多梳抑制复合物 1 (PRC1) 强烈影响 3D 基因组组织,介导目标基因座的局部染色质压缩和聚集。几种 PRC1 亚基能够在体外通过液-液相分离形成生物分子凝聚物,并且在细胞中标记和过表达时也是如此。在这里,我们使用可以破坏液体状凝聚物的 1,6-己二醇来检查内源性 PRC1 生物分子凝聚物对 PRC1 结合基因座的局部和染色体范围聚集的作用。使用成像和染色质免疫沉淀,我们表明,PRC1 介导的目标基因组基因座(在不同长度范围内)的染色质压缩和聚集可以通过向小鼠胚胎干细胞中添加并随后去除 1,6-己二醇来可逆地破坏。多梳结构域和簇的解压缩和分散不能完全归因于 1,6-己二醇处理后染色质免疫沉淀检测到的 PRC1 占有率降低,因为添加 2,5-己二醇对结合有类似的影响,尽管这种酒精不会干扰 PRC1 介导的 3D 聚类,至少在亚兆碱基和兆碱基尺度上不会。这些结果表明 PRC1 分子之间的弱疏水相互作用可能在多梳介导的基因组组织中发挥作用。
新皮层发育的特征是神经祖细胞(NPC)膨胀,神经发生和胶片发生的顺序相。多肉体介导的表观遗传机制在调节发育过程中的谱系潜力中起着重要作用。PolyComb抑制复合物1(PRC1)的组成在哺乳动物中高度多样,并被介绍为有助于细胞命运的上下文调节。在这里,我们对规范PRC1.2/1.4和非典型PRC1.3/1.5的作用进行了并排比较,所有这些都在NSC的增生和分化中表达。我们发现NSC中PCGF2/4的缺失导致在神经发生和神经胶原型相期间,PCGF2/4的删除大大减少和改变谱系命运,而PCGF3/5则起了较小的作用。从机械上讲,编码干细胞和神经源性因子的基因由PRC1结合,并在PCGF2/4缺失时差异表达。因此,与非典型的PRC1相比,在扩散,神经源和神经胶原阶段的增殖,神经源和神经胶原阶段期间,规范性PRC1在NSC调节中起着更重要的作用,而不是不同的PRC1亚复合物在NSC调节中起着更重要的作用。
摘要。- 目的:肺腺癌(LUAD)是世界上最常见的罐头之一。细胞因子1(PRC1)的蛋白质调节剂在包括luad在内的几种癌症的肿瘤发生和发育中起作用。本研究的目的是评估LUAD中PRC1的特征,以便找到针对PRC1的潜在药物。材料和方法:我们使用COX分析了来自癌症基因组图集(TCGA)门户的RNA测序数据的LUAD患者的PRC1的预后价值。评估了PRC1和LUAD前的联系,吸烟突变计数,动力型和缺氧评分之间的联系。分析了LUAD中PRC1与肿瘤侵入肿瘤的免疫细胞之间的关系,并使用基因集富集分析(GSEA)研究与PRC1相关的生物学过程和信号途径。使用药物银行数据库和分子对接鉴定靶向PRC1的潜在药物。结果:LUAD中的PRC1表达显着增加。prc1可能是预测luad总体表现的预后生物标志物。PRC1表达也与癌症阶段和患者的吸烟史有关。PRC1与突变计数,非整倍性和缺氧得分呈正相关。它也与肿瘤浸润的免疫细胞,尤其是活化的肥大细胞有关。GSEA表明PRC1可能与细胞周期,细胞因子和p53信号通路相关。此外,发现fostamatinib是一种针对PRC1的药物。结论:PRC1可能对LUAD患者具有预后价值,并且相关 -
6 Riken综合医学科学中心发育遗传学实验室,1-7-22 Suehiro-Cho,Tsurumi-Ku,Yokohama,Kanagawa,Kanagawa 230-0045,日本。 摘要新皮层发育的特征是神经祖细胞(NPC)膨胀,神经发生和神经胶质发生的顺序相。 多肉体介导的表观遗传机制在调节发育过程中的谱系潜力中起着重要作用。 PolyComb抑制性复合物1(PRC1)的组成在哺乳动物中高度多样,并被认为有助于细胞命运的上下文特异性调节。 