本综述提供了两种主要类型器官之间的全面比较:诱导多能干细胞(IPSC)衍生的和成人干细胞(ASC)衍生(也称为患者衍生的器官,PDOS)。IPSC衍生的类器官,源自重编程的细胞,表现出显着的可塑性,可以建模各种组织和发育阶段。它们对于研究早期人类发展,遗传疾病和复杂疾病特别有价值。但是,诸如延长分化方案和成熟水平的可变性之类的挑战仍然是重大障碍。相比之下,直接由患者组织产生的ASC衍生的类器官,忠实地概括了组织特异性的特异性和疾病表型。这种保真度使它们对于个性化医学应用必不可少,包括药物筛查,疾病建模和理解个性化的治疗反应。
目的。癌症患者来源的类器官 (PDO) 在细胞外基质存在下生长为三维 (3D) 结构,并且已发现代表原始肿瘤的遗传复杂性。此外,与患者来源的异种移植模型相比,PDO 可以在更短的时间内生长并进行药物敏感性测试,并且费用更低。许多复发性卵巢癌患者会出现对化疗具有耐药性的恶性积液。由于这些患者经常接受腹水或胸腔积液的姑息抽吸,因此有可能获得存在于恶性积液中的多细胞球体 (MCS) 形式的肿瘤样本。我们的目标是在选择支持类器官生长的条件下开发卵巢癌恶性积液中 MCS 的短期培养物,并将其用作经验性药物敏感性测试的平台。方法。本研究从高级别浆液性卵巢癌 ( HGSOC ) 患者中收集恶性积液标本。回收 MCS 并置于支持类器官生长的培养条件下。在其中一部分标本中,在短期培养的两个时间点进行 RNA 测序,以确定转录组对培养条件的变化。还使用 Ki67 染色和组织学分析来表征这些标本中的类器官诱导。对所有标本进行了药物敏感性测试。结果。我们的模型描述了在原代培养数天内形成的类器官,它可以重现恶性腹水的组织学特征,并可以扩增至少 6 天。对四名患者标本的 RNA 测序分析表明,在培养 6 天内,与细胞增殖、上皮-间质转化和 KRAS 信号通路相关的基因显着上调。药物敏感性测试确定了几种具有治疗潜力的药物。结论。来自 HGSOC 恶性积液的 MCS 的短期类器官培养可用作经验性药物敏感性测试的平台。这些离体模型可能有助于在个性化治疗方案之前筛选新的或现有的治疗药物。© 2020 Elsevier Inc. 保留所有权利。
摘要 免疫疗法是一种很有前途的癌症治疗策略,它利用免疫细胞或药物激活患者自身的免疫系统并消灭癌细胞。该领域最令人兴奋的进展之一是针对新抗原,新抗原是源自非同义体细胞突变的肽,这些肽仅存在于癌细胞中,在正常细胞中不存在。虽然基于新抗原的治疗性疫苗尚未获得用于标准癌症治疗的批准,但早期临床试验已取得令人鼓舞的结果,作为独立的单一疗法或与检查点抑制剂联合使用。高通量测序和生物信息学的进展极大地促进了新抗原的精确和有效识别。因此,已经开发出针对每位患者的个性化新抗原疫苗,这些疫苗能够引发强大而持久的免疫反应,从而有效消除肿瘤并防止复发。本综述简要概述了基于新抗原的治疗性疫苗的最新临床进展,并讨论了这种创新方法面临的挑战和未来前景,特别强调了基于新抗原的治疗性疫苗在增强晚期实体瘤临床疗效方面的潜力。关键词免疫疗法;新抗原癌症疫苗;实体瘤;高通量测序;生物信息学;PDOs;AI;HLA;TCR
由癌症干细胞 (CSC) 驱动的患者来源肿瘤异种移植 (PDX)/类器官 (PDO) 被视为转化肿瘤学最具预测性的模型。人们已经创建了能够反映患者群体的大型 PDX 集合,并广泛用于测试各种研究疗法,包括作为体内替代对象的群体试验。PDO 被认为是适合高通量筛选 (HTS) 的患者的体外替代品。我们通过转换现有的 PDX 库建立了一个癌症 PDX 衍生类器官 (PDXO) 生物库,并证实了 PDXO 与亲本 PDX 在基因组学、组织病理学和药理学方面具有高度相似性,表明两者之间存在“生物等效性或可互换性”。我们在此展示了 PDXO 生物库在 HTS“矩阵”筛选中的应用,包括先导化合物和适应症、免疫细胞共培养用于免疫治疗以及工程化实现体外/体内成像。这个大型生物库包含 550 多个不同癌症的 PDX/PDXO 配对,可能成为未来癌症药物研发的有力工具。
