Donna Curry 培训专家 读写研究中心 田纳西大学,诺克斯维尔 缅因州韦斯特波特岛 Janet Daley ABE/GED 讲师和中心协调员 约翰逊县社区学院 约翰逊县成人教育 堪萨斯州欧弗兰帕克 Mike Dean 成人教育和读写能力部团队负责人 职业和成人教育办公室 美国教育部 华盛顿特区 Jacalyn S. Dennard 教学专家 多切斯特县教育委员会 马里兰州剑桥 Lucy Detig 教学专家 查尔斯县公立学校成人教育计划 终身学习中心 马里兰州沃尔多夫 Howard Dooley 问责主任 罗德岛地区成人学习 (RIRAL) 罗德岛州伍恩索克特 Margery Downey ABE/GED 讲师 约翰逊县社区学院 约翰逊县成人教育 堪萨斯州奥拉西
AD Alzheimer's disease AE adverse event ALS amyotrophic lateral sclerosis API application programming interface AUD Alcohol Use Disorder CMap Connectivity Map DCIC Data Coordination and Integration Center DGE differential gene expression DIA data independent acquisition DToxS Drug Toxicity Signature Generation Center ECM extracellular matrix FAIR findable, accessible, interoperable, reusable FDA Food and Drug Administration GAN generative adversarial network GBM glioblastoma multiforme GCP global chromatin profiling GEO gene expression omnibus GR Growth Rate inhibition GREIN GEO RNA-seq Experiments Interactive Navigator (h)iPSC (human) induced pluripotent stem cell HMS Harvard Medical School KE knowledge environment LINCS Library of Integrated Network-based Cellular Signatures MEP Microenvironment Perturbagen MIT Massachusetts Institute of Technology ML Machine Learning MSDW Mount Sinai Data Warehouse NCATS National Center for Advancing Translational Sciences NIDDK National Institute of Diabetes and Digestive and Kidney Diseases NIH National Institutes of Health OSC Office of Strategic Coordination PBMC peripheral blood mononuclear cell PTM post-translational modification PRISM Profiling Relative Inhibition Simultaneously in Mixtures R&D research and development SMA脊柱肌肉萎缩TAS转录活性评分WGS全基因组测序
LINCS 中心利用深入的基因和蛋白质表达分析来生成可直接映射到 IDG 蛋白质靶标的签名。疾病和表型本体映射是一项社区挑战,有 OMOP 和 UMLS 等实用且可行的解决方案。LINCS 扰动物包括严格定义的化学实体和 IDG 资源 DrugCentral 中包含的小分子药物。因此,LINCS 的大量人类细胞系和实验化学扰动数据集,结合 IDG 的蛋白质靶标(基因和蛋白质 ID)和 DrugCentral 活性药物成分(药物化合物)数据库,为药物靶标发现提供了紧密集成的组合资源。
• 空调/加热器除霜器(过滤和加压) • 气罐放气系统 • 可调节自动提升高度切断 • 自动铲斗调平控制 • 倒车声音警报 • 电池断开开关 • 提升臂和铰接锁 • 刹车灯 • 中央服务 • 数据分析和查看软件 • 数据记录 - 可下载的生产和维护日志 • 驾驶室门联锁 • 带牵引点的牵引杆 • 电喇叭 • 紧急停止按钮(驾驶室和遥控器安装) • 灭火器,手动,20 磅(9.07 千克) • FOPS - 落物保护系统 • 怠速计时器 • 内部灯 • 隔离监视器 • 操纵杆提升和铲斗控制 • 操纵杆转向控制 • 跳跃启动 • 紧急转向 • LED 工作灯 • LINCS II 警报 • LINCS II 负载称重和监控 • 操作员座椅(11 向可调) • 超速警报 • 停车制动器 • 可伸缩四点式肩带 • ROPS - 翻滚保护结构 • 可选油门开关 • 起动器断开开关 • 安全玻璃整个驾驶室 • 转向信号 • 驾驶室内 12VDC 电源 • 12VDC 电源端口 (2) • 挡风玻璃清洗器储液罐 9.8 L • 挡风玻璃雨刷和清洗器(所有驾驶室玻璃) • 自动润滑系统 • 手册:操作员、零件(Link One)、维护和维修 • 动能存储系统 (KESS) • 集成底部保护系统 • 颜色编码和标签的起重点
