T 细胞急性淋巴细胞白血病 (T-ALL) 和 T 细胞淋巴细胞淋巴瘤 (T-LBL) 是罕见的侵袭性血液系统恶性肿瘤。目前的治疗包括强化化疗,总生存率为 80%,但伴有严重的毒副作用。此外,10-20% 的患者仍死于复发或难治性疾病,这为更具体、更有针对性和毒性更低的治疗策略提供了强有力的理由。在这里,我们报告了 T-LBL 患者中的一种新型 MYH9::PDGFRB 融合,并证明这种融合产物具有组成活性,足以在体外和体内驱动致癌转化。将我们的分析更广泛地扩展到 T-ALL,我们发现一个 T-ALL 细胞系和多个患者来源的异种移植模型在没有融合的情况下具有 PDGFRB 过度活化,TLX3 和 HOXA T-ALL 分子亚型中 PDGFRB 表达较高。为了针对这种 PDGFRB 过度激活,我们评估了选择性 PDGFRB 抑制剂 CP-673451 在体外和体内的治疗效果,并证明了受体过度激活时的敏感性。总之,我们的工作表明,PDGFRB 的过度激活是 T-ALL/T-LBL 的致癌驱动因素,并且筛查 T-ALL/T-LBL 患者的磷酸化 PDGFRB 水平可以作为 PDGFRB 抑制的生物标志物,作为其治疗方案中的一种新型靶向治疗策略。
摘要 目前,颅内动脉瘤的治疗仅限于侵入性手术和血管内治疗,而有些动脉瘤无法通过这些方法治疗。识别和靶向参与动脉瘤发病机制的特定分子通路可能会改善预后。癌症相关基因中发现的低频体细胞变异与颅内动脉瘤的发展有关。特别是,PDGFRB 基因突变会导致组成性激活的 ERK 和核因子 κ B 信号通路,酪氨酸激酶抑制剂可以针对这些通路进行治疗。在这篇综述中,我们描述了致癌基因和其他基因中的低频体细胞变异如何影响动脉瘤发展的发病机制,重点关注基因治疗应用,例如血管内原位输送化疗药物。
能够自我更新和多能分化的骨骼干细胞(SSC)有助于骨发育和稳态。已经报道了不同骨骼部位的几个SSC人群。在这里,我们确定了一个形而上的SSC(MPSSC)种群,其转录景观与其他骨间充质基质细胞(BMSC)不同。这些MPSSC由位于生长板下方的SSTR2或PDGFRB + KITL-标记,仅源自肥厚的软骨细胞(HCS)。这些hc衍生的MPSSC具有体外和体内自我更新和多能量的特性,在产后产生大多数HC后代。HC特异性缺失,这是运输所需的内体分选复合物的一个组成部分,会损害HC-TO-MPSSC转换并损害小梁骨的形成。因此,MPSSC是骨髓中BMSC和成骨细胞的主要来源,支持产后小梁骨形成。
最近在亲戚家族中报道了一种纯合废话PCDH12变体,该杂志中受影响的儿童患有先天性小头畸形,癫痫病和严重的全球发育障碍。1胎儿MRI和USG在中脑 - 高层丘脑 - 光学区域和过度教育性perithalamic Foci中显示出发育不良的伸长肿块。PCDH12概述了一种与膜物理稳定性,粘附和脉管系统维持相关的原粘蛋白,并最近被指出为原发性家族性脑钙化(PFBC)的候选基因。pFBC的特征是在没有次要原因的情况下,存在主要影响基底神经节的钙化。2临床表现包括运动障碍,认知障碍,精神障碍和头痛,在成年期间最常开始。在4个基因中鉴定出多达50%的家族的常染色体显性pfbc的2,3杂合变体在4个基因中鉴定出:SLC20A2,PDGFRB,PDGFB和XPR1。4 - 8我们先前搜索具有类似于PFBC Major
可操作基因在预测索拉非尼疗效中的作用。方法:通过定量实时逆转录 PCR,我们分析了 220 例接受索拉非尼治疗的 HCC 患者的肿瘤与非癌组织中 7 种可操作基因( VEGFR2 、 PDGFRB 、 c-KIT 、 c-RAF 、 EGFR 、 mTOR 和 FGFR1 )的表达水平。我们的分析发现,与无反应者相比,9 名反应者并没有独特的临床特征。受试者操作特征曲线评估了根据可操作基因计算的治疗效益评分 (TBS) 的预测性能。结果:反应者的 TBS 值明显高于无反应者。曲线下面积为 0.779,mTOR 与 VEGFR2 、 c-KIT 和 c-RAF 相结合的 TBS 是索拉非尼疗效的最显著预测因子。索拉非尼单独使用时,HCC 患者的反应率为 0.7–3%,但当根据可操作基因对患者进行分层时,肿瘤反应率上升至 15.6%。此外,可操作基因表达与肿瘤反应显着相关。结论:我们根据可操作分子亚型对患者进行分层的研究结果可能为提高索拉非尼治疗 HCC 的有效性提供一种治疗策略。
