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World File Search System分类学
探索分类学和
海底地下水排放（SGD）是指水从土地到沿海水域的运动，跨越了土地海洋界面（Adyasari等，2019）。SGD无处不在沙质，岩石和泥泞的海岸线，可能包括陆地起源的新地下水，循环海水或两者的组合（Adyasari等，2019; Santos等，2021）。在这些区域中存在SGD的存在会导致物理和化学梯度创造独特的生物地球化学环境。SGD充当材料运输（例如气体，养分和微量金属）的渠道（Moore，2010; Hanee and Paytan，2011年）。从总SGD（包括新鲜和再循环的海水）向海洋的氮和磷的漏气估计在全球范围内超过了河流输入（Cho等，2018）。SGD介导的养分流可以显着影响沿海生态系统和水质，改变溶解和气态代谢物的水平，包括铵，甲烷和氢硫酸盐（Bernard等人，2014年； Santos等，2014; Santos等，2021，2021;Schlüter等。）。在这些特定位置，这种影响微生物群落及其代谢活性（Purkamo等，2022）。与地下环境类似，深海沉积物的特征也具有光合产生的不稳定有机碳（Chen等，2023）。因此，地下水微生物已经制定了多种策略，以确保生存和持久性。在这些策略中，能够利用岩石，同种有机碳或有机污染物降解的副产品中使用古老的有机碳（Griebler和Lueders，2009; Smith等，2015）。其他地下水微生物也具有适应性的适应性，可以通过利用诸如亚硝酸盐，铵，减少铁和硫化合物的氧化能量来固定无机碳（Ruiz-González等，2021）。
平台合作社的分类学
抽象平台合作社正在成为传统合作社的新数字组织形式，并作为零工经济背后的大型技术平台的替代品。尽管它们快速增长，但目前对平台合作社的研究仍然很少。本文旨在使用理论上且经过经验验证的分类学发展方法来开发平台合作社的系统分类法，该方法通过数据可视化和集群分析扩展。由此产生的八种原型表明，平台合作社不仅有助于更具道德的共享经济，而且为演出和其他行业的其他工人提供了新的机会。平台合作社还正在探索知识经济中的新机会，例如以数据共享为中心的合作业务模型以及通过相互支持和协作创建平台合作生态系统。这些发现有助于建立必要的基础，以进一步研究平台合作社以及专注于道德共享/零工经济的企业家实践。
基因组学如何彻底改变分类学，
基因组中包含的信息对于我们植物病理学家来说是一座金矿，使我们能够改进诊断方法并寻找与流行病学和植物-微生物相互作用有关的特征，以及它们背后的进化过程。2022 年是《自然》杂志上发表的前两个黄单胞菌全基因组序列（da Silva 等人，2002 年）的 20 周年。十年后，我加入了黄单胞菌社区，致力于宿主适应性研究，这篇出版物是我阅读的第一篇黄单胞菌论文之一。这项工作的一个核心方面是比较两种黄单胞菌致病变种，即柑橘致病菌黄单胞菌和油菜致病菌黄单胞菌，它们分别对柑橘和十字花科植物具有致病性。这种方法使作者能够识别菌株特异性基因并提出可能解释不同宿主特异性和致病过程的机制，这是我们社区中的两个热点问题（Harris 等人，2020 年；Jacques 等人，2016 年）。这种比较基因组学分析在许多方面都具有开创性，下一个黄单胞菌基因组花了三年多的时间才发表。几年后，随着越来越快、越来越便宜的测序技术的出现，全基因组测序“民主化”了（Zhao & Grant，2011 年），很快导致每年发布几十个，然后是几百个黄单胞菌基因组序列（图 1）。
基因组学如何彻底改变分类学
基因组中包含的信息对于我们植物病理学家来说是一座金矿，使我们能够改进诊断方法并寻找与流行病学和植物-微生物相互作用有关的特征，以及它们背后的进化过程。2022 年是《自然》杂志上发表的前两个黄单胞菌全基因组序列（da Silva 等人，2002 年）的 20 周年。十年后，我加入了黄单胞菌社区，致力于宿主适应性研究，这篇出版物是我阅读的第一篇黄单胞菌论文之一。这项工作的一个核心方面是比较两种黄单胞菌致病变种，即柑橘黄单胞菌和油菜黄单胞菌，它们分别对柑橘和十字花科植物具有致病性。这种方法使作者能够识别菌株特异性基因，并提出可能解释不同宿主特异性和致病过程的机制，这是我们社区的两个热点问题（Harris 等人，2020 年；Jacques 等人，2016 年）。这种比较基因组学分析在许多方面都具有开创性，下一个黄单胞菌基因组花了三年多的时间才发表。几年后，随着越来越快、越来越便宜的测序技术的出现，全基因组测序“民主化”了（Zhao & Grant，2011 年），很快导致每年发布几十个，然后是几百个黄单胞菌基因组序列（图 1）。
综合分类学和系统发育学...
