是睾丸特异性的,免疫组织化学显示蛋白质定位于精子头部的细胞骨架花萼(Hess 等人,1993 年;Hess 等人,1995 年;Rousseaux-Prèvost 等人,2003 年)。为了确定秀丽隐杆线虫 CYLC-1 和 CYLC-2 的定位,我们使用 CRISPR/Cas9 将每个蛋白质内源性地标记为 mNeonGreen (mNG)。我们发现 CYLC-2::mNG 定位于雌雄同体和雄性的精子中(图 1A-F)。检查从雄性解剖的精子细胞显示 CYLC-2::mNG 集中在斑点中(图 1F)。根据它们在精子细胞中的大小和位置,我们预测这些斑点对应于膜状细胞器 (MO)。然而,还需要进一步研究来确认 CYLC-2 是否集中在精子细胞的 MO 中,以及确定精子激活后亚细胞定位是否发生任何变化。
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结果:使用血液作为MNGS测试样品,宿主DNA的比例为99.9%,只有三种细菌,未检测到真菌。在MNG中使用血浆时,宿主DNA的比例约为97%,检测到84个细菌和两种真菌。值得注意的是,分别在43对血液和血浆样品中检测到16S rRNA NGS。血液培养物检测到49种细菌(23个革兰氏阴茎和26克阳性球菌)和4种真菌,其中14种细菌被临床微生物学家视为污染物。对于所有血液培养物,血浆CFDNA MNG检测到78.26%(19/23)革兰氏阴性杆,17%(2/12)革兰氏阳性球菌,没有真菌。与血液培养物相比,血浆CFDNA MNG的敏感性和特异性检测细菌和真菌分别为62.07%和57.14%。
感染仍然是严重的性贫血(SAA)患者死亡率的主要原因,侵入性真菌感染是巨大的威胁。曲霉曲霉占大多数报告的真菌感染病例。在这里,尽管持续存在临床真菌测试,但我们介绍了急性严重性性贫血(VSAA)患者中明阿曲霉感染的病例。由于全年养分为一个月以上,并且间歇性发烧10天,该患者被送往医院。炎症指标升高和异常肺成像提示感染,促使人们考虑了真菌受累。尽管来自多种血液,痰液真菌培养和血清(1,3)-β-D-葡聚糖/半乳糖量测试的阴性。元基因组下一代测序(MNG)在多个血液样本上,以及临床症状,证实了葡萄链球菌感染。脂质体两性霉素B和伏立康唑的靶向抗真菌治疗显着改善了肺症状。此外,本研究还审查并比较了AA患者先前曲霉感染的症状,诊断方法和治疗方法。它强调了早期MNG使用在诊断和管理传染病中的关键作用,从而提供了诊断和治疗VSAA真菌感染的见解。
背景和目的:尽管细菌感染对肝硬化的影响已经很好地描述了,但非肝病病毒(NHV)感染的影响尚不清楚。这项研究评估了循环微生物的基因组片段,这些循环微生物的基因组下一代测序(MNG)在急性代偿性(AD)的个体中,重点是NHV,并将结果与临床结果相关。方法:在研究队列中的129名患有cirhosis AD的个体中进行了血浆MNG。分别招募了十名健康志愿者以及20、39和81名患有稳定的肝硬化,严重败血症和血液学恶性肿瘤的人。在验证队列中进行了人类巨细胞病毒(CMV)重新激活的验证分析(n = 58),并进行了探索治疗。结果:在研究队列中,在74.4%(96/129)的患者中检测到188种微生物,包括病毒(58.0%),细菌(34.1%),真菌(7.4%)和衣原体(0.5%)。在AD患者中鉴定出NHV签名,CMV是最常见的NHV,它与经验抗生素治疗的临床作用,发展为智力肝衰竭和90天死亡率相关。患有急性智力肝衰竭个体的NHV签名与患有败血症和血液学恶性肿瘤患者的NHV签名相似。CMV。进一步验证。三名CMV重新激活患者以探索性的方式接受了Ganciclovir疗法,并经历了临床解决方案。结论:这项研究的结果表明,NHV可能在使AD过程复杂化中起致病作用。需要进一步验证以定义是否应将其纳入肝硬化AD的个体的常规管理中。
摘要:尽管对急性呼吸道(CO)感染具有快速准确的诊断至关重要,但呼吸医学了解当前实验室方法的优势至关重要。在这项研究中,我们用可用的PCR分析测试了鼻咽样品(n = 29),并将结果与基于杂交捕获的MNG的结果进行了比较。阳性PCR样品的检测标准为CT <35,对于MNGS样品,目标覆盖率> 40%,中位深度为1X和RPKM>10。记录了高度的一致性(98.33%PPA和100%NPA)。然而,MNG在PCR以外产生了29种额外的微生物(23种细菌,4种病毒和2种真菌)。然后,我们使用IDBYDNADixplify®平台(Illumina®Inc,San Diego,CA,USA)将每种方法的微生物分为三种表型类别,以考虑感染性和下呼吸道区域的潜在。发现急性上呼吸道感染的全面但与临床相关的微生物学表现很重要,在免疫功能不佳或与合并症呼吸道疾病或传统综合症无法识别病原体的情况下,尤其重要。因此,该技术可用于补充基于当前综合征的测试,并且可以在表型中快速有效地表征数据,以表征用于传播潜力,临床(CO)感染和合并考虑 - 有望降低发病率和死亡率。
a. 按照 ACOG、SMFM 和美国医学遗传学学会 (ACMG) 的建议,在实验室进行的母体 cfDNA 检测不以每种三体性数值风险评分的形式报告阳性预测值 (PPV - 如果检测结果为阳性,则妊娠会受到染色体异常影响的风险) 和残留风险 (尽管检测结果为阴性,但患者妊娠可能受到影响的剩余概率) 结果;或 b. 常规无细胞 DNA 微缺失筛查;或 c. 除筛查胎儿三体性或本 MNG 中未列出的其他染色体疾病之外的其他原因的母体 cfDNA 检测应用;或 d. 为确定胎儿性别(包括诊断性连锁遗传疾病)而进行的母体 cfDNA 检测。
Methods In this observational study, we prospectively performed short-read shotgun metagenomics analysis as a second-line test (in cases of negative first-line test or when the symptoms were not fully explained by initial positive results) or as a first-line test in life-threatening situations requiring urgent non-targeted pathogen identification at the Necker-Enfants Malades Hospital (Paris, France).包括所有样本类型,临床适应症和患者人群。样品伴随着由高级临床医生或病理学家填写的强制性表格,该临床临床水平的可疑感染(定义为高或低)。我们使用多元逻辑回归中的优势比(ORS)评估了与MNGS病原体检测相关的变量(性别,年龄,免疫状态,感染的初始怀疑,指示和样本类型)。使用特定的PCR或培养技术进行了其他研究,以确认MNGS的阳性结果,或者尽管MNG造成阴性,但传染性怀疑何时特别高。
摘要。在2023年4月至11月之间,有27例无法解释的人类死亡,武器肿胀,黑色中心的皮肤疮,呼吸困难,吞咽阻塞,头痛和其他身体疼痛,在乌干达,公共卫生紧急操作中心在乌干达,乌干达。随后,还报道了一些居民在农场对牛的死亡和尸体消费。现场反应团队收集了临床/流行病学数据和尸检样本,以确定死亡原因。元基因组下一代测序(MNGS)和靶富集测序在死后样品上进行的炭疽病芽孢杆菌(炭疽病的病因学者)是死亡的原因。将MNG应用于尸检标本是一种回顾性工具,可用于识别可疑病因爆发期间高导体病原体。