我们对60种人类衍生的乳腺癌细胞系模型进行了定量蛋白质组学,深度为约13,000个蛋白质。评估了由此产生的高通量数据集的质量和可重复性。我们使用数据集来识别和表征乳腺癌的亚型,并表明它们符合已知的转录亚型,揭示了即使在采样不足的蛋白质特征集中也保留了分子亚型。所有数据集都可以作为Lincs Portal上的公共资源免费提供。我们预计,可以挖掘这些数据集,无论是孤立还是与免费测量,例如基因组学,转录组学和磷蛋白质组学,以预测药物反应,为信号传导途径模型中的细胞系特定环境提供信息,并识别对治疗疗法的敏感性或抗性的标记。
1 弗朗西斯科维多利亚大学实验科学学院,28223 波苏埃洛-德阿拉尔孔,西班牙; fjose.sanchez@ufv.es(FJS-C.); aida.arroyo@ufv.es (AA-F.) 2 国际博士学院,物理治疗、职业治疗、康复和物理医学系,胡安卡洛斯国王大学,28933 阿尔科尔孔,西班牙; y.gonzalezz@alumnos.urjc.es 3 里斯本系统与机器人研究所、里斯本大学高级技术学院生物工程系,里斯本 1049-001,葡萄牙; athanasios.vourvopoulos@tecnico.ulisboa.pt (AV); patricia.figueiredo@tecnico.ulisboa.pt (PF)4 精确科学与工程学院,马德拉交互技术研究所,NOVA LINCS,马德拉大学,9020-105 丰沙尔,葡萄牙; sergi.bermudez@uma.pt 5 神经和认知工程组(gNeC)、自动化和机器人中心(CAR)、西班牙国家研究委员会(CSIC-UPM),28500 Arganda del Rey,西班牙; jignacio.serrano@csic.es 6 脑损伤科,Beata Mar í a Ana 医院,28007 马德里,西班牙 * 通信地址:p.romero.prof@ufv.es;电话:+34-917-091-400
缩写:Acpype,Antchamber Python Parser界面;助理,吸收,分布,代谢,排泄和毒性; ATP,三磷酸腺苷; cAMP,环状AMP,腺苷3',5' - 环状单磷酸盐; DCCM,动态交叉相关矩阵;涂料,离散优化的蛋白质能; DSSP,定义蛋白质的二级结构;美国食品和药物管理局FDA; FEL,自由能景观; GTP,三磷酸鸟嘌呤; Lincs,线性约束求解器; MD,分子动力学; mmpbsa,分子力学泊松 - 玻尔兹曼表面积; NPT,恒定数量的颗粒,系统压力和温度; NVT,恒定颗粒数,系统体积和温度; PCA,主成分分析; PDB,蛋白质数据库; PI,无机磷酸盐; PME,粒子网埃瓦尔德; PPA1,无机焦磷酸酶1; PPI,无机焦磷酸盐; RG,回旋半径; RMSD,均方根偏差; RMSF,根平方波动; SEM,平均值的标准误差;微笑,简化的分子输入线进入系统。
使用转录组数据的药物重新定位研究最近引起了人们的关注。In this study, we attempted to identify new target proteins of the urotensin-II receptor antagonist, KR-37524 (4-(3-bromo-4-(piperidin-4-yloxy)benzyl)- N -(3-(dimethylamino)phenyl)piperazine-1-carboxamide dihydrochloride), using a transcriptome-based drug repositioning approach.为此,我们获得了KR-37524诱导的基因表达分布在四种细胞系(A375,A549,MCF7和PC3)中的变化,并将其与鉴于lincs L1000数据库中可用的药物诱导的基因表达变化的变化进行了比较,以识别出批准的基因表达谱的识别基因表达谱的变化。此处,使用连接得分计算两个基因表达谱变化之间的相似性。然后,我们选择了在每种细胞系中连通性评分最高(总共12种药物)作为KR-37524的潜在靶标的最高连通性评分的最高连接性评分的蛋白质。使用体外结合测定法实验证实了七个潜在的靶蛋白。通过此分析,我们确定了神经学调节的5-羟色胺转运蛋白是KR-37524的新靶蛋白。这些结果表明,基于转录组的药物重新定位方法可用于识别给定化合物的新靶蛋白,我们提供了本研究中开发的独立软件,该软件将作为药物重新定位的有用工具。
切姆斯福德市议会,市政中心,杜克街,切姆斯福德 CM1 1JE|切姆斯福德市议会 切姆斯福德市议会,市政中心,杜克街,切姆斯福德 CM1 1JE|切姆斯福德市议会 切姆斯福德自治市议会,市政中心杜克街切姆斯福德 CM1 1JE|切姆斯福德市议会 安格利亚水务有限公司,开发商服务部,邮政信箱 495,亨廷顿,剑桥郡 PE29 6YY|安格利亚水务 安格利亚水务有限公司,兰开斯特大厦,兰开斯特路,亨廷顿 PE29 6YJ|安格利亚水务 安格利亚水务有限公司,邮政信箱 104,斯伯丁,林肯郡,PE11 1SZ|安格利亚水务 文化媒体和体育部| 英国遗产大臣|英国历史遗产埃塞克斯郡议会,郡政厅,市场路,切姆斯福德,CM1 1LX|埃塞克斯郡议会 Fisher German GPSS,邮政信箱 7273,Ashley De La Zouch LE65 2B7|Exolum Pipeline System Ltd 英国高速公路,伍德兰兹,曼顿巷,贝德福德 MK41 7LW|国家公路国防部|切姆斯福德乡村区国务卿|切姆斯福德市议会社区和地方政府国务卿|能源国务卿|环境国务卿|贸易和工业国务卿|英国工程和建筑国务卿|国务卿