，这些失调的miRNA肯定鉴定出靶标HSCR相关基因，例如RET，GDNF，BDNF，BDNF，EDN3，EDNRB，ERBB，ERBB，NRG1，NRG1，SOX10；以及神经元迁移和神经发生中暗示的其他基因。最后，我们还可以通过RT-QPCR验证HSCR尿中的一些miRNA变化。总的来说，我们的分析的HSCR队列表现出失调的miRNA表达表达，可以在尿液中检测到。我们的发现为将来使用特定的尿液miRNA特征作为非侵入性HSCR诊断方法开辟了可能性。
lindert-it-influence of-der-dercut-distease.pdf
1恩斯特·赫德曼 - 斯特尔大学罗斯托克大学小儿外科系。8，18057年，德国罗斯托克； marta.de.andrescrespo1@nhs.net 2专业新生儿和儿科外科部，Ormond Street Hospital NHS Trust，伦敦WC1N 3JH，英国； hannah.day@gosh.nhs.uk（H.D.）; joe.curry@gosh.nhs.uk（J.C。）; stavros.loukogeorgakis@gosh.nhs.uk（s.l.）; joseph.davidson@ucl.ac.uk（J.R.D.）3 UCL GOSH儿童健康研究所，伦敦吉尔福德街30号，英国伦敦WC1N 1H，4儿科外科，Graz大学医院，Auenbruggerplatz 34，8036 Graz，奥地利，奥地利； eva.amerstorfer@medunigraz.at 5 Soma E.V. - 由Hirschsprung氏病和厌食直肠畸形的患者组织患者组织，慕尼黑，Blombergstr。 9，81825德国慕尼黑； s.alexander@soma-ev.de（S.A.）; annette.lemli@soma-ev.de（A.L。） 6荷兰尼加兰（Nerlands）的Geert Grooteplein Zuid 32，6525 Njjmegen的Radboudumc Njjmegen小儿手术系； manouk.backes@radboudumc.nl（M.B. ）; pernilla.stenstrom@med.lu.se（P.S.） 16瑞典患者协会Hirschprung Sjukdom患者Föring，袜子25，23253 Akarp，瑞典； info@hirschprung.se 17儿科胃肠病学，儿科系，吕贝克大学，拉特兹伯格大学，全部160，23538lübeck，德国； martina.kohl-sobania@uksh.de *通信：judith.linders@med.uni-rostock.de3 UCL GOSH儿童健康研究所，伦敦吉尔福德街30号，英国伦敦WC1N 1H，4儿科外科，Graz大学医院，Auenbruggerplatz 34，8036 Graz，奥地利，奥地利； eva.amerstorfer@medunigraz.at 5 Soma E.V. - 由Hirschsprung氏病和厌食直肠畸形的患者组织患者组织，慕尼黑，Blombergstr。9，81825德国慕尼黑； s.alexander@soma-ev.de（S.A.）; annette.lemli@soma-ev.de（A.L。）6荷兰尼加兰（Nerlands）的Geert Grooteplein Zuid 32，6525 Njjmegen的Radboudumc Njjmegen小儿手术系； manouk.backes@radboudumc.nl（M.B.）; pernilla.stenstrom@med.lu.se（P.S.）16瑞典患者协会Hirschprung Sjukdom患者Föring，袜子25，23253 Akarp，瑞典； info@hirschprung.se 17儿科胃肠病学，儿科系，吕贝克大学，拉特兹伯格大学，全部160，23538lübeck，德国； martina.kohl-sobania@uksh.de *通信：judith.linders@med.uni-rostock.de）; roxana.rassouli-kirchmeier@radboudumc.nl（R.R.-K。）7意大利Hirschsprung病人协会A.Mor.hi，通过Dei Castani 116，00172，意大利罗马，00172； carlotta.defilippo@cnr.it 8国家研究委员会（CNR）的农业生物学与生物技术研究所（CNR），通过Moruzzi，1，56124 PISA，意大利9号，意大利9号手术和泌尿外科，儿童和泌尿外科系针对儿童和青少年，医科大学andrzej.golebiewski@gumed.edu.pl.pl 10儿科外科手术单元，Ca'foncello医院，Piazzale Dell´ospedale。 paola.midrio@aulss2.veneto.it 11 soma Austria-Selbsthilfeorganationfürbetroffene von Morbus hirbus hirschsprung and anorektale fehlbildungen，Am-Ostrom-Park，Am-Ostrom-Park 11/7，1220 Wien，Austria，Austria，Austria; mazeena.mohideen@soma-austria.at 12儿童发育缺陷系，西里西亚医科大学，波兰Zabrze 41-800； amodrzyk@szpital.zabrze.pl 13荷兰患者协会，Verenig Ziekte van Hirschsprung，HambakenWetering，15，5231'S-HertogenBosch，荷兰； marijke@hirschsprung.nl 14波兰Hirschsprung Facebook Group，波兰； karolina.staszkiewicz@poczta.onet.pl 15Skåne大学医院隆德大学儿科外科系，瑞典隆德22100； lovisa.telborn@med.lu.se（l.t.
