缩写:5-FU,5-氟尿嘧啶;AA-CoA,花生四烯酸辅酶 A;ABCC1,ATP 结合盒,C 亚家族(CFTR/MRP),成员 1;ACC,无定形碳酸钙;ACLS4,酰基辅酶 A 合成酶家族 4;AdA-CoA,肾上腺酸辅酶 A;ALDH,醛脱氢酶;AML,急性髓细胞白血病;APC,抗原处理细胞;ARE,抗氧化反应元件;ART,青蒿素;BAX,BCL-2 相关 X 蛋白;BCL-2,B 细胞淋巴瘤 2;BTIC,脑肿瘤起始细胞;CBR,临床受益率;CLL,慢性淋巴细胞白血病;CNSI-Fe(II),碳纳米颗粒负载铁;CQ,氯喹;CRPC,去势抵抗性前列腺癌; CSC,癌症干细胞;CTL,细胞毒性 T 淋巴细胞;CuET,二乙基二硫代氨基甲酸铜 (II);DAMP,损伤相关分子模式;DFO,去铁胺;DHA,双氢青蒿素;DLAT,丙酮酸二氢硫酰赖氨酸残基乙酰转移酶成分;DMT1,二价金属转运蛋白 1;DOX,阿霉素;DRD2,多巴胺 D2 受体;DSF,双硫仑;EGFR,表皮生长因子受体;EMT,上皮-间质转化;ER,内质网;ETO,依托泊苷;FDX1,铁氧还蛋白 1;FER-1,铁抑制蛋白 1;FMN,基于框架的纳米剂;FPN1,铁转运蛋白 1;FTH1,铁蛋白重链 1; FTL1,铁蛋白轻链 1;GPX4,谷胱甘肽过氧化物酶 4;GSH,谷胱甘肽;GSS,谷胱甘肽合成酶;H 2 O 2,过氧化氢;HNC,头颈癌;HO-1,血红素加氧酶-1;ICD,免疫细胞死亡;ICIs,免疫检查点抑制剂;IDH1,异柠檬酸脱氢酶 1;IFN-γ,干扰素-γ;IREB2,铁反应元件结合蛋白 2;IREs,铁反应元件;IRP-2,铁调节蛋白 2;IRPs,铁调节蛋白;JAK,Janus 酪氨酸激酶;KEAP1,kelch 样 ECH 相关蛋白 1;KRAS,Kirsten 大鼠肉瘤病毒致癌基因同源物;LA,硫辛酸; LC3II,微管相关蛋白 1 轻链 3α;LDH,乳酸脱氢酶;LiMOFs,锂基金属有机骨架;LIPRO-1,利普司他丁 1;LOX,脂氧合酶;LPCAT3,溶血磷脂酰胆碱酰基转移酶 3;MDA,丙二醛;MFC-Gem,载吉西他滨的碳质纳米粒子;MGMT,甲基鸟嘌呤甲基转移酶;MMNPs,磁性介孔二氧化硅纳米粒子;MMP-2,金属蛋白酶-2;MnFe 2 O 4 ,锰铁氧体;mRNAs,信使 RNA;NEPC,神经内分泌前列腺癌;NF- κ B,活化 B 细胞的核因子 κ 轻链增强子;NFS1,半胱氨酸脱硫酶;NK,自然杀伤细胞; NOX,NADPH 氧化酶 1;NRF2,核因子红细胞 2 相关因子 2;NSCLC,非小细胞肺癌;OC1,耳蜗毛细胞;OS,总生存率;P62,隔离小体 1;PET,正电子发射断层扫描;P-GP,P-糖蛋白;PCC,持久癌细胞;PCN(Fe) MOFs,Fe 3 + 卟啉金属有机骨架上的 PEG;PD-L1,程序性死亡配体 1;PDAC,胰腺导管腺癌;PEG,聚乙二醇;PGE2,前列腺素 E2;PGRMC1,孕酮受体膜成分 1;PHPM,ROS 敏感聚合物;PTX,紫杉醇;PUFA,多不饱和脂肪酸;PUFA-OOH,磷脂多不饱和脂肪酸过氧化物;RIPK-1/2/3,受体相互作用丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶 1/2/3;ROS,活性氧;RR,反应率;siRNA,小干扰 RNA;siSLC7A11,SLC7A11 siRNA;SLC3A2,溶质载体家族 3 成员 2;SLC40A1,溶质载体家族 40 成员 1;SLC7A11,溶质载体家族 7 成员 11;STAT1,信号转导和转录激活因子 1;TAM,肿瘤相关巨噬细胞;TCA,三羧酸循环;TFR,转铁蛋白受体;TME,肿瘤微环境; TMZ,替莫唑胺;TP53,细胞肿瘤抗原 p53;TRADD,肿瘤坏死因子受体 1 型相关死亡结构域蛋白;TTP,进展时间;US FDA,美国食品药品管理局;UTRs,非翻译区;VDAC,电压依赖性阴离子通道;xCT,谷氨酸-胱氨酸反向转运蛋白;Z-VAD-FMK,羧苄氧缬氨酰丙氨酰天冬氨酰-[O-甲基]-氟甲基酮;γ-GCS,γ-谷氨酰半胱氨酸合成酶。 * 通讯作者。电子邮箱地址:mateusz.kciuk@biol.uni.lodz.pl (M. Kciuk)。
