a 艾克斯-马赛大学,国家科学研究中心 (CNRS),国家健康与医学研究所 (INSERM),保利卡尔梅特研究所,马赛癌症研究中心 (CRCM),法国马赛 b 艾克斯-马赛大学,CNRS,UMR 7051,INP,神经病理学研究所,法国马赛 c 细胞整合生物学研究所 (I2BC),CEA,CNRS,巴黎第十一大学,巴黎萨克雷大学,伊维特河畔吉夫 F-91198,法国 d 儿童癌症研究所,洛伊癌症研究中心,新南威尔士大学悉尼分校,悉尼,新南威尔士州 2052,澳大利亚 e ACRF 儿童癌症药物研发中心,儿童癌症研究所,洛伊癌症研究中心,新南威尔士大学悉尼分校,悉尼,新南威尔士州 2052,澳大利亚 f 艾克斯-马赛大学,马赛公共医院援助,蒂莫内大学医院,法国马赛神经肿瘤科 g 法国马赛 AP-HM La Timone 儿童医院儿科肿瘤科和血液科 h 法国马赛 13385 Metronomics 全球健康倡议
1。巴黎大学,CNRS,Institut Jacques Monod,F-75013法国2。CEA,CEA,CNRS,CNRS综合生物学研究所(I2BC),法国F-91998 GIF-SUR-YVETTE,法国 *这些作者同样贡献了†对应:Maxim.greenberg@ijm.fr摘要,在哺乳动物的胚胎生成期间,两种甲基元素(5-Cyylimens)(5-Cyylimens)( (3D)在称为“表观遗传重编程”的过程中对染色质结构进行了深刻的重塑。表观遗传重编程的一个研究的方面是5mec通量本身如何影响3D基因组。 鉴于DNA结合对染色体折叠的关键调节剂的5mec-敏感性:CTCF。 我们使用小鼠胚胎干细胞(ESC)分化方案对CTCF结合景观进行了介绍,该方案模拟了幼稚多能的退出,其中全局DNA甲基化水平在四天内开始较低,并在四天内提高到躯体水平。 我们利用了这一事实,即缺乏DNA甲基化机制的小鼠ESC表现出全球相似的分化动力学,从而使CTCF不正调对基因表达的更微妙作用进行解剖。 我们通过在野生型和突变条件下进行CTCF HICHIP来评估异常的CTCF-CTCF接触,在没有5mec的情况下。 ,鉴于H3K27AC在主动启动子和增强子上富含H3K27AC,我们继续评估了错误调节的CTCF结合对顺式调节接触的影响。 使用DNA甲基化表观组编辑,我们能够直接证明DNA甲基马克能够影响CTCF结合。CEA,CEA,CNRS,CNRS综合生物学研究所(I2BC),法国F-91998 GIF-SUR-YVETTE,法国 *这些作者同样贡献了†对应:Maxim.greenberg@ijm.fr摘要,在哺乳动物的胚胎生成期间,两种甲基元素(5-Cyylimens)(5-Cyylimens)( (3D)在称为“表观遗传重编程”的过程中对染色质结构进行了深刻的重塑。表观遗传重编程的一个研究的方面是5mec通量本身如何影响3D基因组。鉴于DNA结合对染色体折叠的关键调节剂的5mec-敏感性:CTCF。我们使用小鼠胚胎干细胞(ESC)分化方案对CTCF结合景观进行了介绍,该方案模拟了幼稚多能的退出,其中全局DNA甲基化水平在四天内开始较低,并在四天内提高到躯体水平。我们利用了这一事实,即缺乏DNA甲基化机制的小鼠ESC表现出全球相似的分化动力学,从而使CTCF不正调对基因表达的更微妙作用进行解剖。我们通过在野生型和突变条件下进行CTCF HICHIP来评估异常的CTCF-CTCF接触,在没有5mec的情况下。,鉴于H3K27AC在主动启动子和增强子上富含H3K27AC,我们继续评估了错误调节的CTCF结合对顺式调节接触的影响。使用DNA甲基化表观组编辑,我们能够直接证明DNA甲基马克能够影响CTCF结合。最后,对印迹ZDBF2基因的详细解剖表明,CTCF的5mec-抗抗酸如何允许分化过程中适当的基因调节。这项工作提供了全面的概述,概述了DNA甲基化如何影响早期胚胎事件的相关模型中的3D基因组。