乳酸乳酸乳酸Hkyull 10抑制结直肠肿瘤，并通过其产生的α-甘露糖苷酶恢复肠道菌群人类肠神经系统祖细胞移植改善了赫希斯普伦疾病患者衍生的组织的功能反应
抽象目标赫希斯普伦病（HSCR）是一种严重的先天性疾病，影响1：5000活产。HSCR是由于肠神经系统（ENS）祖细胞在胚胎发育过程中完全定植胃肠道的失败而导致的。这会导致远端肠中炎症病，导致运动活性干扰和蠕动受损。当前，唯一可行的治疗选择是对静脉肠道的手术切除。然而，患者经常患有终身症状，经常需要进行多种外科手术。因此，替代治疗选择至关重要。一种有吸引力的策略涉及人类多能干细胞（HPSC）产生的ENS祖细胞的移植。设计ENS祖细胞是使用加速方案从HPSC生成的，并通过单细胞RNA测序，蛋白质表达分析和钙成像的结合详细介绍了。我们使用器官浴收缩力在体内移植向有机型培养的患者衍生的结肠组织后，测试了ENS祖细胞在HSCR结肠中整合和影响功能反应的能力。结果我们发现，我们的方案始终产生具有早期ENS祖细胞的转录和功能标志的细胞群的高收率。移植后，HPSC衍生的ENS祖细胞在外植的人类HSCR结肠样品中整合，迁移并形成神经元/胶质。与对照组织相比，移植的HSCR组织表现出显着增加的基础收缩活性和对电刺激的反应增加。结论我们的发现首次证明了HPSC衍生的ENS祖细胞在人类HSCR患者结肠组织中重新填充和增加功能反应的潜力。
hirschsprung-disease.pdf
摘要：Hirschsprung氏病（HSCR）是一种罕见的发育障碍，其中肠道神经节沿着肠道的一部分缺失。HSCR具有复杂的遗传性，其中RET是致病的主要基因。然而，HSCR的发病机理仍未完全了解。因此，我们针对与HSCR相关的基因/miRNA识别和生物标志物发现基于多摩斯网络表征和聚类分析的计算方法。蛋白质 - 蛋白质相互作用（PPI）和miRNA-靶标相互作用（MTI）网络分别通过DPCLUSO和BICLUSO分析，最后，miRNA-BD筛选了miRNA的生物标志物潜能。在这项研究中，总共确定了55个重要的基因 - 蛋白酶模块，使我们能够提出178个新的HSCR候选基因和两种生物学途径。此外，我们在137个预测的HSCR相关miRNA中确定了12个具有生物标志物潜力的关键miRNA。对新候选者的功能分析表明，与基因本体论（GO）和途径有关的富集术语与HSCR相关。总而言之，这种方法使我们能够破译HSCR的疗法发生的新线索，尽管进一步需要进行分子实验来进行临床验证。
Hirschfeldia incana 的基因组序列，一种提高光合作用利用效率的十字花科新模型
光合作用是维持植物和人类生命的关键过程。提高农作物的光合能力是增加其产量的一种有吸引力的方法。虽然光合作用的核心机制在 C3 植物中高度保守，但这些机制非常灵活，允许光合特性存在相当大的多样性。这种多样性之一是在高辐照度下保持较高的光合光能利用效率，正如在少数特殊的 C3 物种中发现的那样。十字花科的一种植物 Hirschfeldia incana 就是这样一种特殊的物种，由于它易于生长，因此是研究这种性状的遗传和生理基础的绝佳模型。在这里，我们展示了 H. incana 的参考基因组，并证实了其较高的光合光能利用效率。尽管 H. incana 是十字花科中迄今为止光合速率最高的，但与其密切相关的 Brassica rapa 和 Brassica nigra 的光饱和同化率也很高。H. incana 基因组已通过大规模染色体重排、物种特异性转座子活性和重复基因的差异保留与 B. rapa 和 B. nigra 基因组广泛分化。H. incana 、B. rapa 和 B. nigra 中参与光合作用和/或光保护的重复基因在拷贝数和基因表达之间表现出正相关，这为这些物种高光合效率的潜在机制提供了线索。我们的研究表明，H. incana 基因组是研究高光合光能利用效率的进化和提高作物物种光合速率的宝贵资源。