生物多样性在维持生态平衡、提供食物和支持全球生计方面发挥着至关重要的作用。印度是生物多样性极其丰富的国家之一，拥有大量特有物种。水生生物多样性，尤其是渔业资源，至关重要，因为它提供富含蛋白质的食物、维持生计并产生外汇。然而，由于人为因素导致的生物多样性下降令人担忧。综合分类学结合了传统方法和分子方法，彻底改变了分类学领域。基于形态特征的传统分类学历来支撑着我们对物种多样性的理解。然而，它有时会遇到表型可塑性等问题，即生物体的外观在不同环境条件下差异很大。过去三十年发展起来的 DNA 条形码等分子技术弥补了传统方法的不足，解决了分类模糊性问题，揭示了隐秘物种，揭示了形态学方法可能遗漏的进化关系。尽管印度拥有多样化的农业气候区，并且是一个生物多样性大国，但其生物多样性中只有不到一半得到了分子水平的表征。新一代测序等先进方法现在可以直接从环境样本中识别物种，增强了我们全面监测生物多样性的能力。培训计划“综合分类学和系统发育学”专门为让研究人员了解传统和基于 DNA 序列的物种划界技术的强大组合而设计。这种综合方法对于准确编目印度丰富的生物多样性和实施有效的保护战略至关重要。
微生物分类学中的表征
系统发生学是研究不同生物群体之间的进化关系。我们可能永远无法知道生命的真正起源，但您将在本单元中学习的分类方法是确定一组生物共同起源的重要工具。由于获得纯微生物培养物的限制，传统的通过研究形态特征来确定祖先层面的亲缘关系的方法并不总是适用于微生物。随着技术的进步，分子序列（DNA、RNA 和蛋白质）的可用性彻底改变了这些研究。人们认为这些序列就像“分子钟”，随着时间的推移而进化，保存了生存的关键信息。1965 年，Zuckerkandl 和 Pauling 首次提出了核酸和蛋白质序列随时间变化的概念，可以将其视为分子计时器。据推测，这些变化会随着时间的推移而增加，但本质上是中性的，因此蛋白质仍然具有功能性。如果两个生物群体中两个相似分子的序列完全不同，则意味着这两个群体很久以前就已经彼此分化了。因此，这些分子序列可以作为了解不同生物之间系统发育关系的丰富而可靠的信息来源。
惊喜定义的分类学-Infoscience
令人惊讶的事件触发了可衡量的大脑活动，并通过影响学习，记忆和决策来影响人类行为。当前，关于惊喜的定义尚无共识。在这里，我们在统一框架中确定了18个惊喜的数学定义。我们首先根据对代理人的信念的依赖，展示它们如何相互联系，并在什么条件下证明它们是无法区分的，将这些定义的技术分类分为三组。超出了此技术分析，我们提出了一个惊喜定义的分类法，并根据它们衡量的数量将它们分为四个概念类别：（i）“预测惊喜”衡量预测与观察之间的不匹配； （ii）“变更点检测惊喜”衡量了环境变化的可能性； （iii）“信心校正的惊喜”明确说明了信心的影响； （iv）“信息获得惊喜”衡量了对新观察的信念更新。分类学为大脑中功能作用和生理特征的原则研究奠定了基础。©2022作者。由Elsevier Inc.出版这是CC下的开放访问文章（http://creativecommons.org/licenses/4.0/）。
定量研究实践的分类学
