COVID-19大流行强调了迫切需要有效治疗由SARS-COV-2病毒引起的疾病。一种有前途的方法是针对病毒主要蛋白酶(也称为MPRO)的小分子抑制剂的发展。该酶在病毒的复制中起着至关重要的作用,使其成为药物发现的有吸引力的靶标。[3],[4]在这种情况下,Covid Moonshot努力是一项协作和开放科学计划[5],旨在发现针对SARS-COV-2主要蛋白酶的药物。该活动利用众包,高通量结构生物学,机器学习(ML)和分子模拟来识别具有有效纳摩尔活性的新化学系列。通过这项努力,获得了对主要蛋白酶的结构可塑性的全面理解,以及多种化学型和大量生化活动数据集的广泛结构活性关系。值得注意的是,该计划通过公开共享所有复合设计,晶体学数据,测定数据和合成分子,实现了一个重要的里程碑,创建了一个大型
严重急性呼吸综合症冠状病毒2(SARS-COV-2)的受体结合结构域(RBD)及其主要蛋白酶(MPRO)在病毒颗粒的进入和复制中起着至关重要的作用,并且它们的同时推动两者可能是对SARS-COV-2感染的一种诱人方法,可以通过建立“ Double Life ofer of” doubd offer。但是,很少有双重RBD/MPRO靶向剂的报道。在这里,通过结合基于分子对接的筛选和分子动力学模拟的综合虚拟筛选方案发现了四个新型RBD/MPRO双靶向肽,称为MRS 1-4。所有这些分别具有14.4至39.2 nm和22.5 - 40.4 nm的RBD和MPRO的纳摩尔结合。进一步的假病毒感染测定法显示,四个选定的肽在5 µM的浓度下对SARS-COV-2假病毒的抑制作用> 50%,对宿主细胞没有明显的细胞毒性。这项研究导致一类双RBD/MPRO靶向剂的鉴定,这些剂可能被开发为潜在且有效的SARS-COV-2疗法。
摘要背景:Covid-19(2019年冠状病毒病)是由严重的急性呼吸综合症2型(SARS-COV-2)引起的,这构成了明显的全球健康和经济危机,该危机敦促有效治疗。方法:总共11个分子(Baricitinib,Danoprevir,Dexamethasone,Hydrox- Ychloroquine,Ivermectin,lopinavir,甲基甲基甲虫,Remdesivir,Remdesivir,Ritononavir,Ritonavir,Ritonavir和Saridegib和Saridegib,saridegib,saridegib,saridegib,condina contine conto ander cons of tosect in select ins seption condine condine contine condine sout solect solect通过靶向SARS-COV的主要蛋白酶(MPRO)的抗病毒活性,这是一种半胱氨酸蛋白酶,介导病毒复制过程中多蛋白的成熟裂解。结果:三种药物与N3(活性MPRO抑制剂作为对照)表现出更强的结合功能:Danoprevir(–7.7 kcal/mol),remdesivir(–8.1 kcal/mol)和saridegib(–7.8 kcal/mol)。在Glya的Danoprevir-Mpro复合物中鉴定出两个主要的常规氢键:143和GLNA:189,而残基GLUA:166形成了碳 - 氢键。在Asna:142,血清:144,CYSA:145,HISA:163,GLUA:166和GLNA:189的Remdesivir中鉴定出七个主要的常规氢键。与抗坏血酸(–5.4 kcal/mol)相比,头孢氨思显示出对MPRO(–7.9 kcal/mol)的结合性更好(–5.4 kcal/mol)。在HISA:164,POA; 168,GLNA; 189和THRA:190的头孢氨思-Mpro复合物中形成了四个碳 - 氢键。结论:这项研究的发现表明,这些药物可能通过靶向MPRO蛋白来抑制SAR-COV-2病毒。
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SARS-CoV-2 (COVID-19) 是一种正链单链 RNA 病毒,属于冠状病毒家族,由于目前药物匮乏,其触角正在全球蔓延。这种疾病与咳嗽、发烧和呼吸窘迫有关,在全球范围内造成 15% 以上的死亡率。由于 Mpro/3CLpro 在病毒复制中起着至关重要的作用,最近被认为是药物设计的合适靶点。当前的研究重点是 Calotropin(来自巨型牛角椒乳汁的一种成分)对 SARS-CoV-2 中 Mpro 蛋白的抑制活性。迄今为止,还没有对该化合物针对 COVID-19 蛋白的 M pro 进行计算机模拟分析的工作。在本研究中,使用 Patchdock 工具进行了分子对接研究。蛋白质相互作用工具用于蛋白质相互作用。计算出的对接分数等参数表明 Calotropin 与 Mpro 蛋白有效结合。相互作用结果表明,M pro/Calotropin 复合物形成疏水相互作用。因此,Calotropin 可能是一种潜在的草药,可作为 COVID-19 M pro 抑制剂。然而,还需要进一步研究来探究其潜在的药用价值。
