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肠道微生物三甲胺在酒精中升高......
1 美国俄亥俄州克利夫兰市克利夫兰诊所勒纳研究所心血管和代谢科学系 2 美国俄亥俄州克利夫兰诊所勒纳研究所微生物组和人类健康中心 3 美国俄亥俄州克利夫兰诊所勒纳研究所炎症和免疫系 4 美国俄亥俄州克利夫兰诊所心血管和胸外科研究所心血管医学系 5 美国俄亥俄州克利夫兰诊所解剖病理学系 6 美国俄亥俄州克利夫兰诊所勒纳研究所定量健康科学系 7 美国肯塔基州列克星敦肯塔基大学医学院儿科系、儿科胃肠病学、肝病学和营养学分部。 8 宝洁公司生命科学转型平台技术部，美国俄亥俄州辛辛那提 9 贝斯以色列女执事医疗中心和哈佛医学院医学系，美国马萨诸塞州波士顿 10 马萨诸塞大学医学院人口与定量健康科学系，美国马萨诸塞州伍斯特 11 美国马里兰州贝塞斯达国家酒精滥用与酒精中毒研究所 12 德克萨斯大学西南医学中心内科系，美国德克萨斯州达拉斯 13 路易斯维尔大学医学系，美国肯塔基州路易斯维尔 * 作者对本文贡献相同 # = 通讯作者：克利夫兰诊所心血管与代谢科学系，美国俄亥俄州克利夫兰 44195。电话：216-444-8340；传真：216-444-9404；电子邮件：brownm5@ccf.org
饲料氨基酸的微生物产生可促进大豆粉的减少和替代
摘要摘要，促进大豆粉减少和取代以及较低的蛋白质饮食技术，中国已成为饲料氨基酸的主要全球生产国。然而，由于氨基酸行业在独立发展工业菌株方面相对较晚而面临重大挑战，从而导致相对落后的主要经济和技术参数以及不那么强大的知识产权框架。合成生物学的快速进步为产生氨基酸的菌株设计和优化提供了有希望的途径，为氨基酸发酵行业提供了新的机会，以增强全球竞争力。这项研究对国内和国际市场对饲料氨基酸的需求进行了深入的分析，系统地回顾了微生物氨基酸生产中的关键技术突破，并确定了家庭氨基酸行业面临的主要挑战。此外，它还进一步探讨了微生物氨基酸产生的未来发展趋势和挑战，并提出了一系列有针对性和全面的解决方案，以提供深入的见解和指导，以为微生物氨基酸行业的稳定和加速增长提供指导。
由混合微生物培养物从废物和废水产生的生物聚合物：微生物选择的策略
摘要生物聚合物正在为商品和特种化学品的生产增强。微生物能够产生各种各样的生物聚合物，其中一些已经生产，而另一些则需要进一步的特征，甚至可以被发现。本评论文章的重点是生物聚合物，例如多酯（多羟基烷酸酯（PHAS），多糖和蛋白质，由于它们能够为已经建立的基于化石的聚合物提供有吸引力的替代品。此外，这些生物蛋白质也可以作为农业蛋白质的替代品。为了降低生产成本并使废物具有新的资源状态，已建议通过使用开放的混合微生物培养物（MMC）生产有机废物的微生物生物聚合物和副产品。MMC强度和弱点分析表明，在复杂的原料应用方面，该系统可能与生产各种微生物聚合物有关。已经开发出用于将微生物群落定向到某些功能的原始原则，并且对该主题进行的研究仍然非常活跃。在本评论文章中，我们认真研究了过去几十年来发现的微生物富集策略，以使开放MMC的生物聚合物生产成为工业现实。
可持续农业生物农药的微生物生产
1印度信息技术学院生物技术系UNA，UNA，UNA 177209，喜马al尔邦，印度喜马al尔邦2 ICAR-Indian Seed Science，Kushmaur，Mau 275103，印度北方邦，印度； ashu.nbaim@gmail.com（a.k. ）; jeevan.kumar@icar.gov.in（P.J.K.S.） 3 Vignan科学，技术与研究基金会，Vadlamudi，Guntur 522213，印度安得拉邦； ad3_res@vignan.ac.in 4 411036，印度马哈拉施特拉邦浦那411036 ICAR-DIRECTIORATE，5 INRAE，Pathologievégégégétale，Montfavet，84140，法国Avignon，法国； Marc.bardin@inrae.fr 6中国Xi'an Jiotong University的电力工程多相关流量实验室，中国710049； eric.lichtfouse@icloud.com *通信：madanverma@iiitu.ac.in或madanverma@gmail.com1印度信息技术学院生物技术系UNA，UNA，UNA 