第2章 - 阿尔伯特·赫希曼（Albert Hirschman）：不平衡的成长理论
本章侧重于发展过程的性质，尤其是其主要特征，即是一种不平衡的增长现象。不平衡增长的概念尤其与阿尔伯特·赫希曼（Albert Hirschman）的工作和经济发展战略有关（1958年）。基于六年来在哥伦比亚度过的赫希曼，这本书阐明了一种非常开创性的发展视图，这是一系列不平衡的链条，开设了一项研究议程，这是今天大部分搁置的。21世纪世界经济的发展问题肯定与赫希曼在1950年代观察到的问题不同。尽管如此，诱导的投资，互补性和联系影响是当今发展模式的关键方面。这就是为什么不平衡增长问题进入新兴经济体面前的基本问题的原因。
内皮素 B 受体突变与脑容量减少有关，这是先天性巨结肠症的一个病因
摘要背景：据报道，ET B 可调节胎儿发育中的神经发生和血管调节。已知其功能障碍会导致 HSCR，这是一种无神经节结肠疾病，其综合征形式据报道与小头和发育迟缓有关。因此，我们问道：“中枢神经系统发育不良是 ET B 突变的更普遍特征吗？”为了进行调查，我们查看了 ET B − / − 模型动物 sl/sl 大鼠的微型 CT 扫描，并定量评估了其大脑成分的结构变化。方法：处死 11 只由 ET B + / − 杂交产生的新生大鼠。按照 1.5% 碘染色方案完成微型 CT 扫描。检查所有扫描的形态变化。选定的器官在 NLM 过滤后以半自动方式分割：TBr、T-CC、T-CP、OB、Med、Cer、Pit 和 S&I Col。使用 Drishti 渲染软件进行体积测量。分析后完成大鼠基因分型。基于常染色体隐性遗传，对 sl/sl 组和对照组的器官体积、器官生长率和器官体积/体重比进行统计比较。还进行了单因素方差分析以评估潜在的剂量依赖性效应。结果：sl/sl 大鼠的体重比对照组低 16.32%，生长率低 3.53%。sl/sl 大鼠的大体颅内形态得以保留。然而，在 TBr 中检测到显著的体积减少 20.33%；T-CC、T-CP、OB、Med 和 Pit 的测量值也出现了类似的减少。 sl/sl 大鼠的脑和选定成分的生长率始终较低，降低幅度从 6.21% 到 11.51% 不等。sl/sl 大鼠的器官体积/体重比较低，反映出神经变化与体型不成比例。ET B 拷贝数与颅内器官大小或生长率之间不存在一致的线性关系。结论：尽管 ET B − / − 突变体具有正常的中枢神经系统形态，但检测到脑和成分的尺寸显著减小。这些结构变化可能是由 ET-1/ET-3/ET B 信号传导功能障碍引起的多种因素共同引起的，包括 HSCR 引起的营养不良导致的整体生长障碍以及神经发生、血管生成和脑血管控制失调。这些变化具有重要的临床意义，例如自主神经功能障碍或智力迟钝。虽然有必要进行进一步的人体研究，但我们的研究表明，至少在 ET B − / − 亚型中，HSCR 患者需要综合管理。关键词：神经解剖学、内皮素-B 突变、神经损伤、点状致死大鼠、先天性巨结肠
非编码遗传变异的全基因组分析确定了与先天性巨结肠相关的多尺度调控元件扰动