MerjaKytö，Uppsala University Kate Yaw，南佛罗里达大学玛格丽特·伍德大学，北亚利桑那大学摘要，越来越多的研究已经开始解决应用语言学的伦理问题（例如，de Costa，2016年； Isbell等，2022年）。 这一探究线固有的信息之一是，从研究概念化到实现，传播，应用和更远的整个研究周期中，道德问题是嵌入的（请参阅Bernstein等人，本卷）。 考虑到了这一问题，本研究试图对通常称为“可疑研究实践”的分类法进行分类和开发分类法（QRP； Steneck，2006年），并在进行定量应用语言学研究中发挥作用。 这些习惯包括选择性报告和掩盖方法学细节以限制批评的做法。 使用在邻近学科中开发的现有分类法作为起点（例如，塔格尼安等人，2019年），我们采用了Delphi方法来以专家小组以及同伴学者的迭代方式以迭代方式引起对潜在QRP的反应。 这些数据的分析导致了特定领域的分类法，该分类学为大规模调查奠定了基础，该调查评估了伦理问题的流行和感知的严重程度和QRP，在定量应用语言学研究中特别发现（Larsson等，2023）。 结果也用于为应用语言学和相关学科研究伦理学方法学培训提供材料（参见De Costa等，2021； Wood等，2024，印刷中）。MerjaKytö，Uppsala University Kate Yaw，南佛罗里达大学玛格丽特·伍德大学，北亚利桑那大学摘要，越来越多的研究已经开始解决应用语言学的伦理问题（例如，de Costa，2016年； Isbell等，2022年）。这一探究线固有的信息之一是，从研究概念化到实现，传播，应用和更远的整个研究周期中，道德问题是嵌入的（请参阅Bernstein等人，本卷）。考虑到了这一问题，本研究试图对通常称为“可疑研究实践”的分类法进行分类和开发分类法（QRP； Steneck，2006年），并在进行定量应用语言学研究中发挥作用。这些习惯包括选择性报告和掩盖方法学细节以限制批评的做法。使用在邻近学科中开发的现有分类法作为起点（例如，塔格尼安等人，2019年），我们采用了Delphi方法来以专家小组以及同伴学者的迭代方式以迭代方式引起对潜在QRP的反应。这些数据的分析导致了特定领域的分类法，该分类学为大规模调查奠定了基础，该调查评估了伦理问题的流行和感知的严重程度和QRP，在定量应用语言学研究中特别发现（Larsson等，2023）。结果也用于为应用语言学和相关学科研究伦理学方法学培训提供材料（参见De Costa等，2021； Wood等，2024，印刷中）。
植物的生物多样性和分类学
植物生物多样性和分类学领域的MSC计划是自1992年以来一直在运行的良好课程。它是由于皇家植物园爱丁堡（RBGE）的独特伙伴关系，这是一个领先的分类研究与植物保护中心与世界顶尖大学之一的爱丁堡大学（UOE）之间的独特伙伴关系。植物园的设置非常适合该计划的目的，在提供非凡的生活和植物标本室，综合图书馆，实验室空间以及全球范围的专业知识。rbge具有独特的学习环境，强大的教育部门将科学与园艺联系起来。在爱丁堡充满活力的城市时，在RBGE学习生物多样性是对植物着迷的人们的极好机会。