,请查看我们的招聘政策所需的候选人将作为服务患者衍生的类器官(PDOS),鼠标和人类多能2D(单层)和3D(类器官)干细胞分化程序提供的角色,并将执行CRISPR/CAS9基因编辑服务。候选人将根据用户要求特定项目来设置特定的2D/3D差异化和基因编辑程序。候选人应具有准确的工作习惯,并成为一个好的团队成员。理想的候选人具有强大的多任务和以服务为导向的心态的能力。该职位涉及在一年中的一些周末和假期工作。单元组织工程设施是核心设施计划中的科学技术核心设施。组织工程单元的目标是为CRG,PRBB和外部研究人员提供干细胞生物学,干细胞分化,器官形成,诱导多能干细胞(IPSC)和CRISPR/CAS9基因编辑领域中使用的最新技术。它是8年前创建的,目的是帮助研究界进行干细胞和器官项目,以增加干细胞和类器官项目和应用的影响。该单元正在不断设置在上述字段中出现的新技术。我们想雇用谁?专业经验
抽象免疫疗法代表了一种有前途的癌症治疗策略,该策略利用免疫细胞或药物激活患者自己的免疫系统并消除癌细胞。该领域中最令人兴奋的进步之一是新抗原的靶向,新抗原是源自非同义体细胞突变的肽,这些肽仅在癌细胞中发现,而在正常细胞中不存在。尽管基于新抗原的治疗疫苗尚未获得标准癌症治疗的批准,但早期的临床试验却令人鼓舞地作为独立的单一疗法或与检查点抑制剂结合使用。在高通量测序和生物信息学中取得的进展极大地促进了新抗原的精确和有效鉴定。因此,开发了针对每位患者的个性化基于新抗原的疫苗,能够引起强大而持久的免疫反应,从而有效消除肿瘤并防止复发。本综述提供了一个简洁的概述,巩固了基于新抗原的治疗疫苗的最新临床进展,还讨论了这种创新方法的挑战和未来观点,尤其是强调了基于新抗原的治疗疫苗的潜力,以增强临床对抗固体肿瘤的临床自面性。关键词免疫疗法;新抗原癌疫苗;实体瘤;高通量测序;生物信息学; pdos;人工智能; hla; TCR
摘要。随着对高级反应堆,关键性安全性和屏蔽应用的热中子散射数据的兴趣,评估新材料或先前评估材料的重新评估(或验证)需要新的实验数据。在三步过程中评估了新的实验数据:(1)计算声子特征,(2)从数据中计算动态结构因子(DSF),以及(3)使用实验设置来模拟实验数据。所有三个步骤都面临着挑战,从需要一般通用的材料模拟代码(可以计算Correponding DSF的处理代码)到测量数据的仪器 /梁线 /设施的详细布局。可以使用各种方法(分子动力学,密度功能理论等)计算材料的声子特征。),DSF的高实现计算和基于DSF的实验模拟对于评估的准确性至关重要。可以通过使用橡树岭国家实验室的散布中子源(SNS)开发的两个相应的代码系统来实现后两个步骤:(1)Oclimax,该程序,该程序可以计算DFT和MD模拟结果的动态结构因子,以及(2)McVine,Monte Carlo Neutron Carlo Neutron Ray-Neutrats设计的模拟实验。最近,在SNS的宽角式切碎机(ARC)和红杉仪器站测量聚乙烯和Yttrium氢化物。使用密度函数理论代码,剑桥串行总能包(Castep)来模拟这些实验,以计算其声音特征(特征值 /矢量和pdos),然后使用oclimax对其进行处理以产生DSF,并通过对MCVine的数据进行数量的量度,从而对每个仪器站产生DSF,并在每个仪器站进行了量子。与常规评估方法进行比较,将从Oclimax处理的散射数据与NJOY LEAPR模块处理的散射数据进行了比较,并且McVine模拟的结果与先前使用的简化光束线模型进行了比较。
