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World File Search SystemMarchesi
在英国不接受的患者中进行的一项大型观察性研究
阿什福德医院 - 阿什福德和圣彼得医院NHS基金会金斯敦基金会 - 金斯敦医院NHS基金会信托基金会信托基金会Addenbrooke医院 - 剑桥大学医院NHS Trust Croydon Health Services -Croydon Health Services NHS Trust NHS NORFOLK关节炎注册表（NOAR）和East Anglia大学（UEA）（UEA）特别感谢Karen Durant和Jack Dainty。我们感谢朱利安·马克西（Julian Marchesi）教授对微生物群的专业意见。
ELI 关于区块链技术、智能合约和消费者保护的原则
项目团队的其他成员 Adrien Basdevant（法国执业律师） Raffaele Battaglini（意大利执业律师） Vincent Danos（法国教授） Primavera de Filippi（法国研究员） Michele Marchesi（意大利教授） William McKechnie（爱尔兰法官） Denis Philippe（比利时教授） Pascal Pichonnaz（瑞士教授） Ernst Steigenga（荷兰执业律师） Teresa Touriñán（西班牙土地注册官） Jos Uitdehaag（荷兰执业律师） Jasper Verstappen（荷兰执业律师） Aura Esther Vilalta Nicuesa（西班牙教授） Jacques Vos（荷兰注册官） Aneta Wiewiórowska-Domagalska（波兰教授） Christopher Wray (英国执业律师) Filippo Zatti (意大利教授) Fryderyk Zoll (波兰教授)
用OMED Health Hearth Analyzer
1- Weaver GA，Krause JA，Miller TL，Wolin MJ。sigmoid镜群中甲烷菌细菌的发生率：甲烷菌细菌和憩室病的关联。肠道。1986 Jun 1; 27（6）：698–704。 2 -Fricke WF，Seedorf H，Henne A，KrüerM，Liesegang H，Hedderich R等。 甲壳磷酸体的基因组序列揭示了为什么这种人类肠道古代仅限于甲醇和H2进行甲烷形成和ATP合成。 J细菌。 2006年1月15日； 188（2）：642–58。 3 -Scanlan PD，Shanahan F，Marchesi Jr。使用MCRA基因分析，健康和患病的结肠组中的人类甲烷激素多样性和发病率。 BMC微生物。 2008年5月20日； 8（1）：79。 4 -Nkamga VD，Henrissat B，Drancourt M. Archaea：人类消化菌群的重要居民。 嗡嗡声微生物组J. 2017年3月1日; 3：1-8。1986 Jun 1; 27（6）：698–704。2 -Fricke WF，Seedorf H，Henne A，KrüerM，Liesegang H，Hedderich R等。甲壳磷酸体的基因组序列揭示了为什么这种人类肠道古代仅限于甲醇和H2进行甲烷形成和ATP合成。J细菌。2006年1月15日； 188（2）：642–58。3 -Scanlan PD，Shanahan F，Marchesi Jr。使用MCRA基因分析，健康和患病的结肠组中的人类甲烷激素多样性和发病率。BMC微生物。 2008年5月20日； 8（1）：79。 4 -Nkamga VD，Henrissat B，Drancourt M. Archaea：人类消化菌群的重要居民。 嗡嗡声微生物组J. 2017年3月1日; 3：1-8。BMC微生物。2008年5月20日； 8（1）：79。 4 -Nkamga VD，Henrissat B，Drancourt M. Archaea：人类消化菌群的重要居民。 嗡嗡声微生物组J. 2017年3月1日; 3：1-8。2008年5月20日； 8（1）：79。4 -Nkamga VD，Henrissat B，Drancourt M. Archaea：人类消化菌群的重要居民。嗡嗡声微生物组J.2017年3月1日; 3：1-8。