177209，喜马al尔邦，印度喜马al尔邦2 ICAR-Indian Seed Science，Kushmaur，Mau 275103，印度北方邦，印度； ashu.nbaim@gmail.com（a.k.）; jeevan.kumar@icar.gov.in（P.J.K.S.）3 Vignan科学，技术与研究基金会，Vadlamudi，Guntur 522213，印度安得拉邦； ad3_res@vignan.ac.in 4 411036，印度马哈拉施特拉邦浦那411036 ICAR-DIRECTIORATE，5 INRAE，Pathologievégégégétale，Montfavet，84140，法国Avignon，法国； Marc.bardin@inrae.fr 6中国Xi'an Jiotong University的电力工程多相关流量实验室，中国710049； eric.lichtfouse@icloud.com *通信：madanverma@iiitu.ac.in或madanverma@gmail.com3 Vignan科学，技术与研究基金会，Vadlamudi，Guntur 522213，印度安得拉邦； ad3_res@vignan.ac.in 4 411036，印度马哈拉施特拉邦浦那411036 ICAR-DIRECTIORATE，5 INRAE，Pathologievégégégétale，Montfavet，84140，法国Avignon，法国； Marc.bardin@inrae.fr 6中国Xi'an Jiotong University的电力工程多相关流量实验室，中国710049； eric.lichtfouse@icloud.com *通信：madanverma@iiitu.ac.in或madanverma@gmail.com
使用微生物中的3D打印生物膜的水脱盐...
•Curto，D。，Franzitta，V。和Guercio，A。（2021）“对水生气技术的评论”，应用科学，11（2），p。 670。可用：https：//doi.org/10.3390/App11020670。•Michalak，A.M。等。 （2023）“水与卫生的边界”，自然水，1（1），pp。 10–18。 可用：https：//doi.org/10.1038/s44221-022-00020-1•Mpala J.，T。等。 （2023）“膜蒸馏中的生物污染现象：机制和缓解策略”，环境科学：进步，2（1），pp。 39–54。 可用：https：//doi.org/10.1039/d2va00161f。 •Rosińska，W。等。 （2024）‘气候变化对供水系统和水能Nexus的连锁反应 - 审查”，《水资源与工业》，第32页，第32页。 100266。 可用：https：//doi.org/10.1016/j.wri.2024.100266。 •Shah，M.P。 （ed。） （2024）废水处理的生物电化学氧化过程。 Boca Raton：CRC出版社。 可用：https：//doi.org/10.1201/9781003368472。•Michalak，A.M。等。（2023）“水与卫生的边界”，自然水，1（1），pp。10–18。可用：https：//doi.org/10.1038/s44221-022-00020-1•Mpala J.，T。等。（2023）“膜蒸馏中的生物污染现象：机制和缓解策略”，环境科学：进步，2（1），pp。39–54。可用：https：//doi.org/10.1039/d2va00161f。•Rosińska，W。等。（2024）‘气候变化对供水系统和水能Nexus的连锁反应 - 审查”，《水资源与工业》，第32页，第32页。 100266。可用：https：//doi.org/10.1016/j.wri.2024.100266。•Shah，M.P。（ed。）（2024）废水处理的生物电化学氧化过程。Boca Raton：CRC出版社。可用：https：//doi.org/10.1201/9781003368472。
在2018年洪水之后，非常诺夫基纳洞的微生物多样性
