XiaoMi-AI文件搜索系统
World File Search SystemMMP9
以基质金属蛋白酶-9蛋白为靶点的多表位肽通用癌症疫苗的免疫信息学设计
背景：尽管多年来对癌症诊断和治疗进行了广泛的研究，但癌症仍然是一个主要的公共卫生危害，这主要是由于癌症复杂的病理生理学和基因组成。治疗癌症的一种新方法是使用癌症疫苗，但癌症的不同分子基础降低了这种方法的有效性。在这项工作中，我们旨在使用基质金属蛋白酶 9 蛋白 (MMP9) 作为通用癌症疫苗设计的靶点，它是所有类型癌症存活和转移的必需分子。方法：从 NCBI 数据库获取基质金属蛋白酶 9 蛋白的参考序列以及相关序列，然后使用 BioEdit 检查其是否保守，此外，使用 IEDB 网站分析 B 细胞和 T 细胞相关肽。然后使用 chimera 软件可视化最佳候选肽。结果：发现三种肽是与 B 细胞（SLPE、RLYT 和 PALPR）相互作用的良好候选者，而十种肽是与 MHC1 相互作用的良好靶标（YRYGYTRVA、YGYTRVAEM、YLYRYGYTR、WRFDVKAQM、ALWSAVTPL、LLLQKQLSL、LIADKWPAL、KLFGFCPTR、MYPMYRFTE、FLIADKWPA），全球综合覆盖率为 94.77%。此外，还发现 10 个肽段是与 MHC2 相互作用的良好候选肽段（KMLLFSGRRLWRFDV、GRGKMLLFSGRRLWR、RGKMLLFSGRRLWRF、GKMLLFSGRRLWRFD、TFTRVYSRDADIVIQ、AVIDDAFARAFALWS、FARAFALWSAVTPLT、MLLFSGRRLWRFDVK、GNQLYLFKDGKYWRF、NQLYLFKDGKYWRFS），全球综合覆盖率为 90.67%。结论：23
极热对中国湖泊变暖的影响
背景：一种非侵入性子宫内膜癌检测工具，可以准确地有症状的女性进行定义测试，这将改善患者护理。尿液是一种吸引人的生物流体，用于癌症检测，因为它的简单性和易于收集性。这项研究的目的是确定可以区分子宫内膜癌患者与症状对照的基于尿液的蛋白质组学特征。方法：这是一个前瞻性案例 - 对症状的绝经后妇女的控制研究（50个癌症，54例对照）。无效的自我收集的尿液样品进行质谱法处理，并使用所有理论质谱（Swath-MS）的顺序窗口采集进行运行。机器学习技术用于识别重要的歧视性蛋白质，随后使用逻辑回归将其合并在多标记面板中。结果：用于子宫内膜癌症检测的最高歧视性蛋白单独表现出适度的准确性（AUC> 0.70）。但是，结合最歧视性蛋白的算法在AUC> 0.90中表现良好。表现最好的诊断模型是一个10标记的面板，将SPRR1B，CRNN，CALML3，TXN，FABP5，C1RL，MMP9，ECM1，S100A7和CFI结合在一起，并预测子宫内膜癌的AUC为0.92（0.96 - 0.96 - 0.97）。基于尿液的蛋白质特征显示出早期癌症检测的良好精度（AUC 0.92（0.86 - 0.9））。结论：一种患者友好的，基于尿液的测试可以在有症状的女性中提供非侵入性子宫内膜癌检测工具。有必要在较大的独立队列中进行验证。
FGFR2 在 ER 阳性乳腺癌中的预后价值是……