摘要 高熵材料因其结构的复杂性和性能的优越性已被广泛证实是一种可能的先进电催化剂。人们已做出大量努力来模拟高熵催化剂的原子级细节,以提高自下而上设计先进电催化剂的可行性。在本综述中,首先,我们概述了基于密度泛函理论的各种建模方法的发展。我们回顾了用于模拟不同高熵电催化剂的密度泛函理论模拟的进展。然后,我们回顾了用于电催化应用的高熵材料模拟的进展。最后,我们展示了该领域的前景。缩写:HEMs:高熵材料;CCMs:成分复合材料;DFT:密度泛函理论;LDA:局部密度近似;GGA:广义梯度近似;VASP:维也纳从头算模拟软件包;ECP:有效核势; PAW:投影增强波势;VCA:虚拟晶体近似;CPA:相干势近似;SQS:特殊准随机结构;SSOS:小集有序结构;SLAE:相似的局部原子环境;HEA:高熵合金;FCC:面心立方;BCC:体心立方;HCP:六方密堆积;ORR:氧还原反应;OER:氧化物析出反应;HER:氢析出反应;RDS:限速步骤;AEM:吸附质析出机理;LOM:晶格氧氧化机理;HEOs:高熵氧化物;OVs:氧空位;PDOS:投影态密度;ADR:氨分解反应;NRR:氮还原反应;CO 2 RR:CO 2 还原反应;TMDC:过渡金属二硫属化物;TM:过渡金属; AOR:酒精氧化反应;GOR:甘油氧化反应;UOR:尿素氧化反应;HEI:高熵金属间化合物。
摘要:大肠癌(CRC)是全球与癌症相关死亡的主要原因之一。根据癌症干细胞(CSC)模型,高死亡率与转移性疾病直接相关,被认为是由结肠癌干细胞引发的。因此,早期鉴定那些处于转移高风险的患者对于改善治疗和患者预后至关重要。是一种新型的预后生物标志物,用于肿瘤进展和转移形成,独立于肿瘤阶段。我们先前显示MACC1参与癌症中的MACC1转基因小鼠模型的小鼠肠。但是,MACC1在人CSC中的表达和可能的含义仍然难以捉摸。在这里,我们探索了MACC1根据患者衍生的肿瘤类器官(PDOS),患者衍生的异种移植(PDXS)和人类CRC细胞系调节MACC1调节干性和与CSC相关的侵入性表型的分子机制。我们表明,来自PDO模型的CD44富集的CSC表现出明显更高的MACC1和LGR5水平,并且在免疫功能低下的小鼠中表现出更高的肿瘤性。同样,在PDO和PDX模型上进行的RNA测序显示ALDH1(+)CSC中的MACC1表达显着增加,突出了其参与癌症的参与。我们进一步显示了PDO模型中MACC1与CSC标记CD44,Nanog和LgR5的相关性以及已建立的细胞系。此外,MACC1增加了干细胞基因表达,克隆原性和球体形成。引人注目的是,我们表明MACC1作为转录因子与LGR5基因启动子结合,发现了久远的CSC标记LGR5作为MACC1使用的新型基本信号介质,以诱导人类CRC患者的CSC样性质。我们的体外发现得到了MACC1与CRC细胞系中LGR5的显着正相关以及CRC患者肿瘤的显着正相关。综上所述,这项研究表明转移诱导剂MACC1充当癌症干细胞相关的标记。针对MACC1的介入方法可能会改善结直肠癌患者的进一步靶向疗法,以消除CSC并防止癌症复发和远处转移形成。