Oncomine Comprehensive Assay v3 DNA 组:AKT1、AKT2、AKT3、ALK、AR、ARAF、ARID1A、ATM、ATR、ATRX、AXL、BAP1、BRAF、BRCA1、BRCA2、BTK、CBL、CCND1、CCND2、CCND3、CCNE1、CDK12、CDK2、CDK4、CDK6、CDKN1B、CDKN2A、CDKN2B、CHEK1、CHEK2、CREBBP、CSF1R、CTNNB1、DDR2、EGFR、ERBB2、ERBB3、ERBB4、ERCC2、ESR1、EZH2、FANCA、FANCD2、FANCI、FBXW7、FGF19、FGF3、FGFR1、FGFR2、FGFR3、FGFR4、FLT3、 FOXL2、GATA2、GNA11、GNAQ、GNAS、H3-3A、HIST1H1E、HNF1A、HRAS、IDH1、IDH2、IGF1R、JAK1、JAK2、JAK3、KDR、KIT、KNSTRN、KRAS、MAGOH、MAP2K1、MAP2K2、MAP2K4、MAPK1、MAX、MDM2、 MDM4、MED12、MET、MLH1、MRE11A、MSH2、MSH6、MTOR、MYC、MYCL、MYCN、MYD88、NBN、NF1、NF2、NFE2L2、NOTCH1、NOTCH2、NOTCH3、NRAS、NTRK1、NTRK2、NTRK3、PALB2、PDGFRA、PDGFRB、PIK3CA、 PIK3CB, PIK3R1、PMS2、POLE、PPARG、PPP2R1A、PTCH1、PTEN、PTPN11、RAC1、RAD50、RAD51、RAD51B、RAD51C、RAD51D、RAF1、RB1、RET、RHEB、RHOA、RICTOR、RNF43、ROS1、SETD2、SF3B1、SLX4、SMAD4、SMARCA4、SMARCB1、SMO、SPOP、SRC、STAT3、STK11、TERT、TOP1、TP53、TSC1、TSC2、U2AF1、XPO1
cuproptosis是一种新发现的编程细胞死亡形式,在肿瘤的发生和发育中起着至关重要的作用。然而,库妥刺作在膀胱癌肿瘤微环境中的作用尚不清楚。在这项研究中,我们开发了一种预测预后结果并指导膀胱癌患者的治疗选择的方法。我们从癌症基因组图集数据库和基因表达综合数据库中获得了1001个样品和生存数据点。使用与先前研究中鉴定的与库相关的基因(CRG)进行了分析,我们分析了CRG转录变化并鉴定了两个分子亚型,即高危患者和低危患者。确定了八个基因的预后特征(PDGFRB,COMP,GREM1,FRRS1,SDHD,RARRES2,CRTAC1和HMGCS2)。CRG分子打字和风险评分与临床病理学特征,预后,肿瘤微环境细胞的培养特征,免疫检查点激活,突变负担和化学疗法药物敏感性相关。此外,我们构建了一个准确的列图,以提高CRG_SCORE的临床适用性。QRT-PCR用于检测膀胱癌组织中八个基因的表达水平,结果与预测的结果一致。这些发现可能有助于我们了解昆虫在癌症中的作用,并为设计个性化治疗和预测膀胱癌患者的生存结果的新方向提供了新的方向。
在没有全身性钙和磷酸盐失衡的情况下,基底神经节中脑微血管的抽象钙化是原发性家族性脑钙化(PFBC)的标志,这是一种罕见的神经退行性疾病。在钠依赖性磷酸磷酸转运蛋白2(SLC20A2),异形和多层逆转录病毒受体1(XPR1),血小板衍生的生长因子B(PDGFB),血小板生长因子受体β(PDGFRB),脑质量发生的gylasise(PDGFB)的基因(pDGFB),脑料beta和脑电图调节(XPR1)的反应(PDGFB)调节gycose(pDGFB),已知分子2(JAM2)引起PFBC。 