I/III型IFN和ISG在PBMC中用Poly(I:C)转染为1、4和18H的表达。数据相对于未刺激的细胞,将数据作为基因表达表示。(a)不一致的夫妻中的基因表达,其中绿线代表未感染或无症状的女性在covid-19中表示IFIT3的表达,而红线表示在Covid-19的COVID-19再感染的雄性中的IFIT3表达。(b)在症状女性中的基因表达于19(对照),其中粗线表示IFIT3的表达。(c)对重新感染的雄性之间不同IFIT3基因表达的比较分析,
摘要:小隐孢子虫(C. parvum)是一种原生动物寄生虫,已知会导致断奶前犊牛的隐孢子虫病。免疫抑制的动物和患者有患上这种疾病的风险,这种疾病可能会导致致命的腹泻。本研究旨在基于小隐孢子虫感染者的差异表达基因(DEG)构建网络生物学框架。通过这种方式,小隐孢子虫感染个体的基因表达谱分析可以为我们提供感染条件下活跃表达的基因和转录本的快照。在本研究中,我们分析了微阵列数据集,并将患者的基因表达谱与健康对照的不同数据集进行了比较。使用网络医学方法来识别基因相互作用网络中最具影响力的基因,我们发现了与小隐孢子虫感染相关的必需基因和通路。我们鉴定了 164 个差异表达基因(109 个上调 DEG 和 54 个下调 DEG),并将它们分配到通路和基因集富集分析中。结果支持鉴定七个具有高中心度值的重要枢纽基因:ISG15、MX1、IFI44L、STAT1、IFIT1、OAS1、IFIT3、RSAD2、IFITM1 和 IFI44。这些基因与多种生物过程有关,不仅限于宿主相互作用、1 型干扰素产生或对 IL-gamma 的反应。此外,还发现四个基因(IFI44、IFIT3、IFITM1 和 MX1)参与先天免疫、炎症、细胞凋亡、磷酸化、细胞增殖和细胞信号传导。总之,这些结果加强了基于基因谱的工具的开发和实施,以便在早期识别和治疗隐孢子虫相关疾病。
结果:差异表达分析揭示了IAV,MPV和PIV3感染触发的基因表达的显着变化。MAS和RMAS算法能够对生物标志物进行重点识别,从而揭示了所有病毒中干扰素刺激的基因(例如IFIT1,IFIT2,IFIT3,OAS1)的一致激活。我们的GO分析提供了对宿主的防御机制和利用宿主细胞功能的病毒策略的深刻见解。值得注意的是,细胞结构(例如纤毛组装和线粒体核糖体组装)的变化表明细胞优先级的战略转移。使用多项式逻辑回归对呼吸道病毒感染进行分类的92%的平均准确性得到了验证,这表明我们的方法比传统方法的效率优于传统方法。
Results: South Asians, compared to Europids, had higher mRNA levels of B-cell markers ( CD19 , CD79A , CD79B , CR2 , CXCR5 , IGHD , MS4A1 , PAX5 ; all fold change > 1.3, false discovery rate [FDR] < 0.008) and interferon (IFN)-signaling genes ( CD274 , GBP1 , GBP2 , GBP5 ,fcgr1a/b/cp,ifi16,ifit3,ifitm1,ifitm3,tap1;在南亚人中,IFN信号通路是顶级规范途径(z得分2.6; p <.001),并且伴随着较高的血浆IFN-γ水平(FC = 1.5,FDR = 0.01)。值得注意的是,女性(20/182 [11%])基因表达的种族差异要比男性(2/182 [1%])。结论:与患有T2D的Europid患者相比,南亚T2D患者的IFN信号途径更为激活,女性比男性更为明显。我们推测,与欧洲人相比,更激活的IFN信号途径可能会导致南亚T2D的更快进展。关键词:B淋巴细胞,种族,基因表达,干扰素伽玛,代谢综合征
摘要单龙蛋白(ML)对感染猪流行腹泻病毒(PEDV)的仔猪健康的影响尚未完全了解。这项研究旨在研究其在血液生物化学特征,肠道屏障功能,抗氧化功能以及感染PEDV感染的小猪中的表达中的作用。将32个小猪随机分为四组:对照组,ML组,PEDV组和MLÞPEDV组。小猪在PEDV感染前用ML以100 mg/kg·BW的剂量口服。结果表明,PEDV感染显着降低了D-木糖含量,并增加了肠道脂肪酸结合蛋白含量,这表明PEDV感染破坏了肠道屏障和吸收功能。虽然可以通过ML给药进行修理。此外,ML给药可显着降低PEDV感染后的血浆血液尿素氮和总蛋白质含量。这些结果表明ML可能会提高蛋白质利用效率。mL给药可显着减少大型未染色细胞和HB的数量,并增加了pedv感染的小猪血液中白细胞和嗜酸性粒细胞的数量,表明ML可以改善人体的免疫防御功能。在存在PEDV感染的情况下,ML给药分别显着增加了血液和结肠中的超氧化物歧化酶和过氧化氢酶活性,表明ML可以提高抗氧化能力。这项研究表明,ML可以用作一种饲料添加剂,以促进PEDV感染后的猪健康。此外,ML给药还逆转了整个小肠,在空肠和回肠中的小肠中的ISG15,IFIT3和IL-29的表达,表明该身体正在从PEDV感染中恢复。