肠道菌群的母乳喂养和混合喂养模式
1。引言更多的证据表明人类健康与肠道菌群之间存在关系（Valdes等人。2018;丁等。2019）。微生物群是微生物组的一部分，是指人体上的生物微生物，由细菌，古细菌，真核生物和病毒组成（Marchesi和Ravel 2015； Berg等人，2020）。有一个非凡的微生物群，与人体中的细胞数量相同，其中大多数生活在肠道中（Sender等人2016）。肠道微生物群生态系统的形成是一个复杂但连续的过程，受内部和外部决定因素的影响（Chong etal。2018）。肠道微生物群对于开发免疫系统，调节细胞增殖和防止致病性微生物至关重要（Jandhyala 2015）。近年来，肠道微生物群对人类疾病的影响一直是生物医学研究学会的流行话题（豚鼠和cotter
狗微生物组在健康与疾病中的作用
在土壤中。Marchesi和Ravel（1）在其对微生物基因和蛋白质表达的基因和模式的定义中，在给定的环境中以及其中占据了生物和非生物条件。根据这些作者，微生物生物群包括生活在特定的小众中，例如肠。这两种债务都表明，宏观生态学的一般概念可以轻松用于微生物 - 微生物以及微生物 - 宿主。另一方面，“微生物群”一词首先是由Lederberg和McCraya（2）定义的，以强调居住在健康和疾病中人体的微生物的重要性。摩尔生物是通过摩尔 - 斑点方法鉴定的，主要由16S rRNA基因，18S rRNA基因或其他营销基因和基因组区域的分析，放大和微生物组的测试。微生物组位于身体的严格定义位置，例如在消化道，皮肤，生殖系统，呼吸道，同时以定性和定量术语区分微生物组的微生物组。它们非常适合特定年龄范围内特定物种的个体中的个体（例如新生儿，青少年，成人）。通常，微生物群微生物组执行保护功能，这要归功于一个地方的竞争以及有条件疾病的微生物（3，4）。发现，人类和动物的微生物组也会影响身体的发展和各种功能，将他的研究（5）加强为“新发现的器官”，这对健康有重大影响，通常是决定性因素
Natasha Ali博士出版物：2024年：
和恶性和调查Epicovia。Lahmer T，Salmanton-Garces J，犯罪F，Ashwah S，Nucci M，Besson C，Sili O，Szoli U，Szoli U，Slili U，Dargeniio M，Praet J，Praet J，Van。 Doum J，SchönleinM，RáčilZ，Pulsen CB，Magliano G，Chueo V，Piukovis K，Dragonetti G，Demirkan F，Blennow O，Valković L. GP, Labrador J, Fals-Rome I, Lands of L, Meers S, Passamonti F, Bukicchio C, Lopez-Karcia A, Cursing A, Ormazabal-Velez I, Cuccaro A, Garci-Vadal C, Busca A, Navy N, of MM's Births, Guidetti A, Abu-Zeinah G，Samarks M，Anastasopoulo A B，Ilhan O，GM，M，SK Cath，Amatuna E，Hanakova M，VíšekB，Cabirta A，Northlander A，Nons Rodrigues R，Mersby DS，Hersby DS，Zembrotta GPM，Wolf D.，Wolf D. St. Street R，Prattes J，Egger M，Limongeli A，Bavastro M，Cvetanski M，Dibos M，Rags S，Rahimli L，Cornely Oa Cornelely，Pagano L； Epicoviad注册表。 频率不高。 2024 Jun; 52（3）：191-1 doi：10.1007/s15010-024-0240-XLahmer T，Salmanton-Garces J，犯罪F，Ashwah S，Nucci M，Besson C，Sili O，Szoli U，Szoli U，Slili U，Dargeniio M，Praet J，Praet J，Van。 