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Motus：分类分类学组成，转录活性和微生物群落的应变种群
Motu Profiler或Short Motus是一种软件工具，可以从分类学组成，代谢活性成员的丰富性以及菌株群体的多样性方面对微生物群落的生产。为此，它维护了单拷贝系统发育标记基因序列的数据库，该数据库被用作参考，简短读取的元基因组和元文字读数被映射为识别和定量微生物分类群。在这里，我们描述了两个基本协议中最常见的MOTU剖面用例。其他支持协议提供有关其安装和深入指南的信息，以调整其设置，以增加或降低检测和量化分类单元的严格度，以及用于自定义输出文件格式。提供了解释分析结果的指南，以及有关独特功能，方法学细节和工具的开发历史的其他信息。©2021作者。Wiley Perigonicals LLC发布的当前协议。
Optimutu：具有优化阈值的分类学意识到OTU聚类和用于元编码数据的生物信息学工作流程
要将以环境得出的元编码数据转换为社区矩阵进行生态分析，必须首先将序列聚集到操作分类单元（OTU）中。此任务对于包括大量带有不完整参考库的数据，包括大量的分类单元。OptimoTU提供了一种具有分类学意识的OTU聚类方法。它使用一组分类学识别的参考序列来选择最佳的遗传距离阈值，以将每个祖先分类群分组为最与后代分类单元最匹配的集群。然后，查询序列根据初步分类学标识和其祖先分类群的优化阈值聚类。该过程遵循分类学层次结构，从而将所有查询序列的所有查询序列完全分类为命名的分类学组以及占位符“ Pseudotaxa”，这些序列适合无法分类为相应等级的命名分类单元的序列。Optimutu聚类算法是作为R软件包实现的，在C ++中实现了速度的计算密集步骤，并合并了成对序列对齐的开源库库。距离也可以在外部计算，并且可以从UNIX管道中读取，从而允许大型数据集聚类，在该数据集中，整个距离矩阵将不方便地存储在内存中。Optimutu生物信息学管道包括一个完整的工作流程，用于配对端的Illumina测序数据，其中包含了质量过滤，DeNoising，Wratifact删除，分类学分类以及与Optimotu的OTU集群。开发了用于高性能计算簇的OptimoTU管道，并将其缩放到每个样品和数万个样本的数据集中。
耳素相互作用组揭示了小鼠模型中与tauopathy相关的免疫反应和自噬
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Servaas，Elwira，Grelewicz，Olga，Juśkiewicz，Adam，Haber，Mateusz，Mateusz，Czachor，Adrianna，Kotula，Kotula，Alicja，Alicja，Kula，Paula，Paula，Paula，Pony，Pony，Natalia，Natalia和Siemiątkowski，r
杂志在波兰参数评估参数的高等教育和科学部长中已有20分。附件是高等教育和科学部长05.01.2024的环境。很好。32553。有期刊的独特标识符：201398。分配的科学学科：经济学和金融（社会科学领域）；管理和质量科学（社会科学领域）。2019年的部长朋克 - 当前的20分。从05.01.2024日起高中和科学部长。 LP。32553。经常拥有ID时代ID：201398。辞职的科学学科：经济与金融（社会科学的COOM）；转弯和质量科学（社会科学的COOM）。©作者2024;本文在波兰托伦（Torun）的尼古拉斯（Nicolauss）的尼古拉斯（Nicolauss of Nicolauss）开放式尼古拉斯（Nicolauss of Nicolauss）开放式访问中发表了本文。This article is distracted under the therms of the Creative Commons Attribation Attribation Noncommercial License y permits ann noncommercial zse, distraction, and reproducation in an an an an an an a medium, provided the ariginal a carhor (s) and source are Credited.这是根据创意共享属性归因于非商业授权人共享的Ackenses许可的AN OPEN ACCES文章。（http://creativecommons.org/licenses/by-nc-sa/4.0/），只要适当地引用了工作，就可以在任何媒介中不受限制，非商业用途，分发和复制。汽车宣布TER与利益的利益没有冲突，即本文的出版。收到：10.10.2024。修订：19.10.2024。接受：23.10.2024。发布：26.10.2024。
Grassley等人到POTUS -DNA指纹ACTGrassley等人到POTUS -DNA指纹ACT