XPR1的功能丧失突变是Meta-Zoans中唯一已知的无机磷酸盐出口剂,引起了主要遗传的PFBC,但在2015年首次报道,但到目前为止,在大脑中,尚无研究的研究是否尚未解决一种功能等位基因的损失,是否导致一种常用的生物体(一种对人类疾病模拟人类疾病的常用生物体)的病理学改变。 在这里我们表明,用于XPR1的小鼠(XPR1 WT/LACZ)的杂合子存在脑脊液中的无机磷酸盐水平,以及丘脑中血管钙化的年龄和性别依赖性生长。 血管钙化被血管基底膜包围,位于平滑肌层的小动脉。 与先前特征的PFBC小鼠模型相似,XPR1 WT/LACZ小鼠中的血管钙化含有骨基质蛋白,并被反应性星形胶质细胞和小胶质细胞包围。 但是,小胶质细胞激活不仅限于钙化血管,而是显示出广泛的存在。 除了血管钙化外,我们还观察到血管在钠依赖性磷酸磷酸转运蛋白2(SLC20A2),异形和多层逆转录病毒受体1(XPR1),血小板衍生的生长因子B(PDGFB),血小板生长因子受体β(PDGFRB),脑质量发生的gylasise(PDGFB)的基因(pDGFB),脑料beta和脑电图调节(XPR1)的反应(PDGFB)调节gycose(pDGFB),已知分子2(JAM2)引起PFBC。XPR1的功能丧失突变是Meta-Zoans中唯一已知的无机磷酸盐出口剂,引起了主要遗传的PFBC,但在2015年首次报道,但到目前为止,在大脑中,尚无研究的研究是否尚未解决一种功能等位基因的损失,是否导致一种常用的生物体(一种对人类疾病模拟人类疾病的常用生物体)的病理学改变。在这里我们表明,用于XPR1的小鼠(XPR1 WT/LACZ)的杂合子存在脑脊液中的无机磷酸盐水平,以及丘脑中血管钙化的年龄和性别依赖性生长。血管钙化被血管基底膜包围,位于平滑肌层的小动脉。与先前特征的PFBC小鼠模型相似,XPR1 WT/LACZ小鼠中的血管钙化含有骨基质蛋白,并被反应性星形胶质细胞和小胶质细胞包围。但是,小胶质细胞激活不仅限于钙化血管,而是显示出广泛的存在。除了血管钙化外,我们还观察到血管
尽管在过去几十年中取得了巨大进步,但治疗失败仍然是抗癌疗法的重大负担。肿瘤细胞倾向于通过克隆进化和抗性亚克隆的选择来逃避化疗,从而导致治疗复发。下一代测序旨在找到耐药性癌细胞串扰中有希望的候选变异。这种方法可能进一步有助于分子肿瘤板适应每个患者的靶向治疗方案(1)。髓增生性综合征慢性髓样白血病(CML)成为有效且成功的靶向治疗的榜样。cml是一种罕见的肿瘤,主要是由相互易位t(9; 22)(q34; q11)引起的,导致BCR :: ABL1融合基因的形成(2)。在许多情况下,它通过酪氨酸激酶抑制剂(TKI)成功治疗,尤其是与BCR :: ABL1激酶结合的2-苯基氨基嘧啶伊替尼,从而预防了下游靶标的磷酸化(3)。尽管总体10年生存率为83%,但在治疗的五年内,所有患者中有20%至25%遭受治疗衰竭(4,5)。第二代和第三代TKI,即尼洛替尼,达沙替尼,鲍苏替尼和庞替尼,开发了以可变成功的变化(6,7)克服这种抗药性(6,7)。TKI抗性发生在依赖性或独立于BCR :: ABL1激酶改变。第一个提及的主要是由BCR :: abl1中的突变引起的,例如ABL1 p。(Tyr253His),p。(GLU255VAL)或p。(THR315ile))防止TKIS与BCR或BCR expristion TKIS结合,以防止TKIS与BCR :: ABCR1 anbl1 anbl1 and anbl1 and anbl1fination and Overection(8)。对于BCR :: ABL1-独立抵抗力,讨论了几种机制,例如,药物过表达EF ef lox top子转运蛋白,尤其是ATP结合盒(ABC)转运蛋白转运蛋白家族成员P-糖蛋白(P-GP,P-GP,ABCB1)或乳腺癌抗癌蛋白(BCRP,ABCG2)的传播(abcg2)的demaption(p-gp,abcb1),abcg2 abcg2 ryaption(abcg2)。 10)。此外,显示遗传像差,例如第8条或影响RUNT相关转录因子1(RUNX1)的突变,显示出患者中爆炸危机或抗TKI耐药性克隆的进展(11,12)。