针对急性髓样白血病和胃癌的METTL3靶向降解。Authors Kyubin Hwang *,1 , Juhyeon Bae *,1 , Yoo-Lim Jhe 1,2,3,4 , Jungmin Kim 1,2,3,4 , Jae-Ho Cheong 1,2,3,4,5 , Taebo Sim †,1,6 Contact information 1 Department of Biomedical Sciences, Graduate School of Medical Science, Brain Korea 21 Project, Yonsei University College of Medicine, 50 Yonsei-Ro,Seodaemun-Gu,首尔,韩国共和国03722,韩国首尔伊森大学医学院生物化学与分子生物学系。3韩国首尔大学医学院系统医学研究中心系统医学研究中心的慢性顽固性疾病。4韩国首尔大学医学院外科系。 5韩国首尔大学医学院生物医学系统信息学系。 6韩国首尔伊森大学医学院临床药物发现与发展系。 *同等贡献†相应的作者:tbsim@yuhs.ac摘要:累积证据揭示了甲基转移酶样3(METTL3)在多种癌症类型中的致癌作用,依赖或独立于其M 6 A甲基转移酶活性。 我们设计了针对METTL3并将KH12识别为有效的METTL3降解器的靶向蛋白水解嵌合体(Protac)。 在MOLM-13细胞上对Kh12的处理会导致METTL3的80%以上的降解,并以剂量,时间和泛素依赖性的方式,半最大降解浓度(DC 50)为220 nm。 此外,KH12逆转分化,并具有超过Molm-13细胞抑制剂的抗增殖作用。4韩国首尔大学医学院外科系。5韩国首尔大学医学院生物医学系统信息学系。6韩国首尔伊森大学医学院临床药物发现与发展系。 *同等贡献†相应的作者:tbsim@yuhs.ac摘要:累积证据揭示了甲基转移酶样3(METTL3)在多种癌症类型中的致癌作用,依赖或独立于其M 6 A甲基转移酶活性。 我们设计了针对METTL3并将KH12识别为有效的METTL3降解器的靶向蛋白水解嵌合体(Protac)。 在MOLM-13细胞上对Kh12的处理会导致METTL3的80%以上的降解,并以剂量,时间和泛素依赖性的方式,半最大降解浓度(DC 50)为220 nm。 此外,KH12逆转分化,并具有超过Molm-13细胞抑制剂的抗增殖作用。6韩国首尔伊森大学医学院临床药物发现与发展系。*同等贡献†相应的作者:tbsim@yuhs.ac摘要:累积证据揭示了甲基转移酶样3(METTL3)在多种癌症类型中的致癌作用,依赖或独立于其M 6 A甲基转移酶活性。我们设计了针对METTL3并将KH12识别为有效的METTL3降解器的靶向蛋白水解嵌合体(Protac)。在MOLM-13细胞上对Kh12的处理会导致METTL3的80%以上的降解,并以剂量,时间和泛素依赖性的方式,半最大降解浓度(DC 50)为220 nm。此外,KH12逆转分化,并具有超过Molm-13细胞抑制剂的抗增殖作用。此外,KH12显着抑制了各种胃癌(GC)细胞的生长,其中M 6 A非依赖性的Mettl3活性在肿瘤发生中起着至关重要的作用。在患者衍生的类器官(PDOS)中进一步证实了KH12的抗GC效应。这项研究强调了靶向降解的表面参考作者METTL3作为抗癌策略的治疗潜力。简介N 6-甲基腺苷(M 6 A)是在哺乳动物的内部mRNA上发现的最普遍的化学修饰。这种表演组修饰在调节基因表达,产生各种生理,发育或病理结局1-3中起着至关重要的作用。称为“作家”,“橡皮”和“读者”的三种蛋白质机制分别参与安装,删除和解释M 6 A A RNA修饰4。甲基转移酶样3(mettl3)最初被识别为M 6作者5。通过与甲基转移酶样14(Mettl14)形成稳定的复合物,Mettl3安装M 6 A