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Satya Swathi Nadakuduti - 环境园艺
https://hort.ifas.ufl.edu/ 研究兴趣 我们的实验室致力于了解植物的特殊代谢，识别具有农业应用潜力和药用价值的化合物。我们的项目整合了生物化学、基因组学、基因发现和功能表征等多学科方法，以了解这些化合物生物合成的分子机制。我们还对使用基因编辑技术（包括 CRISPR/Cas9）进行有针对性的基因组修饰感兴趣，以改良农业作物和功能基因组学。 专业任命 助理教授（2020 年 1 月至今）研究 50%；教学 50% 美国佛罗里达大学 IFAS 环境园艺系 博士后研究助理 (2015 年 6 月 - 2019 年 12 月) 美国密歇根州立大学 (MSU) 植物土壤和微生物科学系 导师：David S. Douches 博士和 C. Robin Buell 博士 博士后研究助理，(2014 年 6 月 - 2015 年 5 月) 美国密歇根州立大学园艺系。 导师：Cornelius S. Barry 博士 研究助理，德国汉诺威莱布尼茨大学 (2007-2008) 导师：Ralf Uptmoor 博士 教育 博士学位 植物育种、遗传学和生物技术 (2009 年 1 月 - 2014 年 5 月) 美国密歇根州立大学 (MSU) 园艺系 论文：正向遗传学揭示新基因及其在番茄果实发育中的作用。导师：Cornelius S. Barry 博士 植物育种与遗传学硕士（最优等）（2005 – 2008）德国汉诺威莱布尼茨大学园艺生产系统研究所 论文：结合 AB-QTL 分析和生态生理模型来评估干旱胁迫对啤酒大麦叶片发育的影响。 导师：Ralf Uptmoor 博士和 Hartmut Stützel 博士 园艺学学士（金牌得主）（2001 – 2005）印度海得拉巴 Acharya NG Ranga 农业大学
位置：植物分子生物学的博士后研究人员
职位：植物分子生物学的博士后研究人员在佛罗里达大学农业与生命科学学院的Swathi Nadakuduti博士实验室提供了博士后研究职位。开始日期：早在2024年7月，该职位将保持开放，直到填补并开始启动日期。当前博士学位还鼓励即将毕业的学生申请。位置详细信息：Nadakuduti Lab有兴趣使用番茄作为模型系统来解剖果实光合作用的分子机制。DIV将负责通过OMICS数据集的整合来设计假设驱动的研究。博士后将有机会在佛罗里达大学参与分子植物育种，植物生物化学和植物生物技术研究领域的合作小组。博士后预计将培训并为学生和其他实验室成员提供建议。技能：该博士后职位的理想候选者将在以下一个或多个领域具有专业知识：植物分子生物学，植物育种和遗传学，生物信息学。在以下技能集中有经验的候选人：GWAS，基因调控网络的构建，单细胞或散装RNA-Seq，基于CRISPR的基因编辑，EMSA，DAP-SEQ，与番茄模型系统一起工作。博士后预计将学习新技能，并为佛罗里达大学的一个富有成效的合作小组做出贡献。预计博士后将及时发布经同行评审的手稿，并在国家/国际会议上提出研究结果。资格：博士学位在植物生物学，植物育种和遗传学中，植物生物技术或相关领域；以及科学出版物，出色的组织，沟通和人际交往能力的记录；申请人必须能够在研究团队中独立和与他人一起工作。可用于DOSTOC的资金可在联邦资助的赠款中获得。最初的任命为1年，每年可再生。续签任命将取决于研究项目的成功。感兴趣的申请人应发送一个PDF，其中包括：i）研究声明，其中包括候选人在任职期间以postdoc II）II）ii）CV所需提供的研究兴趣和技能来提供的研究兴趣和技能。有关实验室的信息可以在此处找到：Nadakudutilab。关于佛罗里达大学：佛罗里达大学是一家土地授予，授予海洋和太空赠款机构，涵盖了几乎所有的学术和专业学科，招收了60,000多名学生。uf是美国大学协会的成员。食品和农业科学研究所（http://ifas.ufl.edu）包括农业与生命科学学院，佛罗里达农业实验站，佛罗里达州合作推广服务局，佛罗里达海洋兽医学院，佛罗里达海洋助学金，佛罗里达海洋学院，遍布整个阶层，在整个班克斯的学术上，教育范围和教育。佛罗里达大学（UF）主校园位于佛罗里达州盖恩斯维尔。UF拥有多个核心设施，可服务于研究的各个方面，包括生物技术研究中心，该研究中心具有下一代测序和分析，高性能计算hipergerating Hipergator，蛋白质组学和质谱核心设施。
马铃薯的 CRISPR/Cas 基因组编辑
马铃薯 ( Solanum tuberosum L.) (2 n = 4 x = 48) 是人类消费量继大米和小麦之后的第三大重要粮食作物。马铃薯被视为欧洲和美洲部分地区的主食。2018 年，世界马铃薯总产量为 3.6817 亿吨，其中中国（9026 万吨）位居第一，印度（4853 万吨）紧随其后（FAOSTAT，2018 年）。世界人口将从现在的 77 亿增加到预计 2050 年的 97 亿，对粮食供应构成了巨大挑战（联合国，2019 年）。马铃薯易受到各种病原体、害虫和环境非生物胁迫的侵害。在气候变化情景下，情况正在恶化。在印度，主要马铃薯种植邦的平均马铃薯产量（占全国马铃薯产量的 90%）可能会在 2050 年代下降 2.0%，在 2080 年代下降 6.4%（Rana 等人，2020 年）。为了解决这些问题，常规育种在品种开发计划中发挥了关键作用，同时结合标记辅助选择，主要针对晚疫病、病毒和马铃薯胞囊线虫 - 世界各地的抗性品种，例如印度的 Kufri Karan（ICAR-CPRI 年度报告，2018-19 年）。后来，马铃薯转基因技术也得到了开发，以抵抗疾病（如晚疫病和病毒）、非生物胁迫（如高温和干旱）、害虫（如马铃薯胞囊线虫和马铃薯块茎蛾）、加工品质（如降低冷诱导甜度），但它们均未在田间应用。因此，随着测序技术的进步和马铃薯基因组序列的可用性（马铃薯基因组测序联盟，2011），有可能应用基因组学工具（如基因组编辑）来调节目标基因。基因组编辑是一种先进的基因组学工具，可通过基因敲除和插入/缺失诱变来改良作物（Hameed 等人，2018）。它允许在基因组中的特定位点发生双链断裂（DSB），并通过自然发生的 DNA 修复机制进行修复，即非同源末端连接 (NHEJ) 或同源重组 (HR)。过去，该系统早期由蛋白质引导的核酸酶促进，例如锌指核酸酶 (ZFN) 和转录激活因子样效应核酸酶 (TALEN)。但现在，人们的注意力转向了一种新的 RNA 引导核酸酶，称为成簇的规律间隔的短回文重复序列 (CRISPR) — CRISPR 相关 (Cas) (Nadakuduti 等人，2018)。与组装 CRISPR/Cas 相比，TALEN 和 ZFN 需要特殊的专业知识、更长的时间和更高的成本。事实上，据报道，CRISPR/Cas 在作物中的应用取得了巨大进展。在马铃薯中，CRISPR/Cas 已被证明可以改善块茎品质、抗病性（晚疫病和马铃薯 Y 病毒）、表型和其他性状（Dangol 等人，2019 年；Hameed 等人，2020 年；Hofvander 等人，2021 年）。本文介绍了 CRISPR/Cas 的现状、未来前景以及马铃薯面临的挑战。