Doum J，SchönleinM，RáčilZ，Pulsen CB，Magliano G，Chueo V，Piukovis K，Dragonetti G，Demirkan F，Blennow O，Valković L. GP, Labrador J, Fals-Rome I, Lands of L, Meers S, Passamonti F, Bukicchio C, Lopez-Karcia A, Cursing A, Ormazabal-Velez I, Cuccaro A, Garci-Vadal C, Busca A, Navy N, of MM's Births, Guidetti A, Abu-Zeinah G，Samarks M，Anastasopoulo A B，Ilhan O，GM，M，SK Cath，Amatuna E，Hanakova M，VíšekB，Cabirta A，Northlander A，Nons Rodrigues R，Mersby DS，Hersby DS，Zembrotta GPM，Wolf D.，Wolf D. St. Street R，Prattes J，Egger M，Limongeli A，Bavastro M，Cvetanski M，Dibos M，Rags S，Rahimli L，Cornely Oa Cornelely，Pagano L； Epicoviad注册表。频率不高。2024 Jun; 52（3）：191-1doi：10.1007/s15010-024-0240-X
采用 KRAKEN2 和 BOWTIE2 的方法
用于对狗微生物组进行宏基因组分析的数据库的开发：一种采用 KRAKEN2 和 BOWTIE2 的方法 PAULO SALLAROLA TAKAO；帕梅拉·苏萨·科里亚；胡利奥·弗朗茨·莫拉大卫·阿西奥莱·巴博萨； FABIANO BEZERRA MENEGIDIO 摘要 宏基因组分析在了解微生物群落及其环境影响方面发挥着至关重要的作用，在兽医学中对于宠物疾病的诊断、治疗和预防具有特殊意义。这项研究旨在为 Bowtie2 和 Kraken2 工具创建集成数据库，将狗和人类基因组整合成最新且易于访问的资源。随着技术的进步，微生物组的宏基因组分析已成为兽医日常工作中一种很有前途的工具，特别是考虑到兽医诊所中狗的普及率很高，仅在巴西就有大约 5810 万只狗，是家庭中第二大宠物，仅次于鸟类。然而，必要的生物信息学步骤（例如去除宿主基因组和人类污染物）需要大量时间和计算资源。为了克服这一挑战，我们为每种工具开发了特定的数据库，大大减少了分析时间并确保基因组的持续更新。虽然 Bowtie2 执行精确序列比对，但 Kraken2 使用较小的序列（k-mers）进行更快、更有效的分类学分类。数据库构建后，对犬类宏基因组文库进行了测试，结果显示比对率较高，且能有效去除与狗或人类相关的读段。尽管由于缺乏详细的文献而面临挑战，但创建的数据库被证明是可行且可重复的，为未来兽医宏基因组分析研究做出了重大贡献。关键词：家狼，宏基因组，Kraken2-build，Bowtie2-build，污染物。 1 引言 宏基因组分析是对宏基因组进行分类的过程（MARCHESI；RAVEL，2015），宏基因组是基因组学的衍生词，是研究生物体基因的学科。从字面上翻译，宏基因组学是“超越基因组的”，也就是说，在宏基因组学中我们不仅分析一个基因组，还分析样本中包含的所有基因组（GILBERT；DUPONT，2011）。这些基因组可以来自微生物，甚至可以是环境（样本）中的游离 DNA 片段、微生物结构元素的基因、病毒、噬菌体、毒素和其他所有具有遗传物质的东西（BERG 等人，2020 年；HANDELSMAN 等人，1998 年；MERRIAM-WEBSTER，2023 年；WHIPPS；LEWIS；COOKE，1988 年）。那么我们可以将宏基因组分析描述为对给定条件下的微生物基因组集合及其环境条件的分析
Flora Flow