除了临床研究外,体外模型还可以详细研究耐药性的机理。这样的模型是关键工具,因为这些模型从这些模型中得出的发现被成功地转化为诊所,例如预测药物效率并改善治疗方案(13)。可以通过暴露于缓慢增加抗癌药物浓度或通过脉冲治疗来获得肿瘤细胞系的耐药性。 在这里,我们使用外显子组测序在体外模型中研究TKI抗性CML中的遗传变异。 为此,我们建立了伊马替尼和尼洛替尼抵抗的生物学重复。 我们报告了伊马替尼和尼洛替尼抗性发展中演变的序列变体。 此外,我们研究了候选变体PTPN11 p。(Tyr279Cys),PDGFRB p。(GLU578GLN)和NRAS p。(GLN61LYS)对TKI治疗的反应的影响。可以通过暴露于缓慢增加抗癌药物浓度或通过脉冲治疗来获得肿瘤细胞系的耐药性。在这里,我们使用外显子组测序在体外模型中研究TKI抗性CML中的遗传变异。为此,我们建立了伊马替尼和尼洛替尼抵抗的生物学重复。我们报告了伊马替尼和尼洛替尼抗性发展中演变的序列变体。此外,我们研究了候选变体PTPN11 p。(Tyr279Cys),PDGFRB p。(GLU578GLN)和NRAS p。(GLN61LYS)对TKI治疗的反应的影响。
MAPK和JAK/STAT途径的种族特异性分子变化早期发作结直肠癌Cecilia Monge,M.D.,M.P.H.,F.A.C.P.1,Brigette Waldrup,B.S。 2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *通讯:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:早期发作的结直肠癌(EOCRC),定义为50岁之前诊断为结直肠癌(CRC)的发病率,尤其是在西班牙裔/拉丁裔(H/L)种群中。 尽管这种趋势,但驱动EOCRC差异的潜在分子机制仍然很少理解。 MAPK和JAK/STAT途径在肿瘤进展,增殖和治疗反应中起关键作用;但是,它们参与特定于种族的EOCRC差异尚不清楚。 本研究旨在表征EOCRC患者MAPK和JAK/STAT途径基因的分子改变,重点是H/L和非西班牙裔白人(NHW)患者之间的差异。 此外,我们评估了这些特定途径的变化是否有助于H/L EOCRC患者的生存结果。 方法:我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析,以评估MAPK和JAK/STAT途径基因中的突变频率。 该研究中总共包括3,412例患者,包括302 h/L的患者和3,110名NHW患者。1,Brigette Waldrup,B.S。2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。 2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *通讯:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:早期发作的结直肠癌(EOCRC),定义为50岁之前诊断为结直肠癌(CRC)的发病率,尤其是在西班牙裔/拉丁裔(H/L)种群中。 尽管这种趋势,但驱动EOCRC差异的潜在分子机制仍然很少理解。 MAPK和JAK/STAT途径在肿瘤进展,增殖和治疗反应中起关键作用;但是,它们参与特定于种族的EOCRC差异尚不清楚。 本研究旨在表征EOCRC患者MAPK和JAK/STAT途径基因的分子改变,重点是H/L和非西班牙裔白人(NHW)患者之间的差异。 此外,我们评估了这些特定途径的变化是否有助于H/L EOCRC患者的生存结果。 方法:我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析,以评估MAPK和JAK/STAT途径基因中的突变频率。 该研究中总共包括3,412例患者,包括302 h/L的患者和3,110名NHW患者。