诸如A2（Oiylia Pass，-350 m，湿粘土，没有人类访问）和A10（Nemoisto上尉的最后一个摊位-2204 m，带人类探访的干粉砂浆）之类的地点实际上是无菌的，这表明它们受到2018年洪水的严重影响。洪水可能破坏了这些位置的生态系统，冲走了大多数居民微生物多样性，并留下了生物学上贫困的环境。相比之下，相邻的地点A4（粉红色的曲折，-1100 m，湿粘土，带有人类访问的湿粘土），放置最少的人类影响力和A9（Nemoisto上尉的最后一个立场-2200 m，2200 m，干砂，洪水后没有探访）表现出最高的微生物丰富性，表明这些地点
微生物群落和硫酸盐还原
摘要：将分子分析和培养依赖性分离均组合在一起，以研究硫酸盐还原原核生物的多样性，并探索它们在全尺度厌氧消化体（Marrakech，Morocco）中的作用。在全球尺度上，使用16S rRNA基因测序，蛋白质细菌，杆菌植物，坚果，肌动杆菌，协同效应和euryarchaeota是最主要的门。古细菌的丰度（3.1–5.7％）与温度有关。MCRA基因范围为2.18×10 5到1.47×10 7基因拷贝。含有硫酸盐的总序列的5％的硫酸盐还原性的原核生物是peptococaccaceae，syntrophaceae，desulfobulbaceae，desulfobulbaceae，desulfobulbaceae，desulfovibrionaceaceae，syntrophobacteraceae，symtrophobacteraceae，desulfrophobacteraceae，desulfurellelaceae，desulfurellaceae，desulfobaceae。此外，DSRB基因的范围为2.18×10 5到1.92×10 7基因拷贝。结果表明，在厌氧消化过程中，对硫酸盐还原细菌的多样性和功能的探索可能在减少硫酸盐产量（一种不可能的副产品）中起关键作用。
通过肿瘤非正式启发1
。cc-by-nc-nd 4.0国际许可证。是根据作者/资助者提供的预印本（未经同行评审认证）提供的，他已授予Biorxiv的许可证，以在2025年2月5日发布的此版本中显示此版本的版权持有人。 https://doi.org/10.1101/2025.02.05.636605 doi：Biorxiv Preprint
通过肿瘤-正常启发推进微生物比较基因组学 1
。CC-BY-NC-ND 4.0 国际许可证永久有效。它以预印本形式提供（未经同行评审认证），作者/资助者已授予 bioRxiv 许可，可以在该版本中显示预印本。版权所有者于 2025 年 2 月 5 日发布了此版本。；https://doi.org/10.1101/2025.02.05.636605 doi：bioRxiv 预印本
内部和渗透性碳酸盐中的不同微生物群落支持甲烷和新型PMMO多样性的长期厌氧氧化
图1来自DEL MAR和SMM800的甲烷渗氧化甲烷的厌氧甲烷氧化活性。原位AOM指标和CH 3 D速率测量值表征低到高AOM活性碳酸盐。a）渗透碳酸盐收集站点Del Mar（浅绿色标记）和圣莫尼卡Mound 800（SMM800，深绿色标记）位于相距129公里。从Google Maps获得的地图。b）生物地球化学渗透碳酸盐设置。c）c）del mar露头，R1和R2的原位图像起源于顶部，R3和R4，从较近的沉积物。d）R9，来自附近的Del Mar区域，硫化垫有氧化垫。e）烟囱和f）原塑料是两个类似化学的结构，是从圣莫尼卡丘800的不同侧收集的。烟囱恢复后用甲烷积极冒泡。对于比例尺，图像中的红色激光点相距29厘米。g）基于：CH 3 D + SO 4 2-HCO 3- + HS- + HDO，在与单氧化甲烷的缺氧孵育中测量的厌氧甲烷激活率（NMOL D CM -3 D -1）。我们在五个时间点上测量了水的ΔD，除非另有说明，否则从线性增加的速率计算了速率。错误条显示了从线性回归计算出的K的标准误差。分别将带有不同颜色的R9，R9.1和R9.2的两个子样本孵育为AOM速率。无法重建用于费率的R9件的方向。在最后一个时间点（T4）硫化物进行测量，并在R9.1，Chimlet顶部，中间，底部和原子质表面中检测到。在检测下，冲浪。*在T4上仅检测到背景高于背景的氘，表明R2和R3。，B.D。的非线性增加。表面，int。内部，BTM。底部