在2015年,我们定义了有关生物合成基因簇(Mibig)的最小信息:一种标准化的数据格式,描述了最小必需的信息,以独特地表征BGC。我们同时以这种格式构建了一个随附的BGC条目的在线数据库,此后,该数据被社区广泛用作BGC的参考数据集。在这里,我们描述了Mibig 3.0,一个数据库更新,包括大规模验证和重新通知现有条目,与自然产品ATLAS数据库的广泛交联以及669个新条目。特别关注复合结构和生物活性的注释以及蛋白质领域的选择性。在一起,这些新功能使数据库保持最新,并将为科学社区提供新的机会,以便使用其免费可用的数据,例如培训新机器学习模型,以预测各种天然产品的序列结构功能关系。
M. M. Zedouc 1,†,Caire Blin 2, *,†,Nico L.L.louwen 1,豪尔赫(Jorge)的名字,1,卢雷罗(Loureiro)1,Chantal D. Bader 3,Constance B。女人3、6,何塞D.D。节日7,猜测14,我不知道Hanif 15,Eric J.N.由55、70、75,Rile和S59、60,拉奎尔hag AS 67,力量Charri 25,77,77,Hyukjae Choi Chroy 83,Melinda S31,夏洛特和OW,32岁, Robin T以弗39, Al-Sumukh A. Alharthi 52,Mariela Rojo 53,Amr A. Arishi Avalon 56,J。Abr和Av Elar-Rivas 57,Kyle K. AXT 34,Hellen B克里斯汀·比梅尔曼斯(Christine Beemelmanns)3,24, Ricardo M. Borges 67,Rainer Bordes 68,69,Milena Breit 16,17, Cano-Prieto 2,Joy 74,Victor J.31,夏洛特和OW,32岁, Robin T以弗39, Al-Sumukh A. Alharthi 52,Mariela Rojo 53,Amr A. Arishi Avalon 56,J。Abr和Av Elar-Rivas 57,Kyle K. AXT 34,Hellen B克里斯汀·比梅尔曼斯(Christine Beemelmanns)3,24, Ricardo M. Borges 67,Rainer Bordes 68,69,Milena Breit 16,17, Cano-Prieto 2,Joy 74,Victor J.JéromeCollemare 82,JAC。路易斯·卡莱布·达马斯·拉莫斯(Luis Caleb Damas-Ramos 2),达米亚尼(Damiani)87的泰特斯(Titus of Damiani 87在1 95,Erin A. Garza 96,Athina Gavriilidou 23,Andrea Gentiles 97,98,Jennif,hans Gerstmans 100,101,102, Greco 52,Juan E. Green 46,Sebastian War 7,9,Shaday Flores 104, 107,Kristina Haslinger 108,Beibel He 109 109 109 87,Jethro L. Hemmann 110,Hindr和Hindr和1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 1 113 h 2,当耶和华AB 1,114,115,Thanh-Hau Huynh 116和手2,Eunah Jeong 81,Jiayi Jing 1,Jung Jng 116,Yong Kang 116, 121,金122,罗伯特·A。
摘要:我们以前已经报道了从越南作物植物中分离出的59种内孢子粒阳性细菌菌株的基因组序列草案,因为它们能够抑制植物病原体。基于其基因组序列草案,其中11项被分配给Brevibacillus,一个分配给了莱西比氏菌属。进一步的分析(包括完整的基因组测序)表明,其中几种菌株代表了新型基因组菌。体外和体内测定表明了它们促进植物生长的能力,以及针对植物病原细菌,真菌和线虫的Brevibacilli的强生生物防治潜力。基因组开采鉴定的157天然产物生物合成基因簇(BGC),包括Mibig数据库中不存在的36种新型BGC。我们的发现表明与植物相关的Brevibacilli是推定抗菌化合物的丰富来源,并且可能是开发新型生物防治剂的宝贵起点。