在这里,我们对规范PRC1.2/1.4和非典型的PRC1.3/1.5的作用进行了侧面副副作用,所有这些作用均在NSC增殖和分化中表达。 我们发现NSC中PCGF2/4的缺失导致在神经发生和神经胶原型相期间,PCGF2/4的删除大大减少和改变谱系命运,而PCGF3/5则起了较小的作用。 从机械上讲,编码干细胞和神经源性因子的基因由PRC1结合,并在PCGF2/4缺失时差异表达。 因此,与非典型PRC1相比,在增殖,神经源和神经胶原相比,在增殖,神经源和神经胶原阶段期间,规范PRC1在不同的PRC1亚复合体中有助于不同的阶段,而是在NSC调节中起着更重要的作用。 NPC增殖和的精确空间和时间调节6 Riken综合医学科学中心发育遗传学实验室,1-7-22 Suehiro-Cho,Tsurumi-Ku,Yokohama,Kanagawa,Kanagawa 230-0045,日本。摘要新皮层发育的特征是神经祖细胞(NPC)膨胀,神经发生和神经胶质发生的顺序相。多肉体介导的表观遗传机制在调节发育过程中的谱系潜力中起着重要作用。PolyComb抑制性复合物1(PRC1)的组成在哺乳动物中高度多样,并被认为有助于细胞命运的上下文特异性调节。在这里,我们对规范PRC1.2/1.4和非典型的PRC1.3/1.5的作用进行了侧面副副作用,所有这些作用均在NSC增殖和分化中表达。我们发现NSC中PCGF2/4的缺失导致在神经发生和神经胶原型相期间,PCGF2/4的删除大大减少和改变谱系命运,而PCGF3/5则起了较小的作用。从机械上讲,编码干细胞和神经源性因子的基因由PRC1结合,并在PCGF2/4缺失时差异表达。因此,与非典型PRC1相比,在增殖,神经源和神经胶原相比,在增殖,神经源和神经胶原阶段期间,规范PRC1在不同的PRC1亚复合体中有助于不同的阶段,而是在NSC调节中起着更重要的作用。NPC增殖和在新皮层,茎和祖细胞开发过程中的引入最初是增殖的,然后再依次引起注定到不同皮质层的神经元,然后产生星形胶质细胞和少突胶质细胞(Lodato&Arlotta,2015年,2015年; Qian等人,2000年)。
在有丝分裂过程中,纺锤体会发生形态和动态变化。它在后期开始时重组,此时反平行束 PRC1 积累并将中央纺锤体蛋白募集到中间区。人们对中央纺锤体在人类细胞中形态变化过程中的动态特性如何变化知之甚少。利用基因编辑,我们生成了从其内源性荧光位点表达 PRC1 和 EB1 的人类细胞,以量化其天然纺锤体分布和结合/解离周转。EB1 正末端追踪显示微管生长普遍减慢,而 PRC1 与其酵母直系同源物 Ase1 类似,与压缩的反平行微管重叠结合越来越强。 KIF4A 和 CLASP1 与中央纺锤体的结合更具动态性,但也显示出减慢的周转速度。这些结果表明,中央纺锤体在有丝分裂过程中逐渐变得更加稳定,这与最近在有丝分裂后期中央纺锤体中反向平行中区束形成的“捆绑、滑动和压缩”模型一致。
背景:透明细胞肾细胞癌(CCRCC)是肾癌的普遍和侵略性亚型,通常与转移和复发有关。鉴定CCRCC进展涉及的关键基因对于改善治疗策略和患者预后至关重要。方法:我们进行了大规模基因组CRISPR筛选,以使用DEPMAP数据库识别对CCRCC进展至关重要的基因。为了发现和验证,我们整合了来自癌症基因组图集(TCGA),GEO和NJMU-CCRCC临床群体的多摩学数据。进行了生物信息学分析,包括差异表达,途径富集和蛋白质 - 蛋白质相互作用网络分析,以阐明生物学功能。为了验证我们的发现,我们采用了免疫组织化学,QRT-PCR和各种细胞分析来研究PRC1在CCRCC中的作用。结果:CRISPR筛选将PRC1确定为一个关键基因,从DEPMAP数据库中的CCRCC组织中显着过表达。升高的PRC1表达与整体生存率差,疾病特异性生存和无进展间隔有关。在CCRCC细胞系中的沉默PRC1抑制细胞增殖,迁移和菌落形成。功能富集分析表明,PRC1参与了基本过程,例如细胞周期调节,有丝分裂和细胞因子。另外,PRC1表达与Wnt/β-蛋白途径的激活相关,这表明PRC1在肿瘤进展中起关键作用。结论:PRC1成为CCRCC的有希望的生物标志物和治疗靶标。升高的PRC1表达与预后不良有关,其抑制作用抑制了CCRCC细胞的增殖和迁移。我们的发现强调了PRC1在CCRCC进展中的关键作用,并强调了进一步研究其分子机制和治疗潜力的必要性。
