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来自东非裂谷的三个苏打湖的原核和真核微生物多样性，由扩增子测序确定
苏打湖是具有高碱度和盐分的独特聚会环境，尽管具有极端的性质，但仍支持各种微生物群落。在这项研究中，使用Amplicon测序确定了三个苏打湖，阿比亚塔湖，Chitu湖和沙拉湖的样品中的原核和真核微生物多样性。与培养的分析显示，所有三个苏打湖中原核和真核微生物群落的多样性都比以前报道的要高。通过非依赖性的扩增子测序发现了总共3,603个原核生物和898个真核操作分类单元（OTU），而只有134个细菌Otus仅通过丰富的培养物获得3％。这表明在实验室条件下只能培养这些栖息地的微生物的一部分。在三个苏打湖中，来自奇图湖的样品显示出最高的原核多样性，而沙拉湖的样品显示出最低的多样性。Pseudomonadota ( Halomonas ), Bacillota ( Bacillus , Clostridia ), Bacteroidota ( Bacteroides ), Euryarchaeota ( Thermoplasmata , Thermococci , Methanomicrobia , Halobacter ), and Nanoarchaeota ( Woesearchaeia ) were the most common prokaryotic microbes in the three soda lakes.鉴定出高度多样性的真核生物，主要由Ascomycota和basidiomycota代表。与其他两个湖泊相比，在阿比亚塔湖（Lake Abijata）发现了更多的真核OTU。本研究表明，这些独特的栖息地具有多种微生物遗传资源，并可能在生物技术应用中使用，应通过功能性宏基因组学进一步研究。
ancombc.pdf
数据输入数据。数据参数应为矩阵，数据。Thyloseq和TreeMummarizedExperimen对象由特征表（微生物计数表），样品元数据table，分类表（可选）和系统发育树（可选）组成。如果提供了矩阵或data.frame，请确保元数据的行名与示例名称（如果taxa_are_rows为true，则列为列名，否则行名）。如果使用了Teyloseq或TreeMummarizedExperiment，则该标准已经实施。有关详细信息，请参阅“ Thyloseq :: Teyloseq或？treemarmarizedExperiment :: TreemummarizedExperiment”。建议使用低分类学水平，例如OTU或物种水平，因为对抽样部分的估计需要大量分类单元。
在尼日利亚农村将电子活动与迷你网格整合在一起
●SIPA教师顾问，Christine Capilouto教授对Capstone项目的指导和监督。●尼日利亚的农村电气化机构（REA）在我们在尼日利亚逗留期间的热情款待 - 安排对Petti和Toto的现场访问，提供他们对迷你网格的见解，并将团队与其他利益相关者联系起来。特别感谢David Otu的勤奋努力和与REA的有效沟通，以确保富有成效的国内访问。●哥伦比亚大学的国际公共事务学院（SIPA）提供了有关旅行物流的财务支持和指导●尼日利亚政府的专家和从业人员，非营利组织，公司和多边组织以及学术界，并咨询了学术界，以分享他们的宝贵知识和专业知识。
生物和非生物因子塑造与广泛的蕨类植物（Ophioglossaceae）的根源有关
Arbuscular mycorrhizal真菌（AMF）通过与地下社区和下面的社区以及影响Edaphic特性相互作用，在陆地生态系统中扮演着重要角色。与Fern botrychium luna-ria（Ophioglossaceae）的根部相关的AMF群落在2400 m A.S.L.的四个样带中采样。在瑞士阿尔卑斯山中，并使用元法编码进行了分析。在71个样本中鉴定了五个肾小球菌的成员。我们的分离揭示了由四个丰富的Glomus操作分类单元（OTUS）以及样品之间的低OTU更新组成的核心微生物组。AMF社区不是空间结构化的，这与与被子植物相关的大多数螺柱形成对比。pH，微观连通性和腐殖质覆盖物显着
化学改良抑制剂的细胞验证鉴定出 OTUB2 上的单泛素化
摘要：泛素硫酯酶 OTUB2 是一种来自卵巢肿瘤 (OTU) 去泛素酶超家族的半胱氨酸蛋白酶，在肿瘤进展和转移过程中经常过度表达。因此，OTUB2 抑制剂的开发被认为具有治疗重要性，但针对 OTUB2 的有效且选择性小分子抑制剂却很少。本文，我们描述了一种改进的 OTUB2 抑制剂 LN5P45 的开发，该抑制剂包含一个与活性位点半胱氨酸残基共价反应的氯乙酰肼部分。LN5P45 在活细胞中表现出出色的靶标参与度和蛋白质组范围的选择性。重要的是，LN5P45 以及其他 OTUB2 抑制剂强烈诱导 OTUB2 在赖氨酸 31 上的单泛素化。我们提出了未来 OTUB2 相关治疗的途径，并表明本研究开发的 OTUB2 抑制剂有助于揭示相关生物学的新方面，并开启有关理解 OTUB2 在翻译后修饰水平上的调控的新问题。■ 介绍
Biome-Preserve微生物组收集套件
将来自单个捐赠者的粪便均匀化，在露天环境中添加到含氧气并存储在各种时间点的露天环境中。在存储后，将管子的一个子集冷冻在-80ºC下7天。所有条件均以一式三份设置。新鲜的同质凳子，存放在生物群式装置中的凳子，并存放在生物蛋白蛋白酶装置中的凳子，然后在各种固体琼脂培养基上厌氧培养，以比较物种恢复。收集细菌生长并处理浅基因组shot弹枪测序（平均每个样品读数为400万）。分析了在过滤方案后在物种水平上确定的操作分类单元（OTU）。在收获的细菌材料中相对丰度> 0.01％的物种被认为已成功恢复。
A20 与非催化泛素结合可预防银屑病关节炎样疾病和炎症
A20 是一种与人类疾病密切相关的抗炎蛋白。我们发现，表达 A20 的 ZF7 泛素结合基序的三种不同靶向突变的小鼠一致地发展出与银屑病关节炎具有相同特征的指关节炎，而表达 A20 的 OTU 或 ZF4 基序点突变的小鼠则没有表现出这种表型。A20 ZF7 小鼠的关节炎需要 T 细胞和 MyD88，对肿瘤坏死因子 (TNF) 和白细胞介素 17A 极其敏感，并且在无菌条件下持续存在。A20 ZF7 细胞表现出延长的 IKK 激酶活性，这导致体外和体内患病前小鼠爪中晚期 NF- κ B 反应基因的过度转录。此外，在 A20 的 ZF4 和 ZF7 基序中表达双突变 A20 蛋白的小鼠在围产期死于多器官炎症。因此，A20 的 ZF4 和 ZF7 基序以非催化方式协同预防炎症性疾病。
术后放疗的生存益处...