参考：1。Turnbaugh，P。J.和Gordon，J。I.（2009）。核心肠道微生物组，能量平衡和肥胖。《生理学杂志》，587（17），4153-4158。2。Evans，J。M.，Morris，L。S.和Marchesi，J。R.（2013）。 肠道微生物组：虚拟器官在宿主内分泌中的作用。 内分泌学杂志，218（3），R37-R47。 3。 Kau，A。L.，Ahern，P.P.，Griffin，N。W.，Goodman，A。L.，＆Gordon，J。I. （2011）。 人类营养，肠道微生物组和免疫系统。 自然，474（7351），327-336。 4。 fijan，S。（2014）。 具有益生菌特性的微生物：最近文献的概述。 国际环境研究与公共卫生杂志，11（5），4745-4767。 5。 Fooks，L。J.和Gibson，G。R.（2002）。 益生菌作为肠道菌群的调节剂。 英国营养杂志，88（S1），S39-S49。 6。 Gareau，M。G.，Sherman，P。M.和Walker，W。A. （2010）。 益生菌和肠道健康和疾病中的肠道菌群。 自然评论胃肠病学和肝病学，7（9），503-514。 7。 O'Mahony，S.M.，Clarke，G.，Borre，Y。E.，Dinan，T。G.和Cryan，J。F.（2015）。 5-羟色胺，色氨酸代谢和脑甲状腺微生物组轴。 行为大脑研究，277，32-48。 8。 Rossi，M.，Amaretti，A。和Raimondi，S。（2011）。 益生菌的叶酸产生。 营养素，3（1），118-134。 9。Evans，J。M.，Morris，L。S.和Marchesi，J。R.（2013）。肠道微生物组：虚拟器官在宿主内分泌中的作用。内分泌学杂志，218（3），R37-R47。3。Kau，A。L.，Ahern，P.P.，Griffin，N。W.，Goodman，A。L.，＆Gordon，J。I. （2011）。 人类营养，肠道微生物组和免疫系统。 自然，474（7351），327-336。 4。 fijan，S。（2014）。 具有益生菌特性的微生物：最近文献的概述。 国际环境研究与公共卫生杂志，11（5），4745-4767。 5。 Fooks，L。J.和Gibson，G。R.（2002）。 益生菌作为肠道菌群的调节剂。 英国营养杂志，88（S1），S39-S49。 6。 Gareau，M。G.，Sherman，P。M.和Walker，W。A. （2010）。 益生菌和肠道健康和疾病中的肠道菌群。 自然评论胃肠病学和肝病学，7（9），503-514。 7。 O'Mahony，S.M.，Clarke，G.，Borre，Y。E.，Dinan，T。G.和Cryan，J。F.（2015）。 5-羟色胺，色氨酸代谢和脑甲状腺微生物组轴。 行为大脑研究，277，32-48。 8。 Rossi，M.，Amaretti，A。和Raimondi，S。（2011）。 益生菌的叶酸产生。 营养素，3（1），118-134。 9。Kau，A。L.，Ahern，P.P.，Griffin，N。W.，Goodman，A。L.，＆Gordon，J。I.（2011）。人类营养，肠道微生物组和免疫系统。自然，474（7351），327-336。4。fijan，S。（2014）。具有益生菌特性的微生物：最近文献的概述。国际环境研究与公共卫生杂志，11（5），4745-4767。5。Fooks，L。J.和Gibson，G。R.（2002）。益生菌作为肠道菌群的调节剂。英国营养杂志，88（S1），S39-S49。6。Gareau，M。G.，Sherman，P。M.和Walker，W。A. （2010）。 益生菌和肠道健康和疾病中的肠道菌群。 自然评论胃肠病学和肝病学，7（9），503-514。 7。 O'Mahony，S.M.，Clarke，G.，Borre，Y。E.，Dinan，T。G.和Cryan，J。F.（2015）。 5-羟色胺，色氨酸代谢和脑甲状腺微生物组轴。 行为大脑研究，277，32-48。 8。 Rossi，M.，Amaretti，A。和Raimondi，S。（2011）。 益生菌的叶酸产生。 营养素，3（1），118-134。 9。Gareau，M。G.，Sherman，P。M.和Walker，W。A.（2010）。益生菌和肠道健康和疾病中的肠道菌群。自然评论胃肠病学和肝病学，7（9），503-514。7。O'Mahony，S.M.，Clarke，G.，Borre，Y。E.，Dinan，T。G.和Cryan，J。F.（2015）。5-羟色胺，色氨酸代谢和脑甲状腺微生物组轴。行为大脑研究，277，32-48。8。Rossi，M.