2,Francisco G. Carranza博士2和恩里克·韦拉斯克斯·维尔雷尔(Enrique Velazquez-Villarreal),医学博士,博士,M.P.H。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。 2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。 3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。 *通讯:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:早期发作的结直肠癌(EOCRC),定义为50岁之前诊断为结直肠癌(CRC)的发病率,尤其是在西班牙裔/拉丁裔(H/L)种群中。 尽管这种趋势,但驱动EOCRC差异的潜在分子机制仍然很少理解。 MAPK和JAK/STAT途径在肿瘤进展,增殖和治疗反应中起关键作用;但是,它们参与特定于种族的EOCRC差异尚不清楚。 本研究旨在表征EOCRC患者MAPK和JAK/STAT途径基因的分子改变,重点是H/L和非西班牙裔白人(NHW)患者之间的差异。 此外,我们评估了这些特定途径的变化是否有助于H/L EOCRC患者的生存结果。 方法:我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析,以评估MAPK和JAK/STAT途径基因中的突变频率。 该研究中总共包括3,412例患者,包括302 h/L的患者和3,110名NHW患者。2,3 * 1贝塞斯达医学博士国家癌症研究所的癌症研究中心。2希望城市,贝克曼研究所,综合翻译科学系,杜阿尔特,加利福尼亚州。3希望之城综合癌症中心,加利福尼亚州杜阿尔特。*通讯:evelazquezvilla@coh.org摘要背景/目标:早期发作的结直肠癌(EOCRC),定义为50岁之前诊断为结直肠癌(CRC)的发病率,尤其是在西班牙裔/拉丁裔(H/L)种群中。尽管这种趋势,但驱动EOCRC差异的潜在分子机制仍然很少理解。MAPK和JAK/STAT途径在肿瘤进展,增殖和治疗反应中起关键作用;但是,它们参与特定于种族的EOCRC差异尚不清楚。本研究旨在表征EOCRC患者MAPK和JAK/STAT途径基因的分子改变,重点是H/L和非西班牙裔白人(NHW)患者之间的差异。此外,我们评估了这些特定途径的变化是否有助于H/L EOCRC患者的生存结果。方法:我们使用公开可用的CRC数据集进行了生物信息学分析,以评估MAPK和JAK/STAT途径基因中的突变频率。该研究中总共包括3,412例患者,包括302 h/L的患者和3,110名NHW患者。患者按年龄分层(EOCRC:<50岁,晚期结直肠癌 - locrc:≥50岁)和种族(H/L vs. NHW),以评估突变患病率的差异。卡方检验以比较组之间的突变率,并使用Kaplan-Meier生存分析来评估基于H/L和NHW EOCRC患者途径改变的总体生存差异。结果:比较H/L患者的EOCRC和LOCRC时,在MAPK途径相关基因中观察到显着差异。NF1 (11.6% vs. 3.7%, p = 0.01), ACVR1 (2.9% vs. 0%, p = 0.04), and MAP2K1 (3.6% vs. 0%, p = 0.01) were more prevalent in EOCRC, while BRAF mutations (18.3% vs. 5.1%, p = 9.1e-4) were significantly more frequent in LOCRC among H/L patients.此外,当将H/L患者的EOCRC与NHW患者的EOCRC进行比较时,关键MAPK途径基因(例如Akt1(5.1%vs. 1.8%vs. 1.8%,P = 0.03),MAPK3(3.6%,0.7%,P = 6.83E-3),NF1(11.6%vs. 6.1%,P = 0.0%,PD) = 0.02)在H/L EOCRC患者中显着富集。