给定带有测量活性标记的DNA序列的数据集(图1a),我们用一系列分类令牌(“提示令牌”)编码标签,该标签的前缀为DNA序列的开始(图1b)。我们训练或微调鬣狗模型以采用处理的序列并以及时令牌开始执行令牌预测(图。1C)。这种形式使我们能够明确地使用对模型序列的任何先验知识。一旦受过训练,就可以使用代表任何所需功能的令牌序列来提示语言模型。该模型现在以及时令牌为条件,一次生成一个DNA序列一个核苷酸(图1d)。并行,我们在同一数据集上训练一个监督的序列到活动回归模型(图1E),并将其应用于生成的序列以选择最匹配所需活动的序列(图1F)。这种合并的方法使我们可以将回归模型用作甲骨文,例如以前的模型引导的方法,而语言模型可确保生成的序列具有现实的内容。
摘要尽管开发了化学药物,但由于对使用植物提取物的信心和缺乏资源的信心,传统医学被广泛使用。该调查是由在线调查表通过Google表格进行的,并在28/06/2020和14/08/2020之间在互联网上访问。问卷有两个部分;一个在植物上用作补救措施,或者用于预防与使用这些物种相关的社会人口统计决定因素的共同数据和另一部分。使用自动库克Vina生物信息学工具用于在硅中评估从这些物种对SARS-COV-2的主要蛋白酶(MPRO)获得的植物化学物质的抑制潜力。共有1070名线人参加了这项调查。最有代表性的植物科是lamiaceae家族,最引用的三个物种是柠檬,大蒜和丁香(分别为183、171和150;分别为引文编号)。一项硅内研究表明,糖酸(甘草的活性成分)被揭示为对SARS-COV-2 MPRO的最潜在抑制剂。由于它们在植物化学物质中的丰富度,药用植物可能包含有希望的抗病毒药物质。这些化合物以其生物学活性而闻名,可以增加免疫反应并抗击氧化应激。关键字:药用植物,covid-19,sars-cov-2,在硅饮食中,摩洛哥。1。简介
● 添加了 17 种新的激酶抑制剂,其结构来自 2023 年 8 月提议的 INN 列表 ● 添加了 6 种具有潜在抗 CoV 活性的新配体(Mpro 抑制剂) ● 2023 年 FDA 批准的 41 种药物中有 30 种在 GtoPdb 中进行了整理。我们没有纳入不符合我们纳入标准的集合。 ● 确定并整理了 7 种来自美国和欧盟以外的药物批准。其中 5 种未获得 FDA 批准,2 种在 FDA 之前在其他地方获得批准。
尽管抗病毒药物开发已经增长,并且疫苗已经可以访问,但仍需要具有成本效益且易于适用的治疗方法来打击Covid-19 [13]。可以口服或通过吸入来施用广谱冠状病毒抑制剂,可能在处理新兴的SARS-COV-2变体方面起着至关重要的作用[13]。这种疗法将对未来的致病性冠状病毒的爆发的准备将是极大的[13]。响应于199的大流行,已经对SARS – COV-2蛋白质和病毒细胞蛋白复合物的结构特性进行了许多研究,以找到治疗性干预措施的潜在靶标[14]。尖峰蛋白,主蛋白酶(MPRO),木瓜样蛋白酶(PLPRO)和RNA-脱纤维RNA聚合酶(RDRP)是最深入研究的药理靶标[14]。通常,针对
严重急性呼吸综合征冠状病毒 2 (SARS-CoV-2) 被世界卫生组织 (WHO) 命名为 2019 冠状病毒病 (COVID-19)。1 这种呼吸道病毒已在世界范围内造成严重局势,并对成人和儿童群体产生持久的负面影响。2,3 SARS-CoV-2 属于感染脊椎动物的有包膜正链 RNA 病毒家族。4 其基因组由 14 个功能性开放阅读框 (ORF) 组成,其中包括编码非结构蛋白 (NSP) 以及辅助蛋白和结构蛋白的区域。5 当这种病毒感染宿主细胞时,ORF1a 和 ORF1b 分别通过核糖体移码翻译为多聚蛋白 pp1a 和 pp1ab。 6 然后,NSP 由两种病毒蛋白酶的作用形成,即主蛋白酶 (Mpro),也称为胰凝乳蛋白酶样蛋白酶 3CLpro,以及木瓜蛋白酶样蛋白酶 (PLpro)。最后,具有少量宿主因子的 NSP 是病毒基因组复制的主要参与者,并且