，Amaretti，A。和Raimondi，S。（2011）。 益生菌的叶酸产生。 营养素，3（1），118-134。 9。Rossi，M.，Amaretti，A。和Raimondi，S。（2011）。益生菌的叶酸产生。营养素，3（1），118-134。9。Malcolm W. Hickey，Alan J. Hillier，G。RichardJago（1986）。乳糖，葡萄糖和半乳糖的运输和代谢。应用环境微生物。; 51（4）：825–831。10。Hyronimus，B.，Le Marrec，C.，Sassi，A。H.，＆Deschamps，A。 （2000）。 酸和形成孢子乳酸细菌的酸和胆汁耐受性。 国际食品微生物学杂志，61（2），193-197。 11。 Karina Pokusaeva，Gerald F. Fitzgerald，Douwe Van Sinderen（2011）。 双歧杆菌中的碳水化合物代谢。 基因营养。 ; 6（3）：285–306。 12。 Whorwell，P。J.，Altringer，L.，Morel，J.，Bond，Y.，Charbonneau，D.，O'Mahony，L。，...＆Quigley，E.M。（2006）。 封装的益生菌双歧杆菌Bifidum 35624在肠易激综合征的女性中的功效。 《美国胃肠病学杂志》，101（7），1581-1590。 13。 Bering S.等，（2006年），“乳酸发酵的燕麦汁会增加育龄女性富含植物剂的饮食中的非haem铁的吸收”。 英国营养杂志，96：80-85。 14。 Cunningham Rundles S.等，（2000），“益生菌和免疫反应”。 Am J Gastroenterol。，95：S22-25。 15。 Makras，L.，Van Acker，G。和De Vuyst，L。（2005）。 乳酸杆菌亚种。 paracasei 8700：2降解了表现出不同程度的聚合的粉蛋白型果糖。 应用和环境微生物学，71（11），6531-6537。 16。 （2013）。 17。Hyronimus，B.，Le Marrec，C.，Sassi，A。H.，＆Deschamps，A。（2000）。酸和形成孢子乳酸细菌的酸和胆汁耐受性。国际食品微生物学杂志，61（2），193-197。11。Karina Pokusaeva，Gerald F. Fitzgerald，Douwe Van Sinderen（2011）。双歧杆菌中的碳水化合物代谢。基因营养。; 6（3）：285–306。12。Whorwell，P。J.，Altringer，L.，Morel，J.，Bond，Y.，Charbonneau，D.，O'Mahony，L。，...＆Quigley，E.M。（2006）。封装的益生菌双歧杆菌Bifidum 35624在肠易激综合征的女性中的功效。《美国胃肠病学杂志》，101（7），1581-1590。13。Bering S.等，（2006年），“乳酸发酵的燕麦汁会增加育龄女性富含植物剂的饮食中的非haem铁的吸收”。英国营养杂志，96：80-85。14。Cunningham Rundles S.等，（2000），“益生菌和免疫反应”。Am J Gastroenterol。，95：S22-25。15。Makras，L.，Van Acker，G。和De Vuyst，L。（2005）。乳酸杆菌亚种。paracasei 8700：2降解了表现出不同程度的聚合的粉蛋白型果糖。应用和环境微生物学，71（11），6531-6537。16。（2013）。17。Smokvina，T.，Wels，M.，Polka，J.，Chervaux，C.，Brisse，S.，Boekhorst，J.，...＆Siezen，R。J.乳杆菌比较基因组学：朝向物种泛基因组的定义和多样性的剥削。PLOS ONE，8（7），E68731。McFarland，L。V.（2010）。 成年患者的糖疗法的系统评价和荟萃分析。 世界胃肠病学杂志：WJG，16（18），2202。McFarland，L。V.（2010）。成年患者的糖疗法的系统评价和荟萃分析。世界胃肠病学杂志：WJG，16（18），2202。
咖啡热循环后先进锂二硅酸盐陶瓷的半透明度、颜色稳定性和双轴弯曲强度