简介：成纤维细胞生长因子受体 2 (FGFR2) 激活与腔内乳腺癌 (BC) 的内分泌治疗耐药性有关，但临床证据仍不一致。鉴于 FGFR 在介导肿瘤微环境 (TME) 相互作用中的作用，FGFR2 的预后价值可能取决于基质成分。本研究旨在验证雌激素受体阳性浸润性导管癌 (IDC) 中基质的 FGFR 相关特征与 FGFR2 预后价值之间的关联。材料和方法：计算机基因表达分析确定了 12 种基质因子（ FAP 、 CXCL12 、 PDG- FRA 、 COL1A1 、 HSPG2 、 CCL2 、 MMP14 、 S100A4 、 MMP9 、 PDGFA 、 MCAM 、 IL6 ），形成了“基质的 FGFR 相关谱”。分析了来自癌症基因组图谱 (TCGA) 的 257 名 ER+ IDC 患者队列。根据基质基因表达使用 k 均值对肿瘤进行聚类，并使用 Cox 比例风险回归模型评估 FGFR2 与总体生存期 (OS) 之间的关联。结果：根据基质基因表达谱确定了两组 ER+ IDC 肿瘤。虽然这两个簇具有相似的肿瘤分期和激素受体状态，但针对临床因素进行的多变量分析显示，FGFR2 表达与簇分配之间存在显著关联。在簇 I（基质基因高表达）中，高 FGFR2 与预后不良相关，而在簇 II（低表达）中，高 FGFR2 表示预后良好。FGFR1、FGFR3 和 FGFR4 没有显示出显著的预后价值。结论：基质谱调节 FGFR2 在管腔乳腺癌中的预后意义，强调 TME 谱对生物标志物评估的重要性并解释 FGFR2 研究中的不一致之处。
研究论文整合网络药理学，分子对接和实验验证，以探索槲皮素的药理机制
慢性非治疗糖尿病伤口（DW）对社会和个人都构成了挑战。先前的研究表明，饮食中等的槲皮素（QCT）有益于预防糖尿病并发症，包括非治疗DW。但是，很少有研究研究了针对DW的QCT相关分子机制。在本研究中，我们首先将网络药理学与分子对接和实验验证进行了研究，以研究与QCT相关的治疗靶标和治疗DW的机制。最后，从在线数据库中获得了191个与QCT相关的靶标和1750个与DW相关的致病靶标。删除重复项后，最终确定了槲皮素的90个潜在的治疗靶标。此外，预测7个具有较高程度的目标，包括IL-6，EGFR，SRC，TNF，AKT1，JUN和MMP9作为QCT的中央治疗靶标，用于治疗DW。功能富集分析表明，QCT施加了强大的多白素调节活动。此外，KEGG富集分析表明，糖尿病并发症中的几种信号通路，包括年龄板信号通路IL-17，PI3K-AKT，TNF，HIF-1，VEGF，被预测为治疗DW处理DW的QCT的关键调节剂。分子对接结果表明，QCT与预测靶标具有强大的结合活性。结合了网络药理学与实验验证，我们首次系统地研究了与DW处理的QCT相关性治疗靶标和潜在途径。此外，验证实验表明QCT可能会显着减弱炎症细胞因子的表达，并且PI3K-AKT信号传导途径的调节可能是QCT药理机制以治疗DW的重要机制。我们的研究可能为DW治疗提供理论基础。
利用网络药理学和分子药物设计研究硝唑尼特治疗肝细胞癌的分子靶点和途径
硝唑尼特已被研究用于治疗结直肠癌和乳腺癌。然而，其分子靶点和途径尚未被探索用于治疗肝细胞癌 (HCC)。利用网络药理学方法，研究了硝唑尼特治疗 HCC 的潜在靶点和分子途径。从 GeneCards 数据库中提取 HCC 靶点。使用 Swiss Target Prediction 和 Super Pred 预测硝唑尼特的潜在靶点。使用 VENNY 在线工具分析相交靶点。使用 Cytoscape 构建了蛋白质-蛋白质相互作用 (PPI)、聚类和核心靶点-途径网络。使用注释、可视化和集成发现数据库 (DAVID)、基因本体 (GO) 和京都基因和基因组百科全书 (KEGG) 进行途径富集分析。使用 Auto Dock Vina 将硝唑尼特与抗 HCC 核心靶点进行分子对接。共鉴定出硝唑尼特168个潜在靶点、13,415个HCC相关靶点和153个交叉靶点。鉴定出前8个抗HCC核心靶点：SRC、EGFR、CASP3、MMP9、mTOR、HIF1A、ERBB2和PPARG。GO富集分析表明，硝唑尼特可能通过影响参与多个生物过程（BP）（蛋白质磷酸化、跨膜受体蛋白酪氨酸激酶（RTKs）信号通路、MAP激酶活性的正向调控等）的基因靶点而发挥抗HCC作用。KEGG通路和核心靶点-通路网络分析表明，癌症中的通路和癌症中的蛋白聚糖是两条对硝唑尼特抗HCC作用有显著贡献的关键通路。分子对接结果显示，抗HCC八大核心靶点与硝唑尼特之间存在活性相互作用的潜力。我们的研究为硝唑尼特可能对HCC具有独特的治疗效果这一观点提供了理论基础，而所确定的药理学靶点和途径可能作为HCC治疗的生物标志物。