抽象背景肿瘤突变负担(TMB)定义为询问的基因组序列的每个兆班堡的体细胞突变数量,证明了对鉴定癌症患者的预测性生物标志物潜力,最有可能对免疫检查点抑制剂做出反应。TMB是通过整个外显子组测序(WES)最佳计算的,但是下一代测序的目标面板以时间效率且具有成本效益的方式提供TMB估计。然而,除了潜在的生物信息学管道外,面板大小和基因覆盖范围的差异是跨实验室TMB估计值的已知驱动因素。通过直接比较来自参与实验室的基于面板的TMB估计值,本研究旨在表征基于面板的TMB估计的理论可变性,并提供有关TMB报告,分析验证要求和参考标准一致性的指南,以维持跨平台TMB估计的一致性。方法十一项实验室使用了来自多种癌症(MC3)样本中的癌症基因组多中心突变的WES数据,并使用其自身的生物信息信息线(PANEL TMB)限制在其目标面板覆盖的基因的外部基因的子集中计算了TMB。使用统一的生物信息学管道从整个外显子组中计算出参考TMB值,所有成员都同意(WES TMB)。线性回归分析,以研究所有32种癌症类型的WES和面板TMB之间的关系。在各种WES TMB值下的面板TMB值的可变性也使用95%的预测限制进行了量化。
抽象背景免疫检查点抑制剂(ICI)疗法已大大提高了非小细胞肺癌(NSCLC)患者的总生存率(OS);但是,它的响应率仍然适中。在这项研究中,我们开发了一个基于机器的基于机器的平台,即基于细胞因子的ICI反应指数(CIRI),以根据外周血细胞因子特征来预测NSCLC患者的ICI反应。方法我们分别在培训和验证队列中分别接受了抗PD-1/PD-L1单一疗法或联合化学疗法的NSCLC患者的123例和99例NSCLC患者。在基线(前)和治疗后6周(治疗期间:EDT)从患者获得的外周血中检查了93种细胞因子的血浆浓度。集合学习随机生存森林分类剂是为了选择特征细胞因子并预测接受ICI治疗的患者的OS。在基线和治疗时分别选择了14个和19个细胞因子,以生成CIRI模型(即PROCIRI14和EDTCIRI19),这两者都成功地鉴定出了两个完全独立的人群中OS较差的患者。在人口水平上,如一致性指数(C-Indices)所示,PROCIRI14和EDTCIRI19的预测准确性分别为0.700和0.751在验证群体中。在单个水平上,CIRI评分较高的患者表现出较差的OS [危险比(HR):0.274和0.163,以及PROCIRI14和EDTCIRI19的P <0.0001和P = 0.0044]。通过包括其他循环和临床特征,在高级模型中观察到了提高的预测功效(PROCIRI21和EDTCIRI27)。验证队列中的c指数分别为0.764和0.757,而PROCIRI21和EDTCIRI27的HRS分别为0.141(P <0.0001)和0.158(P = 0.038)。结论CIRI模型在确定NSCLC患者的抗PD-1/PD-L1治疗方面具有高度准确且可重复性,并且可能有助于在治疗早期和/或治疗早期进行临床决策。
有机太阳能电池(OSC)的功率转化效率超过20%,这是形态优化起着重要作用的进步。普遍认为,加工溶剂(或溶剂混合物)可以帮助优化形态,从而影响OSC效率。在这里,我们开发了对一系列加工溶剂的强大耐受性的OSC,所有设备的高功率转换效率均约为19%。通过研究溶液状态,膜的形成动力学以及经过实验和计算的处理膜的特征,我们确定控制形态的关键因素,即受体材料的侧链与溶剂链的侧链以及供体和受体材料之间的相互作用之间的相互作用。我们的工作为形态控制的长期问题和有效指南提供了新的理解,以将OSC材料设计用于实用应用,在这种应用中,大规模加工需要绿色溶剂。
注意:对于SAA转换器,在转换时间点之前和之后提供了队列特征(即分别使用CSF 𝛼 -SYN SAA-的最后一个时间点,分别与CSF 𝛼 -SYN SAA +的第一个时间点)。n(%),用于连续变量的中位数(IQR)。在支持信息中,表S1提供了临床和生物标志物数据的数据计数和百分比。缩写:β,淀粉样蛋白β; ADAS-COG11,阿尔茨海默氏病评估量表认知子量表11-项目; Ancova,协方差分析;方差分析,方差分析; apoe,载脂蛋白E; CDR-SB,临床痴呆评级盒子的总和; CSF,脑脊液;铜,认知没有受损; MCI,轻度认知障碍; MMSE,小型国会考试; PACC,临床前阿尔茨海默氏症的认知复合材料; p-tau181,磷酸化的tau181; SAA,种子扩增测定法。皮尔森的卡方测试。b单向方差分析。c Fisher精确测试。d Ancova针对年龄,性别,教育,诊断和APOE进行了调整。e Ancova针对年龄,性别,教育,APOE,诊断和CSFAβ42状态进行了调整。f逻辑回归针对年龄,性别,教育,诊断和APOE进行了调整。g配对t检验:所有连续变量; McNemar测试:所有二进制变量;配对标志测试:诊断。
