LRTM

LRTM：分子相互作用预测的左右过渡矩阵

摘要 - 分子相互作用对于大多数生物学过程至关重要。发现和鉴定分子之间的潜在关联可以提供对生物学探索，诊断和治疗性干预措施以及药物开发的见解。到目前为止，已经提出了许多相关的计算方法，但是其中大多数通常仅限于特定域，并依靠复杂的预处理程序，这限制了模型将其应用于其他任务的能力。因此，探索准确预测潜在关联的广义方法仍然是一个挑战。在这项研究中，我们提出了用于分子相互作用预测的左右过渡矩阵（LRTM）。从扩散模型的角度来看，我们构造了两个过渡矩阵，以建模无向图信息传播。这允许建模链接的过渡概率，从而有助于分子两部分网络中的链接预测。广泛的实验结果表明，所提出的LRTM算法的性能优于比较方法。此外，所提出的算法具有交叉任务预测的潜力。此外，案例研究表明，LRTM是可以有效地应用于实际应用的强大工具。