为了比较实验,需要使用便携式标准进行DNA测序和分析。这样的标准是多焦点序列分型(MLST),该序列是由Maiden等人首先提出的。[Maiden等,1998]。当前,MLST用于键入流行病学和进化研究的细菌和真菌物种的分离株。有关MLST技术及其应用的最新评论,请参见[Taylor and Fisher,2003; Urwin和Maiden,2003; Sullivan等,2005; Maiden,2006]。
PubMlST多人数据库中存在物种注释,例如非特异性Neisseria sp。已知属但未描述确切物种。如果观察到非特异性注释以及同一属中的物种注释,则计算出的LCTN是物种,例如奈瑟氏菌和奈瑟氏菌。,LCTN是奈瑟氏菌脑膜炎。 但是,如果Neisseria sp。 观察到与不同的属一起观察到,然后计算最低的公共节点。 例如 Neisseria sp。 和Kingella Oralis,计算出的LCTN是neisseriaceae家族节点。,LCTN是奈瑟氏菌脑膜炎。但是,如果Neisseria sp。与不同的属一起观察到,然后计算最低的公共节点。例如Neisseria sp。和Kingella Oralis,计算出的LCTN是neisseriaceae家族节点。