1. Aziz A、El-Mowafy O、Paredes S。使用 CAD/CAM 技术制作的锂二硅酸盐玻璃陶瓷冠的临床结果：系统评价。Dent Med Probl。2020；57(2)：197-206。2. Marchesi G、Camurri Piloni A、Nicolin V、Turco G、di Lenarda R。椅旁 CAD/CAM 材料：临床应用的当前趋势。生物学。2021；10(11)：1170。3. Stawarczyk B、Özcan M、Trottmann A、Schmutz F、Roos M、Hämmerle C。CAD/CAM 树脂块及其牙釉质拮抗剂的双体磨损率。J Prosthet Dent。2013；109(5)：325-332。 4. Arif R、Yilmaz B、Johnston WM。用于层压贴面和全冠的 CAD-CAM 修复材料的体外颜色染色性和相对半透明度。J Prosthet Dent。2019；122(2)：160-166。5. Corado HPR、da Silveira P、Ortega VL 等人。用于 CAD/CAM 的基于锂二硅酸盐和氧化锆增强锂硅酸盐的玻璃陶瓷的抗弯强度。Int J Biomater。2022；2022：1-9。6. Chen Y、Yeung AWK、Pow EHN、Tsoi JKH。锂二硅酸盐在牙科中的现状和研究趋势：文献计量分析。J Prosthet Dent。2021；126(4)：512-522。 7. Abad-Coronel C、Ordoñez Balladares A、Fajardo JI、Martín Biedma BJ。使用 CAD/CAM 系统制造并使用不同热单元和程序结晶的锂二硅酸盐长石修复体的抗断裂性。材料。2021；14(12)：3215。8. Lubauer J、Belli R、Peterlik H、Hurle K、Lohbauer U。把握锂的炒作：洞察现代牙科锂硅酸盐玻璃陶瓷。Dent Mater。2021；38：318-332。9. Gürdal I、Atay A、Eichberger M、Cal E、Üsümez A、Stawarczyk B。热循环后 CAD-CAM 材料和复合树脂水泥的颜色变化。J Prosthet Dent。 2018；120(4)：546-552。10. Phark JH、Duarte S Jr。新型锂二硅酸盐玻璃陶瓷的微观结构考虑因素：综述。牙科美学修复杂志。2022；34(1)：92-103。11. Stawarczyk B、Mandl A、Liebermann A。现代 CAD/CAM 硅酸盐陶瓷及其半透明度以及水热老化对半透明度、马氏硬度、双轴抗弯强度和可靠性的影响。机械行为生物医学材料杂志。2021；118：104-456。12. Gunal B、Ulusoy MM。不同厚度的当代单片 CAD-CAM 修复材料的光学特性。牙科美学修复杂志。2018；30(5)：434-441。 13. Sen N、Us YO。整体式 CAD-CAM 修复材料的机械和光学性能。J Prosthet Dent。2018；119(4)：593-599。14. Kurt M、Banko glu Güngör M、Karakoca Nemli S、Turhan BB。上釉方法对硅酸盐陶瓷光学和表面性能的影响。J Prosthodont Res。2020；64(2)：202-209。15. Donmez MB、Olcay EO、Demirel M。纳米锂二硅酸盐陶瓷在不同老化过程后的抗负载失效性能和光学特性。材料。2022；15(11)：4011。 16. Subas¸ ı MG、Alp G、Johnston WM、Yilmaz B. 厚度对单片 CAD-CAM 陶瓷光学特性的影响。J Dent。2018；71：38-42。17. Çakmak G、Donmez MB、Kashkari A、Johnston WM、Yilmaz B。厚度、水泥色度和咖啡热循环对氧化锆增强锂硅酸盐陶瓷光学性能的影响。J Esthet Restor Dent。2021；33(8)：1132-1138。18. Zarone F、Ruggiero G、Leone R、Breschi L、Leuci S、Sorrentino R。氧化锆增强锂硅酸盐 (ZLS) 的机械和生物学性能：文献综述。J Dent。2021；109：103661。