多梳抑制复合物 1 和 2 (PRC1 和 2) 是发育基因可遗传抑制所必需的。导致哺乳动物多梳抑制表观遗传的顺式和反式因子尚不完全清楚。本文表明,在人类细胞中,异位诱导的最初活跃的发育基因的多梳沉默,而不是普遍表达的管家基因附近,在许多细胞分裂中是可遗传的。出乎意料的是,沉默在 PRC2 的胚胎外胚层发育 (EED) 亚基的 H3K27me3 结合口袋发生突变的细胞中是可遗传的,已知突变会破坏 H3K27me3 识别并导致 H3K27me3 丢失。这种遗传模式不太稳定,需要完整的 PRC2 和 PRC1 对 H2AK119ub1 的识别。我们的研究结果表明,Polycomb 沉默的维持对局部基因组环境敏感,并且可以由 PRC1 依赖的 H2AK119ub1 和 PRC2 介导,而不依赖于 H3K27me3 识别。
多细胞动物的摘要需要polycomb组蛋白的表观遗传抑制。后者在多种亚基X es中组装,其中两种,poly comb r ePressiv e comple x 1(pr c1)和poly comb r e:re atressiv e comple x 2(prc2),起作用,以抑制k e y de v e v elopmental基因。ho w pr c1和pr c2识别特定基因仍然是一个悬而未决的问题。在这里,我们报告了数百个DNA元素的鉴定,这些DNA元素将规范PRC1绑定到人类发育基因。我们使用该术语系列来描述在某些基因组部位在某些基因组部位显着存在的过程,尽管该复合物不太可能直接与DNA相互作用。详细的分析表明,与PRC1束缚相关的序列特征与F a v我们的PR C2结合的序列特征不同。t hrought the Genome,两种序列的特征是不同比例混合的,以产生一系列的DNA元素,这些元素的范围从主要是prc1或prc2到能够束缚这两种复合物的元素。新兴图片类似于果蝇的多梳子响应元件(PRES)对polycomb络合物的范式靶向,但可塑性是较高的。
E3 Sumo蛋白连接酶CBX4(CBX4)是PolyComb-抑制复合物1(PRC1)的关键组成部分,据报道调节与肿瘤生长,转移和血管生成有关的多种基因。然而,其在T细胞介导的抗肿瘤免疫中的作用仍然难以捉摸。为了阐明这个问题,我们生成了用CBX4的T细胞特异性缺失的小鼠。敲除小鼠的肿瘤生长增加。此外,它们的肿瘤锻炼淋巴细胞表现出受损的肿瘤坏死因子-Alpha(TNF-A)和干扰素 - 伽马(IFN-C)的产生,其程序性细胞死亡蛋白1(PD-1)水平升高。实际上,在基因敲除小鼠的所有主要的外围T细胞的主要子集中观察到了失调的PDCD1表达,响应于T细胞受体(TCR)刺激,敲除小鼠的所有主要子集都伴有功能缺陷。在支持CBX4和PD-1之间的直接联系时,CBX4过表达导致PDCD1表达的下调。表观遗传分析表明,CBX4的缺乏会导致PDCD1启动子的抑制性组蛋白修饰的积累减少(H3K27me3)。此外,抑制多孔抑制复合物1(PRC1)的E3连接酶活性或多孔反向反应复合物2(PRC2)的甲基转移酶活性恢复了CBX4转染的细胞中的PDCD1表达。累积地,这项研究揭示了CBX4在调节T细胞功能中的新功能,并扩展了我们对PDCD1表达的表观遗传控制的理解。
