LHB

食肉动物中发散乙型肝炎和C病毒同源物的自然共感染

图2铃声肝炎病毒的基因组表征。（a）左，Ringtail Hepadnavirus（RTHBV）的基因组组织。右：上插入，前S1区域。人类乙型肝炎病毒（HBV）中的必要NTCP结合结构域被突出显示。点表示相同的氨基酸残基。右：较低的插入，比较翻译的前核心和N末端核心结构域。（b）铃声肝病毒（RTHV）的基因组组织。RTHV的结构蛋白颜色为绿色，而非结构性（NS）蛋白为蓝色。 与样本CO-09/924相比，RTHV样本CO-08/923之间的差异显示为黑线，而非同义替代品则显示为橙色三角形。 RTHV内部核糖体入口位点（IRES）和3'UTR的预测结构。 pk，pseudoknot。 （c）RTHBV与其他正腺病毒的成对核苷酸序列距离的比较。 序列距离使用SSE使用300的滑动窗口和80个核苷酸的步长计算。 LHB，大表面蛋白。 （d）RTHV与其他肝病病毒的成对氨基酸序列距离的比较。 序列距离使用SSE使用400个氨基酸的滑动窗口计算。RTHV的结构蛋白颜色为绿色，而非结构性（NS）蛋白为蓝色。与样本CO-09/924相比，RTHV样本CO-08/923之间的差异显示为黑线，而非同义替代品则显示为橙色三角形。RTHV内部核糖体入口位点（IRES）和3'UTR的预测结构。pk，pseudoknot。（c）RTHBV与其他正腺病毒的成对核苷酸序列距离的比较。序列距离使用SSE使用300的滑动窗口和80个核苷酸的步长计算。LHB，大表面蛋白。（d）RTHV与其他肝病病毒的成对氨基酸序列距离的比较。序列距离使用SSE使用400个氨基酸的滑动窗口计算。病毒缩写，名称（GenBank登录号）：RTHBV，Ringtail Hepadnavirus（MZ393519）； GSHV，松鼠肝炎病毒（K02715.1）； LFBHBV，长指的蝙蝠乙型肝炎病毒（JX941466）； RLBHBV，圆形蝙蝠乙型肝炎病毒（NC_024443）; TMBHBV，制造帐篷蝙蝠乙型肝炎病毒（NC_024445）； AGSHV，北极松鼠肝炎病毒（U29144）； TFOHBV，太极肝炎B病毒（MK620908）； DMHBV，家猫B病毒（MH307930）； HBV，乙型肝炎病毒（AP007263）； EQHBV，马乙型肝炎病毒（MT134279）； HCV，肝病毒C（M62321）；懒惰HV（MH844501）; NRHV1，Hepacivivirus G（KJ950938）;松鼠HV，肝病毒P（MG211815）； RTHV，Ringtail Hepaciviviarus（MZ393518）