非编码遗传变异在许多人类疾病中发挥着重要作用这一点已得到广泛认可，但诸多挑战阻碍了对功能性疾病相关非编码变异的鉴定。非编码变异的数量可能是编码变异的许多倍；其中许多变异没有功能但与功能性变异处于连锁不平衡状态；不同的变异可能具有上位性效应；不同的变异可以在不同的个体中影响相同的基因或通路；一些变异彼此相关，不是通过影响相同的基因而是通过影响相同上游调节器的结合。为了克服这些困难，我们提出了一个新颖的分析框架，该框架考虑不同遗传变异对蛋白质结合的趋同影响，从而提供有关与疾病相关的调控元件、基因和通路扰动的多尺度信息。将其应用于 918 名短片段先天性巨结肠患者和匹配对照的全基因组测序数据，我们鉴定出标准单变异和基于区域的测试未检测到的各种新基因，功能上以神经嵴的迁移和发育为中心。我们的框架还鉴定出其结合受非编码变异影响的上游调节剂。使用人类神经嵴细胞，我们确认了列表中三个顶级新调控元件分别在 RET、RASGEF1A 和 PIK3C2B 基因座中的细胞阶段特定调控作用。在 PIK3C2B 调控元件中，我们进一步表明仅在患者中发现的非编码变异会影响神经胶质生成调节剂 NFIA 的结合，并相应地上调同一拓扑关联域中的多个基因。
非编码遗传变异的全基因组分析确定了与先天性巨结肠相关的多尺度调控元件扰动
1 香港中文大学计算机科学及工程学系，香港 2 香港大学李嘉诚医学院外科学系，香港 3 香港大学李达三博士研究中心，香港 4 香港大学李嘉诚医学院生物医学学院，香港 5 香港大学李嘉诚医学院精神病学系，香港 6 香港大学李嘉诚医学院基因组科学中心，香港 7 香港中文大学香港生物信息中心，香港 8 香港中文大学香港糖尿病及肥胖症研究所，香港 * 以上作者对本研究贡献相同
o r i g i n a l r e s a r c h mir-100 rs1834306 a> g增加了南方中国儿童中赫希斯普伦病的风险
背景：Hirschsprung疾病（HSCR）是一种罕见的先天性胃肠道疾病，其特征是缺乏肠粘膜粘膜粘膜和肌层神经节细胞。最近，研究表明，miR-100调节神经元的生长，分化和凋亡，并影响了与HSCR相关途径的功能。显示miR-100 rs1834306 A> G多态性可改变对肿瘤的敏感性，但这种多态性与HSCR敏感性之间的关联仍然未知。方法：这是一项病例对照研究，其中包括来自中国南部的1470例HSCR病例和1473个对照。DNA由Taqman实时PCR进行基因分型。优势比（OR）和95％置信区间（CI）用作统计指标。Results: We found that miR-100 rs1834306 G allele and GG genotype significantly increased HSCR susceptibility (GG vs AA: adjusted OR=1.31, 95% CI=1.04–1.64, P =0.020; G vs A: adjusted OR=1.12, 95% CI=1.01–1.25, P =0.041; GG vs AA/AG:调整后= 1.30，95％CI = 1.07–1.59，p = 0.010）。在分层分析中，与具有AA/AG基因型的型号相比，MiR-100 rs100 rs1834306 GG基因型载体在所有临床亚型中都具有更高的HSCR风险，并且或随着HSCR促进的升高（SHSCR：SHSCR：调整或= 1.28，95％CI = 1.28，95％CI = 1.03-1.59-1.59，p = 0.0.0.0.0.0.0.0.0 cr = 0.029，provation; 95％CI = 1.06–2.07，p = 0.020；调整后= 2.12，95％CI = 1.22–3.69，p = 0.008）。结论：我们的发现表明，miR-100 rs1834306 A> g多态性与南方中国儿童的HSCR易感性增加有关。此外，miR-100 rs1834306 gg基因型在严重的HSCR中具有更大的遗传病原体。关键字：Hirschsprung病，miR-100，多态性，易感性