数据输入数据。数据参数应为矩阵,数据。Thyloseq和TreeMummarizedExperimen对象由特征表(微生物计数表),样品元数据table,分类表(可选)和系统发育树(可选)组成。如果提供了矩阵或data.frame,请确保元数据的行名与示例名称(如果taxa_are_rows为true,则列为列名,否则行名)。如果使用了Teyloseq或TreeMummarizedExperiment,则该标准已经实施。有关详细信息,请参阅“ Thyloseq :: Teyloseq或?treemarmarizedExperiment :: TreemummarizedExperiment”。建议使用低分类学水平,例如OTU或物种水平,因为对抽样部分的估计需要大量分类单元。
主要关键词