Japonica

稻米亚种和japonica之间形态学特征和全基因组表达模式的区分

摘要：基因表达模式的变化会导致形态特征的变化。这种现象在最近的进化事件（例如农作物驯化和对环境压力的反应）中尤为明显，在这种情况下，表达水平的改变会产生驯养的综合症和适应性表型。大米（Oryza sativa L.）是世界上最关键的谷物作物之一，包括两个在形态上不同的亚种，Indica和Japonica。为了研究这两个水稻亚种之间的形态差异，本研究在相同的培养条件下，总共种植了Indica和Japonica的315个Landrace个体。在这项研究中测得的16个定量性状中，有12个在亚种之间表现出显着差异。为了在整个基因组序列水平上确定Indica和Japonica之间的遗传差异，我们使用包含95个水稻Landrace配件的重新方便的数据集构建了系统发育树。样品形成了两个主要组，它们整齐地对应于两个亚种Indica和Japonica。此外，基于跨五个不同组织的有效表达基因（EEG）的表达量，将12个代表性样本分为两个与两个亚种对齐的主要进化枝。这些结果表明，全基因组表达水平的差异在非压力条件下进行稳定选择，表达水平的进化趋势反映了序列变化水平。这项研究进一步支持了全基因组表达调节变化在两个水稻亚种的差异中的关键作用。