Sumitomo Pharma Oncology，Inc。介绍了1/2阶段临床研究的初步数据，以评估M
Sumitomo Pharma肿瘤学，Inc。提供了1/2阶段临床研究的最新初步数据。临床阶段的公司专注于新型的癌症治疗，今天介绍了正在进行的1/2阶段研究的初步数据evaluaɵngtp-3654，这是一种先前用骨髓毛发症（MF）处理的Origifitor的pa tentents inInvestegaɵgaɵgaɵgaɵgaɵgaɵgaɵgaɵvetp-3654。在美国血液学学会（ASH）年度Meeɵng＆Exposiɵ2022中介绍了初步数据。更新结果在欧洲血液学协会（EHA）2023年混合大会的海报中提出，于2023年6月8日至11日在德国法兰克福举行，实际上是在国会pla itm of the Congressplaƞorm上。TP-3654复发/难治性骨髓纤维化（MF）pa的初步数据显示脾脏体积减少（SVR）和总症状评分（TSS）改善。1此外，TP-3654可能会提示可能与症状反应相关的早期细胞因子变化。“我们受到这些初步临床数据的鼓舞，很高兴在迄今为止评估的剂量范围内，TP-3654耐受耐受性，没有骨髓性治疗相关的不良事件（TRAES）。结果表明，在10个可评估的pa nents中有7种观察到≥12周的SVR。TSS的改进。观察到细胞因子中的广泛还原aōerTP-3654治疗。观察到细胞因子中的广泛还原aōerTP-3654治疗。我们的承诺仍然是为了通过附加的临床站点推进该计划，并促进了PotenɵAl治疗的进步，这可能会改善与骨髓纤维化的疾病的结果，” Patricia S.从480毫克QD到720 mg的5个剂量水平在第12周分析中，较高细胞因子还原的pa与更高的TSS改进相关。bmfibosis从3级降低到2级，在一个pa thent中也达到了脾脏和症状反应，并在MF相关的细胞因子中表现出减少：IL6（68％），IL12P40（83％）（83％），MMP9（56％）（56％）（56％），以及（68％），以及（68％），以及AC-RAGE（68％），以比其他ACR AC。1总体而言，TP-3654的耐受性良好，迄今为止未观察到的剂量limiɵng毒性（DLT）。最常见的不良事件是1级和2级腹泻，恶心和Vomiɵng。1“这些更新的口服TP-3654作为在EHA 2023上呈现的MF的单一疗法的初步数据令人鼓舞，因为我们评估了用TP-3654治疗的MF PA的变化。肿瘤学）。“我们期待提出这项研究，以评估TP-3654作为单一疗法的强大作用，以探索与jak抑制剂的探索相结合的机会，以使骨髓纤维状发作。”以下是SMP肿瘤学的细节：
基于多功能水凝胶的慢性糖尿病伤口愈合
*相应的作者在：Coimbra大学药学系科伊布拉大学药学系，葡萄牙Coimbra大学，葡萄牙（F. Veiga）（F. Veiga），Requin/Laqv，药物技术小组，Coimbra University of Coimbra University of Coimbra University of Coimbra，Coimbra，Coimbra，paruga，paruga，A。c。电子邮件地址：fveiga@ci.uc.pt（F。Veiga），acsantos@ff.uc.pt（A.C。Paiva-Santos）。