蛋白质泛素化在蛋白质稳态中起关键作用。泛素化可能调节蛋白质的稳定性，活性，蛋白质 - 蛋白质相互作用和定位。泛素化受到两组对抗酶，E3泛素连接酶和去泛素酶的调节。始终如一地，去泛素酶与所有生物过程有关。OTUB1，一种OTU家庭去泛素酶，是发育，癌症，DNA损伤反应和免疫反应的关键调节剂。OTUB1通过至少两种不同的机制拮抗广泛的蛋白质的泛素化。除了直接去泛素化外，OTUB1还可以通过从某些泛素 - 偶联酶（E2）中抑制泛素转移来抑制泛素化。在这篇综述中，我们从蛋白质泛素化和去泛素化的一般背景开始。接下来，我们介绍OTUB1的基本特征，然后详细介绍OTUB1的更新生物学功能。之后，我们讨论了OTUB1功能的多功能性和特定性的潜在机制。最后，我们讨论了OTUB1可能是癌症的潜在治疗靶点的观点。
在生物膜中开发微生物群落和混合反应器中的活化污泥
微生物在生物废水处理中起关键作用。由于各种微生物结构的不同条件，生物质形式的形式决定了有机化合物转化的效率和机制。但是，比较生物膜和活性污泥中微生物群落的研究结果经常发生冲突。因此，本研究比较了使用16S rRNA测序的杂种反应器中生物膜中细菌群落和活化污泥的组成和发展。统计分析包括鉴定生物膜特征和活性污泥，α和β多样性分析以及网络分析的分类单元。这些分析表明，生物膜细菌群落比激活的污泥社区更丰富，更多样化。在生物膜中的平均数量为1614，而活化污泥的平均数为993，而CHAO1（1735 vs. 1105）和Shannon（5.3 vs. 4.3）生物多样性指数的平均值显着更高。生物膜是硝化剂（例如硝基瘤，硝基螺旋体）和磷积聚生物体（Candidatus累积）的更好环境。生物膜共发生网络中的细菌彼此之间具有更多的连接（基于Spearman的等级相关系数），这表明它们的相互作用比活性污泥中的相互作用更多。
PD-1/PD-L1在癌症免疫疗法中的泛素化/去泛素化修饰的新兴作用 血清三甲胺氧化胺水平升高，作为糖尿病肾脏疾病的潜在生物标志物 引用Antunes MSM，Sugiyama FHC，Gravina HD，Castro RC，Mercado FJR，Lima JO，Fontanari C和Frantz FG（2023）Covid-19灭活和非Replica
缩写：b -trcp，β-transducin重复蛋白； CBL-B，Casitas B淋巴瘤B； C-CBL，Casitas B谱系淋巴瘤； COP1，组成性的光型1; CSN5，组成型光形态发生9信号体5; DCUN1D1，有缺陷的Cullin Neddylation 1含域1;配音，去泛素化酶； FBXO38，仅F-box蛋白38; FBXW7，F-box，具有7个串联WD40重复； HRD1，HMG-COA还原酶降解蛋白1; KLHL22，Kelch喜欢家庭成员22； OTUB1，含有OTU结构域的泛素醛蛋白1； PD-1，编程死亡-1； PD-L1，编程死亡-1配体； PTM，翻译后修改； RBX1，环盒蛋白1；汤匙，斑点型poz蛋白； Stub1，stip1同源性和含有蛋白质1的u-box E； UPS，泛素蛋白酶体系统； USP7，泛素特异性蛋白酶7; USP9X，泛素特异性肽酶9，X连接； USP22，泛素特异性蛋白酶22。*通讯作者。1 Xinsi Road，Xi'an，Shaanxi 710038，中国。**通讯作者。中国北京100853的海德安，豪德路28号。***通讯作者。1 Xinsi Road，Xi'an，Shaanxi 710038，中国。电子邮件地址：hanjing.cn@163.com（J。Han），huyi301zlxb@sina.com（y. hu），yanxiaolong@fmmu.edu.edu.cn（X。yan）。在重庆医科大学的责任下进行同伴审查。1这些作者为这项工作做出了同样的贡献。