PACBIO RNA测序已被证明提供了最长的读取长度和同工型发现和同工型定量所需的最高质量读取(Pardo-Palacios等,2024)。KINNEX™全长RNA试剂盒采用由ISO-SEQ Express 2.0套件产生的全长cDNA作为输入,并输出一个可进行测序的库,该库与典型的ISO-SEQ库相比导致8倍吞吐量增加。与SMRT®链接软件中的读取细分和ISO-SEQ分析相结合,PACBIO提供了不需要正交测序方法的具有成本效益的同工型测序。SMRT链接软件生产具有大量信息的同工型分类报告,该报告可通过三级分析工具使用。
结果表明,Kinnex 16S测序可以在单个Revio SMRT单元格上以1,536-plex或在续集IIE SMRT单元格上的768-plex下的平均读数> 30k平均读数。图5a显示了续集II系统上的常规全长16S库的显示2.1-330万(M)的读取,而Kinnex则显示为19.6-28.4 m,在Revio系统上,从8.5-10.1 m的Revio系统上读取,而没有Kinnex至62.5–72.5–72.2 m读取Kinnex。 此差异允许每个SMRT单元格多路复用和每个样品的读取深度更高。 将Kinnex 16S与标准FL 16S进行比较,我们发现物种组成有很高的相关性(图5B)。 在20种物种的微生物标准上,Kinnex 16S库与预期的物种表示相比,由于读取深度较高,因此与常规16S库相关(图5C)。显示2.1-330万(M)的读取,而Kinnex则显示为19.6-28.4 m,在Revio系统上,从8.5-10.1 m的Revio系统上读取,而没有Kinnex至62.5–72.5–72.2 m读取Kinnex。此差异允许每个SMRT单元格多路复用和每个样品的读取深度更高。将Kinnex 16S与标准FL 16S进行比较,我们发现物种组成有很高的相关性(图5B)。在20种物种的微生物标准上,Kinnex 16S库与预期的物种表示相比,由于读取深度较高,因此与常规16S库相关(图5C)。