通过电子传输荣誉约瑟夫·拜登（Joseph R. Biden）美国华盛顿特区白宫副总统兼贝登总统兼哈里斯副总统哈里斯的：2005年，国会通过了《 DNA指纹法案》，该法案授权联邦政府机构收集DNA样本，从被捕，指控，被指控，被定罪的个人和非律师事务所被拘留，并被定罪的人。 1根据特别顾问办公室（OSC）的说法，十年，主要是在奥巴马 - 贝登政府期间，国土安全部（DHS）没有遵守法律以完全收集DNA样本。 2在2019年，在OSC通知未遵守法律的两个月后，特朗普政府司法部（DOJ）发布了一项拟议的联邦规则，以解决该违规行为，该规则于2020年完成。。。 3尽管如此，根据法律保护的举报人的披露，bidenharris政府仍然未能充分实施《 DNA指纹法》，从而对美国人民产生了可预防的后果。 在2021财年，拜登 - 哈里斯政府从海关和边境保护局（CBP）和现场运营办公室（OFO）遇到的190万个人中只有16％收集了DNA。 4此外，在2022财年，DNA仅从270万个人中的37％收集：2005年，国会通过了《 DNA指纹法案》，该法案授权联邦政府机构收集DNA样本，从被捕，指控，被指控，被定罪的个人和非律师事务所被拘留，并被定罪的人。1根据特别顾问办公室（OSC）的说法，十年，主要是在奥巴马 - 贝登政府期间，国土安全部（DHS）没有遵守法律以完全收集DNA样本。 2在2019年，在OSC通知未遵守法律的两个月后，特朗普政府司法部（DOJ）发布了一项拟议的联邦规则，以解决该违规行为，该规则于2020年完成。。1根据特别顾问办公室（OSC）的说法，十年，主要是在奥巴马 - 贝登政府期间，国土安全部（DHS）没有遵守法律以完全收集DNA样本。2在2019年，在OSC通知未遵守法律的两个月后，特朗普政府司法部（DOJ）发布了一项拟议的联邦规则，以解决该违规行为，该规则于2020年完成。3尽管如此，根据法律保护的举报人的披露，bidenharris政府仍然未能充分实施《 DNA指纹法》，从而对美国人民产生了可预防的后果。在2021财年，拜登 - 哈里斯政府从海关和边境保护局（CBP）和现场运营办公室（OFO）遇到的190万个人中只有16％收集了DNA。4此外，在2022财年，DNA仅从270万个人中的37％收集
ASV与Otus聚类：微生物组元编码研究中对α，beta和伽马多样性的影响
在微生物群落测序中，涉及细菌核糖体16S rDNA或真菌ITS，靶向基因是分类学分配的基础。传统的生物信息程序已有数十年的历史使用了一个聚类协议，该协议通过该协议将序列汇总到共享百分比身份的包装中，通常为97％，以产生运营技术单位（OTU）。数据处理方法中的进展导致了最小化技术测序符错误的可能性，这是OTU选择的主要原因，而是分析确切的Amplicon序列变体（ASV），这是一种选择，这会产生较少的聚集读数。我们已经在相同16S的元编码细菌扩增子数据集上测试了这两个程序，这些数据集包含来自17个相邻栖息地的一系列样品，这些样品跨越了700米长的不同生态条件的700米长的样本，这些样本在从农田，通过山地，森林，森林过渡到同一海岸的梯度，从农田跨度跨越了梯度。这种设计允许扫描高生物多样性盆地，并测量该地区的α，β和伽玛多样性，以验证生物信息学对十个不同生态索引和其他参数的值的效果。将两个级别的进行性OTU聚类（99％和97％）与ASV数据进行了比较。结果表明，OTU群集成比例地导致了物种多样性的生态指标值的明显低估，以及有关直接使用ASV数据的主导性和均匀性指数的扭曲行为。多元定序分析在树拓扑和连贯性方面也引起了敏感。总体而言，数据支持这样的观点：基于参考的OTU聚类带来了几种误导性的劣势，包括缺少新颖的分类单元的风险，这些偏见尚未在数据库中引用。由于其替代品作为从头聚类的替代方案，另一方面，由于计算需求较重和结果可比性，尤其是对于包含几种但未表征的物种的环境研究，至少对于原核生物而言，与OTU Clus-Clus-Clus-tering titer titer catiftitions catiftitions cotoff cotoff cotoff cotoff conforp的含义，至少是基于ASV的直接分析。
Geotube®技术艾滋病废水处理...
Geotube®脱水技术成功地用于清理Pantai 2污水处理厂项目中的曝气泻湖。使用该技术使脱水过程能够在曝气泻湖的分段区域内进行，从而克服了该站点上有限的工作空间所带来的挑战。一旦完成工作，拆除了Geotube®脱水单元，并将固体运送到批准的垃圾填埋场进行处置。之后，地面改进工程开始为建造新的治疗厂做准备。
2023 年副总统年度 278
OGE 表格 278e（2021 年 11 月更新）（2024 年 11 月 30 日到期）美国政府伦理办公室；5 CFR nart 2634 \ 表格批准：0MB 编号 (3209-0001) 报告类型：年度 年份（仅限年度报告）：2023 年 任命/终止日期：2021 年 1 月 20 日
